GCC2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BBP

Ідентифікатори

Символи

GCC2, GCC185, RANBP2L4, REN53, GRIP and coiled-coil domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 612711 MGI: 1917547 HomoloGene: 45639 GeneCards: GCC2

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • мембрана • гіалоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• Golgi to plasma membrane protein transport • protein transport • microtubule anchoring • protein targeting to lysosome • retrograde transport, endosome to Golgi • late endosome to Golgi transport • regulation of protein exit from endoplasmic reticulum • microtubule organizing center organization • recycling endosome to Golgi transport • Golgi ribbon formation • protein localization to Golgi apparatus • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9648


70297

Ensembl


ENSG00000135968


ENSMUSG00000038039

UniProt


Q8IWJ2


Q8CHG3

RefSeq (мРНК)


NM_181453


NM_027375

RefSeq (білок)


NP_852118


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 108.45 – 108.51 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GCC2 (англ. GRIP and coiled-coil domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 684 амінокислот, а молекулярна маса — 195 910^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDLVQDGVA	SPATPGTGKS	KLETLPKEDL	IKFAKKQMML	IQKAKSRCTE
LEKEIEELRS	KPVTEGTGDI	IKALTERLDA	LLLEKAETEQ	QCLSLKKENI
KMKQEVEDSV	TKMGDAHKEL	EQSHINYVKE	IENLKNELMA	VRSKYSEDKA
NLQKQLEEAM	NTQLELSEQL	KFQNNSEDNV	KKLQEEIEKI	RPGFEEQILY
LQKQLDATTD	EKKETVTQLQ	NIIEANSQHY	QKNINSLQEE	LLQLKAIHQE
EVKELMCQIE	ASAKEHEAEI	NKLNELKENL	VKQCEASEKN	IQKKYECELE
NLRKATSNAN	QDNQICSILL	QENTFVEQVV	NEKVKHLEDT	LKELESQHSI
LKDEVTYMNN	LKLKLEMDAQ	HIKDEFFHER	EDLEFKINEL	LLAKEEQGCV
IEKLKSELAG	LNKQFCYTVE	QHNREVQSLK	EQHQKEISEL	NETFLSDSEK
EKLTLMFEIQ	GLKEQCENLQ	QEKQEAILNY	ESLREIMEIL	QTELGESAGK
ISQEFESMKQ	QQASDVHELQ	QKLRTAFTEK	DALLETVNRL	QGENEKLLSQ
QELVPELENT	IKNLQEKNGV	YLLSLSQRDT	MLKELEGKIN	SLTEEKDDFI
NKLKNSHEEM	DNFHKKCERE	ERLILELGKK	VEQTIQYNSE	LEQKVNELTG
GLEETLKEKD	QNDQKLEKLM	VQMKVLSEDK	EVLSAEVKSL	YEENNKLSSE
KKQLSRDLEV	FLSQKEDVIL	KEHITQLEKK	LQLMVEEQDN	LNKLLENEQV
QKLFVKTQLY	GFLKEMGSEV	SEDSEEKDVV	NVLQAVGESL	AKINEEKCNL
AFQRDEKVLE	LEKEIKCLQE	ESVVQCEELK	SLLRDYEQEK	VLLRKELEEI
QSEKEALQSD	LLEMKNANEK	TRLENQNLLI	QVEEVSQTCS	KSEIHNEKEK
CFIKEHENLK	PLLEQKELRD	RRAELILLKD	SLAKSPSVKN	DPLSSVKELE
EKIENLEKEC	KEKEEKINKI	KLVAVKAKKE	LDSSRKETQT	VKEELESLRS
EKDQLSASMR	DLIQGAESYK	NLLLEYEKQS	EQLDVEKERA	NNFEHRIEDL
TRQLRNSTLQ	CETINSDNED	LLARIETLQS	NAKLLEVQIL	EVQRAKAMVD
KELEAEKLQK	EQKIKEHATT	VNELEELQVQ	LQKQKKQLQK	TMQELELVKK
DAQQTTLMNM	EIADYERLMK	ELNQKLTNKN	NKIEDLEQEI	KIQKQKQETL
QEEITSLQSS	VQQYEEKNTK	IKQLLVKTKK	ELADSKQAET	DHLILQASLK
GELEASQQQV	EVYKIQLAEI	TSEKHKIHEH	LKTSAEQHQR	TLSAYQQRVT
ALQEECRAAK	AEQATVTSEF	ESYKVRVHNV	LKQQKNKSMS	QAETEGAKQE
REHLEMLIDQ	LKIKLQDSQN	NLQINVSELQ	TLQSEHDTLL	ERHNKMLQET
VSKEAELREK	LCSIQSENMM	MKSEHTQTVS	QLTSQNEVLR	NSFRDQVRHL
QEEHRKTVET	LQQQLSKMEA	QLFQLKNEPT	TRSPVSSQQS	LKNLRERRNT
DLPLLDMHTV	TREEGEGMET	TDTESVSSAS	TYTQSLEQLL	NSPETKLEPP
LWHAEFTKEE	LVQKLSSTTK	SADHLNGLLR	ETEATNAILM	EQIKLLKSEI
RRLERNQERE	KSAANLEYLK	NVLLQFIFLK	PGSERERLLP	VINTMLQLSP
EEKGKLAAVA	QGEEENASRS	SGWASYLHSW	SGLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Luke M.R., Kjer-Nielsen L., Brown D.L., Stow J.L., Gleeson P.A. (2003). GRIP domain-mediated targeting of two new coiled-coil proteins, GCC88 and GCC185, to subcompartments of the trans-Golgi network. J. Biol. Chem. 278: 4216—4226. PMID 12446665 DOI:10.1074/jbc.M210387200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
Houghton F.J., Chew P.L., Lodeho S., Goud B., Gleeson P.A. (2009). The localization of the Golgin GCC185 is independent of Rab6A/A' and Arl1. Cell. 138: 787—794. PMID 19703403 DOI:10.1016/j.cell.2009.05.048
Burguete A.S., Fenn T.D., Brunger A.T., Pfeffer S.R. (2008). Rab and Arl GTPase family members cooperate in the localization of the golgin GCC185. Cell. 132: 286—298. PMID 18243103 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.048

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIP and coiled-coil domain containing 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23218 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8IWJ2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.