H2AFY2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XD7

Ідентифікатори

Символи

MACROH2A2, macroH2A2, H2A histone family member Y2, H2AFY2, macroH2A.2 histone

Зовнішні ІД

OMIM: 616141 MGI: 3037658 HomoloGene: 10246 GeneCards: MACROH2A2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • chromatin DNA binding
Клітинна компонента	• ESC/E(Z) complex • нуклеоплазма • хромосома • Нуклеосома • Хроматин • екзосома • Тільце Барра • клітинне ядро
Біологічний процес	• nucleosome assembly • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I • positive regulation of keratinocyte differentiation • Дозова компенсація • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • establishment of protein localization to chromatin • brain development • negative regulation of gene expression, epigenetic • regulation of cell growth • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55506


404634

Ensembl


ENSG00000099284


ENSMUSG00000020086

UniProt


Q9P0M6


Q8CCK0

RefSeq (мРНК)


NM_018649


NM_207000

RefSeq (білок)


NP_061119


NP_996883

Локус (UCSC)

Хр. 10: 70.05 – 70.11 Mb

Хр. 10: 61.57 – 61.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

H2AFY2 (англ. H2A histone family member Y2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 40 058^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGRSGKKKM	SKLSRSARAG	VIFPVGRLMR	YLKKGTFKYR	ISVGAPVYMA
AVIEYLAAEI	LELAGNAARD	NKKARIAPRH	ILLAVANDEE	LNQLLKGVTI
ASGGVLPRIH	PELLAKKRGT	KGKSETILSP	PPEKRGRKAT	SGKKGGKKSK
AAKPRTSKKS	KPKDSDKEGT	SNSTSEDGPG	DGFTILSSKS	LVLGQKLSLT
QSDISHIGSM	RVEGIVHPTT	AEIDLKEDIG	KALEKAGGKE	FLETVKELRK
SQGPLEVAEA	AVSQSSGLAA	KFVIHCHIPQ	WGSDKCEEQL	EETIKNCLSA
AEDKKLKSVA	FPPFPSGRNC	FPKQTAAQVT	LKAISAHFDD	SSASSLKNVY
FLLFDSESIG	IYVQEMAKLD	AK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до регуляторів хроматину. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Chadwick B.P., Willard H.F. (2001). Histone H2A variants and the inactive X chromosome: identification of a second macroH2A variant. Hum. Mol. Genet. 10: 1101—1113. PMID 11331621 DOI:10.1093/hmg/10.10.1101
Costanzi C., Pehrson J.R. (2001). MACROH2A2, a new member of the MACROH2A core histone family. J. Biol. Chem. 276: 21776—21784. PMID 11262398 DOI:10.1074/jbc.M010919200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14453 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9P0M6 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.