GZMA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1OP8, 1ORF

Ідентифікатори

Символи

GZMA, CTLA3, HFSP, granzyme A

Зовнішні ІД

OMIM: 140050 MGI: 109266 HomoloGene: 21237 GeneCards: GZMA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• immunological synapse • extracellular region • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of apoptotic process • negative regulation of DNA binding • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • negative regulation of endodeoxyribonuclease activity • Цитоліз • GO:2001216 negative regulation of oxidoreductase activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • протеоліз • GO:0097285 апоптоз • response to bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3001


14938

Ensembl


ENSG00000145649


ENSMUSG00000023132

UniProt


P12544


P11032

RefSeq (мРНК)


NM_006144


NM_010370

RefSeq (білок)


NP_006135


NP_034500

Локус (UCSC)

Хр. 5: 55.1 – 55.11 Mb

Хр. 13: 113.23 – 113.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GZMA (англ. Granzyme A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 262 амінокислот, а молекулярна маса — 28 999^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRNSYRFLAS	SLSVVVSLLL	IPEDVCEKII	GGNEVTPHSR	PYMVLLSLDR
KTICAGALIA	KDWVLTAAHC	NLNKRSQVIL	GAHSITREEP	TKQIMLVKKE
FPYPCYDPAT	REGDLKLLQL	MEKAKINKYV	TILHLPKKGD	DVKPGTMCQV
AGWGRTHNSA	SWSDTLREVN	ITIIDRKVCN	DRNHYNFNPV	IGMNMVCAGS
LRGGRDSCNG	DSGSPLLCEG	VFRGVTSFGL	ENKCGDPRGP	GVYILLSKKH
LNWIIMTIKG	AV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, цитоліз, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

Gershenfeld H.K., Hershberger R.J., Shows T.B., Weissman I.L. (1988). Cloning and chromosomal assignment of a human cDNA encoding a T cell- and natural killer cell-specific trypsin-like serine protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 1184—1188. PMID 3257574 DOI:10.1073/pnas.85.4.1184
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ruike Y., Katsuma S., Hirasawa A., Tsujimoto G. (2007). Glucocorticoid-induced alternative promoter usage for a novel 5' variant of granzyme A. J. Hum. Genet. 52: 172—178. PMID 17180578 DOI:10.1007/s10038-006-0099-9
Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Tumor suppressor NM23-H1 is a granzyme A-activated DNase during CTL-mediated apoptosis, and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor. Cell. 112: 659—672. PMID 12628186 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00150-8
Hink-Schauer C., Estebanez-Perpina E., Kurschus F.C., Bode W., Jenne D.E. (2003). Crystal structure of the apoptosis-inducing human granzyme A dimer. Nat. Struct. Biol. 10: 535—540. PMID 12819770 DOI:10.1038/nsb945
Hameed A., Lowrey D.M., Lichtenheld M., Podack E.R. (1988). Characterization of three serine esterases isolated from human IL-2 activated killer cells. J. Immunol. 141: 3142—3147. PMID 3262682

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4708 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P12544 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.