GCM1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ODH

Ідентифікатори

Символи

GCM1, GCMA, hGCMa, glial cells missing homolog 1, glial cells missing transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603715 MGI: 108045 HomoloGene: 2702 GeneCards: GCM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of syncytium formation by plasma membrane fusion • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • branching involved in labyrinthine layer morphogenesis • astrocyte fate commitment • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • gliogenesis • regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development • cell differentiation involved in embryonic placenta development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8521


14531

Ensembl


ENSG00000137270


ENSMUSG00000023333

UniProt


Q9NP62


P70348

RefSeq (мРНК)


NM_003643


NM_008103

RefSeq (білок)


NP_003634


NP_032129

Локус (UCSC)

Хр. 6: 53.13 – 53.15 Mb

Хр. 9: 77.96 – 77.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GCM1 (англ. Glial cells missing homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 49 268^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPDDFDSED	KEILSWDIND	VKLPQNVKKT	DWFQEWPDSY	AKHIYSSEDK
NAQRHLSSWA	MRNTNNHNSR	ILKKSCLGVV	VCGRDCLAEE	GRKIYLRPAI
CDKARQKQQR	KRCPNCDGPL	KLIPCRGHGG	FPVTNFWRHD	GRFIFFQSKG
EHDHPKPETK	LEAEARRAMK	KVNTAPSSVS	LSLKGSTETR	SLPGETQSQG
SLPLTWSFQE	GVQLPGSYSG	HLIANTPQQN	SLNDCFSFSK	SYGLGGITDL
TDQTSTVDPM	KLYEKRKLSS	SRTYSSGDLL	PPSASGVYSD	HGDLQAWSKN
AALGRNHLAD	NCYSNYPFPL	TSWPCSFSPS	QNSSEPFYQQ	LPLEPPAAKT
GCPPLWPNPA	GNLYEEKVHV	DFNSYVQSPA	YHSPQEDPFL	FTYASHPHQQ
YSLPSKSSKW	DFEEEMTYLG	LDHCNNDMLL	NLCPLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Akiyama Y., Hosoya T., Poole A.M., Hotta Y. (1996). The gcm-motif: a novel DNA binding motif conserved in Drosophila and mammals. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 14912—14916. PMID 8962155 DOI:10.1073/pnas.93.25.14912
Yamada K., Ogawa H., Honda S., Harada N., Okazaki T. (1999). A GCM motif protein is involved in placenta-specific expression of human aromatase gene. J. Biol. Chem. 274: 32279—32286. PMID 10542267 DOI:10.1074/jbc.274.45.32279
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chiang M.H., Chen L.F., Chen H. (2008). Ubiquitin-conjugating enzyme UBE2D2 is responsible for FBXW2 (F-box and WD repeat domain containing 2)-mediated human GCM1 (glial cell missing homolog 1) ubiquitination and degradation. Biol. Reprod. 79: 914—920. PMID 18703417 DOI:10.1095/biolreprod.108.071407

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4197 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NP62 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.