HABP4

Ідентифікатори

Символи

HABP4, IHABP-4, IKi-1/57, SERBP1L, hyaluronan binding protein 4

Зовнішні ІД

OMIM: 617369 MGI: 1891713 HomoloGene: 8615 GeneCards: HABP4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • SUMO binding
Клітинна компонента	• extracellular region • саркомера • клітинне ядро • цитоплазма • ядерце • Тільце Кахаля • Саркоплазма • ядерні тільця • nuclear speck • gemini of coiled bodies • гіалоплазма • cytoplasmic stress granule
Біологічний процес	• negative regulation of DNA binding • cellular response to mechanical stimulus • platelet degranulation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of RNA splicing • positive regulation of translational initiation • mRNA processing • regulation of translation • Сплайсинг РНК • PML body organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22927


56541

Ensembl


ENSG00000130956


ENSMUSG00000021476

UniProt


Q5JVS0


Q9JKS5

RefSeq (мРНК)


NM_014282


NM_019986

RefSeq (білок)


NP_055097


NP_064370

Локус (UCSC)

Хр. 9: 96.45 – 96.49 Mb

Хр. 13: 64.31 – 64.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HABP4 (англ. Hyaluronan binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 45 785^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGALGSPVA	AAGAAMQESF	GCVVANRFHQ	LLDDESDPFD	ILREAERRRQ
QQLQRKRRDE	AAAAAGAGPR	GGRSPAGASG	HRAGAGGRRE	SQKERKSLPA
PVAQRPDSPG	GGLQAPGQKR	TPRRGEQQGW	NDSRGPEGML	ERAERRSYRE
YRPYETERQA	DFTAEKFPDE	KPGDRFDRDR	PLRGRGGPRG	GMRGRGRGGP
GNRVFDAFDQ	RGKREFERYG	GNDKIAVRTE	DNMGGCGVRT	WGSGKDTSDV
EPTAPMEEPT	VVEESQGTPE	EESPAKVPEL	EVEEETQVQE	MTLDEWKNLQ
EQTRPKPEFN	IRKPESTVPS	KAVVIHKSKY	RDDMVKDDYE	DDSHVFRKPA
NDITSQLEIN	FGNLPRPGRG	ARGGTRGGRG	RIRRAENYGP	RAEVVMQDVA
PNPDDPEDFP	ALS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Huang L., Grammatikakis N., Yoneda M., Banerjee S.D., Toole B.P. (2000). Molecular characterization of a novel intracellular hyaluronan-binding protein. J. Biol. Chem. 275: 29829—29839. PMID 10887182 DOI:10.1074/jbc.M002737200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. (2003). Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. FEBS Lett. 533: 14—20. PMID 12505151 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7
Nery F.C., Passos D.O., Garcia V.S., Kobarg J. (2004). Ki-1/57 interacts with RACK1 and is a substrate for the phosphorylation by phorbol 12-myristate 13-acetate-activated protein kinase C. J. Biol. Chem. 279: 11444—11455. PMID 14699138 DOI:10.1074/jbc.M306672200
Nery F.C., Rui E., Kuniyoshi T.M., Kobarg J. (2006). Evidence for the interaction of the regulatory protein Ki-1/57 with p53 and its interacting proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 341: 847—855. PMID 16455055 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.01.036

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17062 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5JVS0 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.