HAVCR2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5F71

Ідентифікатори

Символи

HAVCR2, HAVcr-2, KIM-3, TIM3, TIMD-3, TIMD3, Tim-3, CD366, hepatitis A virus cellular receptor 2, SPTCL

Зовнішні ІД

OMIM: 606652 MGI: 2159682 HomoloGene: 129541 GeneCards: HAVCR2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • міжклітинні контакти • early endosome • immunological synapse • cell surface • mediator complex
Біологічний процес	• negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target • negative regulation of defense response to bacterium • negative regulation of interferon-gamma production • negative regulation of immunological synapse formation • адаптивна імунна відповідь • maternal process involved in female pregnancy • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • negative regulation of natural killer cell activation • процес імунної системи • negative regulation of immune response to tumor cell • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of granulocyte colony-stimulating factor production • natural killer cell tolerance induction • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of macrophage activation • regulation of tolerance induction dependent upon immune response • negative regulation of T-helper 1 type immune response • positive regulation of defense response to bacterium • positive regulation of interleukin-4 production • negative regulation of gene expression • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • negative regulation of myeloid dendritic cell activation • macrophage activation involved in immune response • negative regulation of T cell proliferation • positive regulation of T cell proliferation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of innate immune response • negative regulation of interferon-alpha production • negative regulation of innate immune response • positive regulation of chemokine production • negative regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • negative regulation of tumor necrosis factor production • toll-like receptor 9 signaling pathway • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • inflammatory response • negative regulation of interleukin-3 production • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • toll-like receptor 3 signaling pathway • negative regulation of interleukin-2 production • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of interleukin-1 production • toll-like receptor 7 signaling pathway • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84868


171285

Ensembl


ENSG00000135077


ENSMUSG00000020399

UniProt


Q8TDQ0


Q8VIM0

RefSeq (мРНК)


NM_032782


NM_134250

RefSeq (білок)


NP_116171


NP_599011

Локус (UCSC)

Хр. 5: 157.09 – 157.14 Mb

Хр. 11: 46.35 – 46.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HAVCR2 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 33 394^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSHLPFDCV	LLLLLLLLTR	SSEVEYRAEV	GQNAYLPCFY	TPAAPGNLVP
VCWGKGACPV	FECGNVVLRT	DERDVNYWTS	RYWLNGDFRK	GDVSLTIENV
TLADSGIYCC	RIQIPGIMND	EKFNLKLVIK	PAKVTPAPTR	QRDFTAAFPR
MLTTRGHGPA	ETQTLGSLPD	INLTQISTLA	NELRDSRLAN	DLRDSGATIR
IGIYIGAGIC	AGLALALIFG	ALIFKWYSHS	KEKIQNLSLI	SLANLPPSGL
ANAVAEGIRS	EENIYTIEEN	VYEVEEPNEY	YCYVSSRQQP	SQPLGCRFAM
P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Gautron A.S., Dominguez-Villar M., de Marcken M., Hafler D.A. (2014). Enhanced suppressor function of TIM-3+ FoxP3+ regulatory T cells. Eur. J. Immunol. 44: 2703—2711. PMID 24838857 DOI:10.1002/eji.201344392
Gorman J.V., Colgan J.D. (2014). Regulation of T cell responses by the receptor molecule Tim-3. Immunol. Res. 59: 56—65. PMID 24825777 DOI:10.1007/s12026-014-8524-1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18437 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TDQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.