GDI2

Ідентифікатори

Символи

GDI2, HEL-S-46e, RABGDIB, GDP dissociation inhibitor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600767 MGI: 99845 HomoloGene: 37488 GeneCards: GDI2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Rab GDP-dissociation inhibitor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • small GTPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP-dissociation inhibitor activity • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • везикула • гіалоплазма • мембрана • focal adhesion • екзосома • extracellular region • secretory granule lumen • azurophil granule lumen • комплекс Ґольджі • синапс
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein transport • GO:0048552 regulation of catalytic activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • small GTPase mediated signal transduction • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2665


14569

Ensembl


ENSG00000057608


ENSMUSG00000021218

UniProt


P50395 Q5SX91


Q61598

RefSeq (мРНК)


NM_001494 NM_001115156


NM_008112

RefSeq (білок)


NP_001108628 NP_001485


NP_032138

Локус (UCSC)

Хр. 10: 5.77 – 5.84 Mb

Хр. 13: 3.59 – 3.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GDI2 (англ. GDP dissociation inhibitor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 50 663^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNEEYDVIVL	GTGLTECILS	GIMSVNGKKV	LHMDRNPYYG	GESASITPLE
DLYKRFKIPG	SPPESMGRGR	DWNVDLIPKF	LMANGQLVKM	LLYTEVTRYL
DFKVTEGSFV	YKGGKIYKVP	STEAEALASS	LMGLFEKRRF	RKFLVYVANF
DEKDPRTFEG	IDPKKTTMRD	VYKKFDLGQD	VIDFTGHALA	LYRTDDYLDQ
PCYETINRIK	LYSESLARYG	KSPYLYPLYG	LGELPQGFAR	LSAIYGGTYM
LNKPIEEIIV	QNGKVIGVKS	EGEIARCKQL	ICDPSYVKDR	VEKVGQVIRV
ICILSHPIKN	TNDANSCQII	IPQNQVNRKS	DIYVCMISFA	HNVAAQGKYI
AIVSTTVETK	EPEKEIRPAL	ELLEPIEQKF	VSISDLLVPK	DLGTESQIFI
SRTYDATTHF	ETTCDDIKNI	YKRMTGSEFD	FEEMKRKKND	IYGED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Sedlacek Z., Munstermann E., Mincheva A., Lichter P., Poutska A. (1998). The human rab GDI beta gene with long retroposon-rich introns maps to 10p15 and its pseudogene to 7p11-p13. Mamm. Genome. 9: 78—80. PMID 9434952 DOI:10.1007/s003359900685
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Caillol N., Pasqualini E., Lloubes R., Lombardo D. (2000). Impairment of bile salt-dependent lipase secretion in human pancreatic tumoral SOJ-6 cells. J. Cell. Biochem. 79: 628—647. PMID 10996854 DOI:10.1002/1097-4644(20001215)79:4<628::AID-JCB120>3.0.CO;2-T
Bachner D., Sedlacek Z., Korn B., Hameister H., Poustka A. (1995). Expression patterns of two human genes coding for different rab GDP-dissociation inhibitors (GDIs), extremely conserved proteins involved in cellular transport. Hum. Mol. Genet. 4: 701—708. PMID 7543319 DOI:10.1093/hmg/4.4.701

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4227 (англ.) . Архів оригіналу за 26 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P50395 (англ.) . Архів оригіналу за 30 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.