HECW1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HECW1, NEDL1, HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610384 MGI: 2444115 HomoloGene: 9004 GeneCards: HECW1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хвороба Альцгеймера, ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001081348 NM_153130 NM_178809 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 43.11 – 43.57 Mb | Хр. 13: 14.4 – 14.7 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HECW1 (англ. HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 606 амінокислот, а молекулярна маса — 179 554[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLLHLCSVKN | | LYQNRFLGLA | | AMASPSRNSQ | | SRRRCKEPLR | | YSYNPDQFHN |
MDLRGGPHDG | | VTIPRSTSDT | | DLVTSDSRST | | LMVSSSYYSI | | GHSQDLVIHW |
DIKEEVDAGD | | WIGMYLIDEV | | LSENFLDYKN | | RGVNGSHRGQ | | IIWKIDASSY |
FVEPETKICF | | KYYHGVSGAL | | RATTPSVTVK | | NSAAPIFKSI | | GADETVQGQG |
SRRLISFSLS | | DFQAMGLKKG | | MFFNPDPYLK | | ISIQPGKHSI | | FPALPHHGQE |
RRSKIIGNTV | | NPIWQAEQFS | | FVSLPTDVLE | | IEVKDKFAKS | | RPIIKRFLGK |
LSMPVQRLLE | | RHAIGDRVVS | | YTLGRRLPTD | | HVSGQLQFRF | | EITSSIHPDD |
EEISLSTEPE | | SAQIQDSPMN | | NLMESGSGEP | | RSEAPESSES | | WKPEQLGEGS |
VPDGPGNQSI | | ELSRPAEEAA | | VITEAGDQGM | | VSVGPEGAGE | | LLAQVQKDIQ |
PAPSAEELAE | | QLDLGEEASA | | LLLEDGEAPA | | STKEEPLEEE | | ATTQSRAGRE |
EEEKEQEEEG | | DVSTLEQGEG | | RLQLRASVKR | | KSRPCSLPVS | | ELETVIASAC |
GDPETPRTHY | | IRIHTLLHSM | | PSAQGGSAAE | | EEDGAEEEST | | LKDSSEKDGL |
SEVDTVAADP | | SALEEDREEP | | EGATPGTAHP | | GHSGGHFPSL | | ANGAAQDGDT |
HPSTGSESDS | | SPRQGGDHSC | | EGCDASCCSP | | SCYSSSCYST | | SCYSSSCYSA |
SCYSPSCYNG | | NRFASHTRFS | | SVDSAKISES | | TVFSSQDDEE | | EENSAFESVP |
DSMQSPELDP | | ESTNGAGPWQ | | DELAAPSGHV | | ERSPEGLESP | | VAGPSNRREG |
ECPILHNSQP | | VSQLPSLRPE | | HHHYPTIDEP | | LPPNWEARID | | SHGRVFYVDH |
VNRTTTWQRP | | TAAATPDGMR | | RSGSIQQMEQ | | LNRRYQNIQR | | TIATERSEED |
SGSQSCEQAP | | AGGGGGGGSD | | SEAESSQSSL | | DLRREGSLSP | | VNSQKITLLL |
QSPAVKFITN | | PEFFTVLHAN | | YSAYRVFTSS | | TCLKHMILKV | | RRDARNFERY |
QHNRDLVNFI | | NMFADTRLEL | | PRGWEIKTDQ | | QGKSFFVDHN | | SRATTFIDPR |
IPLQNGRLPN | | HLTHRQHLQR | | LRSYSAGEAS | | EVSRNRGASL | | LARPGHSLVA |
AIRSQHQHES | | LPLAYNDKIV | | AFLRQPNIFE | | MLQERQPSLA | | RNHTLREKIH |
YIRTEGNHGL | | EKLSCDADLV | | ILLSLFEEEI | | MSYVPLQAAF | | HPGYSFSPRC |
SPCSSPQNSP | | GLQRASARAP | | SPYRRDFEAK | | LRNFYRKLEA | | KGFGQGPGKI |
KLIIRRDHLL | | EGTFNQVMAY | | SRKELQRNKL | | YVTFVGEEGL | | DYSGPSREFF |
FLLSQELFNP | | YYGLFEYSAN | | DTYTVQISPM | | SAFVENHLEW | | FRFSGRILGL |
ALIHQYLLDA | | FFTRPFYKAL | | LRLPCDLSDL | | EYLDEEFHQS | | LQWMKDNNIT |
DILDLTFTVN | | EEVFGQVTER | | ELKSGGANTQ | | VTEKNKKEYI | | ERMVKWRVER |
GVVQQTEALV | | RGFYEVVDSR | | LVSVFDAREL | | ELVIAGTAEI | | DLNDWRNNTE |
YRGGYHDGHL | | VIRWFWAAVE | | RFNNEQRLRL | | LQFVTGTSSV | | PYEGFAALRG |
SNGLRRFCIE | | KWGKITSLPR | | AHTCFNRLDL | | PPYPSYSMLY | | EKLLTAVEET |
STFGLE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HECW1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22195 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q76N89 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |