GFI1B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GFI1B, BDPLT17, ZNF163B, growth factor independent 1B transcriptional repressor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604383 MGI: 1276578 HomoloGene: 31223 GeneCards: GFI1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • nuclear matrix • клітинне ядро • transcription regulator complex |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bb/PBB_GE_GFI1B_208501_at_fs.png/250px-PBB_GE_GFI1B_208501_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001135031 NM_004188 NM_001371908 NM_001377304 NM_001377305 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001128503 NP_004179 NP_001358837 NP_001364233 NP_001364234 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 132.94 – 132.99 Mb | Хр. 2: 28.5 – 28.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GFI1B (англ. Growth factor independent 1B transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 37 492[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRSFLVKSK | | KAHTYHQPRV | | QEDEPLWPPA | | LTPVPRDQAP | | SNSPVLSTLF |
PNQCLDWTNL | | KREPELEQDQ | | NLARMAPAPE | | GPIVLSRPQD | | GDSPLSDSPP |
FYKPSFSWDT | | LATTYGHSYR | | QAPSTMQSAF | | LEHSVSLYGS | | PLVPSTEPAL |
DFSLRYSPGM | | DAYHCVKCNK | | VFSTPHGLEV | | HVRRSHSGTR | | PFACDICGKT |
FGHAVSLEQH | | THVHSQERSF | | ECRMCGKAFK | | RSSTLSTHLL | | IHSDTRPYPC |
QFCGKRFHQK | | SDMKKHTYIH | | TGEKPHKCQV | | CGKAFSQSSN | | LITHSRKHTG |
FKPFSCELCT | | KGFQRKVDLR | | RHRESQHNLK |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Roedel B., Wagner T., Zoernig M., Niessing J., Moeroey T. (1998). The human homologue (GFI1B) of the chicken GFI gene maps to chromosome 9q34.13-A locus frequently altered in hematopoietic diseases. Genomics. 54: 580—582. PMID 9878267 DOI:10.1006/geno.1998.5601
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Huang D.-Y., Kuo Y.-Y., Chang Z.-F. (2005). GATA-1 mediates auto-regulation of Gfi-1B transcription in K562 cells. Nucleic Acids Res. 33: 5331—5342. PMID 16177182 DOI:10.1093/nar/gki838
- Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124
- Schwartz R., Engel I., Fallahi-Sichani M., Petrie H.T., Murre C. (2006). Gene expression patterns define novel roles for E47 in cell cycle progression, cytokine-mediated signaling, and T lineage development. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 9976—9981. PMID 16782810 DOI:10.1073/pnas.0603728103
- Wei X., Kee B.L. (2007). Growth factor independent 1B (Gfi1b) is an E2A target gene that modulates Gata3 in T-cell lymphomas. Blood. 109: 4406—4414. PMID 17272506 DOI:10.1182/blood-2006-08-043331
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4238 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VTD9 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |