H2AFY

H2AFY
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT

Ідентифікатори
Символи MACROH2A1, H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A histone family member Y, H2AFY, macroH2A.1 histone
Зовнішні ІД OMIM: 610054 MGI: 1349392 HomoloGene: 3598 GeneCards: MACROH2A1
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein kinase binding
rDNA binding
protein serine/threonine kinase inhibitor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
double-stranded methylated DNA binding
protein heterodimerization activity
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
core promoter sequence-specific DNA binding
DNA binding
chromatin DNA binding
enzyme binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleosomal DNA binding
promoter-specific chromatin binding

Клітинна компонента

екзосома
ESC/E(Z) complex
ядерце
condensed chromosome
хромосома
pericentric heterochromatin
Нуклеосома
клітинне ядро
nuclear chromosome
sex chromatin
Тільце Барра
Хроматин

Біологічний процес

negative regulation of histone H3-K4 methylation
regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly
Дозова компенсація
negative regulation of cell cycle G2/M phase transition
epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
regulation of cell growth
positive regulation of keratinocyte differentiation
negative regulation of protein serine/threonine kinase activity
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
nucleosome assembly
negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region
negative regulation of gene expression, epigenetic
negative regulation of histone H3-K27 methylation
Епігенетичне успадкування
positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion
establishment of protein localization to chromatin
negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I
regulation of lipid metabolic process
regulation of response to oxidative stress
negative regulation of response to oxidative stress
positive regulation of response to oxidative stress
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9555
26914
Ensembl
ENSG00000113648
ENSMUSG00000015937
UniProt
O75367
Q9QZQ8
RefSeq (мРНК)
NM_001040158
NM_004893
NM_138609
NM_138610
NM_001159513
NM_001159514
NM_001159515
NM_012015
RefSeq (білок)
NP_001035248
NP_004884
NP_613075
NP_613258
NP_001152985
NP_001152986
NP_001152987
NP_036145
Локус (UCSC) Хр. 5: 135.33 – 135.4 Mb Хр. 13: 56.22 – 56.28 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

H2AFY (англ. H2A histone family member Y) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 39 617[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMA
AVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTI
ASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAG
GKKGARKSKKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQKLNLI
HSEISNLAGFEVEAIINPTNADIDLKDDLGNTLEKKGGKEFVEAVLELRK
KNGPLEVAGAAVSAGHGLPAKFVIHCNSPVWGADKCEELLEKTVKNCLAL
ADDKKLKSIAFPSIGSGRNGFPKQTAAQLILKAISSYFVSTMSSSIKTVY
FVLFDSESIGIYVQEMAKLDAN

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Costanzi C., Pehrson J.R. (1998). Histone macroH2A1 is concentrated in the inactive X chromosome of female mammals. Nature. 393: 599—601. PMID 9634239 DOI:10.1038/31275
  • Kustatscher G., Hothorn M., Pugieux C., Scheffzek K., Ladurner A.G. (2005). Splicing regulates NAD metabolite binding to histone macroH2A. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 624—625. PMID 15965484 DOI:10.1038/nsmb956

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4740 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
  4. UniProt, O75367 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»