GFI1B

Ідентифікатори

Символи

GFI1B, BDPLT17, ZNF163B, growth factor independent 1B transcriptional repressor

Зовнішні ІД

OMIM: 604383 MGI: 1276578 HomoloGene: 31223 GeneCards: GFI1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• nuclear matrix • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес	• multicellular organism development • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8328


14582

Ensembl


ENSG00000165702


ENSMUSG00000026815

UniProt


Q5VTD9


O70237

RefSeq (мРНК)


NM_001135031 NM_004188 NM_001371908 NM_001377304 NM_001377305


NM_001160406 NM_008114

RefSeq (білок)


NP_001128503 NP_004179 NP_001358837 NP_001364233 NP_001364234


NP_001153878 NP_032140

Локус (UCSC)

Хр. 9: 132.94 – 132.99 Mb

Хр. 2: 28.5 – 28.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GFI1B (англ. Growth factor independent 1B transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 37 492^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRSFLVKSK	KAHTYHQPRV	QEDEPLWPPA	LTPVPRDQAP	SNSPVLSTLF
PNQCLDWTNL	KREPELEQDQ	NLARMAPAPE	GPIVLSRPQD	GDSPLSDSPP
FYKPSFSWDT	LATTYGHSYR	QAPSTMQSAF	LEHSVSLYGS	PLVPSTEPAL
DFSLRYSPGM	DAYHCVKCNK	VFSTPHGLEV	HVRRSHSGTR	PFACDICGKT
FGHAVSLEQH	THVHSQERSF	ECRMCGKAFK	RSSTLSTHLL	IHSDTRPYPC
QFCGKRFHQK	SDMKKHTYIH	TGEKPHKCQV	CGKAFSQSSN	LITHSRKHTG
FKPFSCELCT	KGFQRKVDLR	RHRESQHNLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Roedel B., Wagner T., Zoernig M., Niessing J., Moeroey T. (1998). The human homologue (GFI1B) of the chicken GFI gene maps to chromosome 9q34.13-A locus frequently altered in hematopoietic diseases. Genomics. 54: 580—582. PMID 9878267 DOI:10.1006/geno.1998.5601
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang D.-Y., Kuo Y.-Y., Chang Z.-F. (2005). GATA-1 mediates auto-regulation of Gfi-1B transcription in K562 cells. Nucleic Acids Res. 33: 5331—5342. PMID 16177182 DOI:10.1093/nar/gki838
Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124
Schwartz R., Engel I., Fallahi-Sichani M., Petrie H.T., Murre C. (2006). Gene expression patterns define novel roles for E47 in cell cycle progression, cytokine-mediated signaling, and T lineage development. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 9976—9981. PMID 16782810 DOI:10.1073/pnas.0603728103
Wei X., Kee B.L. (2007). Growth factor independent 1B (Gfi1b) is an E2A target gene that modulates Gata3 in T-cell lymphomas. Blood. 109: 4406—4414. PMID 17272506 DOI:10.1182/blood-2006-08-043331

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4238 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5VTD9 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.