HERC2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KEO, 3KCI, 4L1M

Ідентифікатори

Символи

HERC2, p528, D15F37S1, MRT38, SHEP1, jdf2, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, LOC107987422

Зовнішні ІД

OMIM: 605837 MGI: 103234 HomoloGene: 3430 GeneCards: HERC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • SUMO binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • мітохондріальна внутрішня мембрана • Центріоль • цитоскелет • клітинне ядро
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus • Убіквітин-залежний протеоліз • Сперматогенез • intracellular protein transport • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of molecular function
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8924


15204

Ensembl


ENSG00000128731 ENSG00000276802 ENSG00000277278


ENSMUSG00000030451

UniProt


O95714


Q4U2R1

RefSeq (мРНК)


NM_004667


NM_010418 NM_001360080

RefSeq (білок)


NP_004658


NP_034548 NP_001347009

Локус (UCSC)

Хр. 15: 28.11 – 28.32 Mb

Хр. 7: 55.7 – 55.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HERC2 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 834 амінокислот, а молекулярна маса — 527 228^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSESFCLAA	QARLDSKWLK	TDIQLAFTRD	GLCGLWNEMV	KDGEIVYTGT
ESTQNGELPP	RKDDSVEPSG	TKKEDLNDKE	KKDEEETPAP	IYRAKSILDS
WVWGKQPDVN	ELKECLSVLV	KEQQALAVQS	ATTTLSALRL	KQRLVILERY
FIALNRTVFQ	ENVKVKWKSS	GISLPPVDKK	SSRPAGKGVE	GLARVGSRAA
LSFAFAFLRR	AWRSGEDADL	CSELLQESLD	ALRALPEASL	FDESTVSSVW
LEVVERATRF	LRSVVTGDVH	GTPATKGPGS	IPLQDQHLAL	AILLELAVQR
GTLSQMLSAI	LLLLQLWDSG	AQETDNERSA	QGTSAPLLPL	LQRFQSIICR
KDAPHSEGDM	HLLSGPLSPN	ESFLRYLTLP	QDNELAIDLR	QTAVVVMAHL
DRLATPCMPP	LCSSPTSHKG	SLQEVIGWGL	IGWKYYANVI	GPIQCEGLAN
LGVTQIACAE	KRFLILSRNG	RVYTQAYNSD	TLAPQLVQGL	ASRNIVKIAA
HSDGHHYLAL	AATGEVYSWG	CGDGGRLGHG	DTVPLEEPKV	ISAFSGKQAG
KHVVHIACGS	TYSAAITAEG	ELYTWGRGNY	GRLGHGSSED	EAIPMLVAGL
KGLKVIDVAC	GSGDAQTLAV	TENGQVWSWG	DGDYGKLGRG	GSDGCKTPKL
IEKLQDLDVV	KVRCGSQFSI	ALTKDGQVYS	WGKGDNQRLG	HGTEEHVRYP
KLLEGLQGKK	VIDVAAGSTH	CLALTEDSEV	HSWGSNDQCQ	HFDTLRVTKP
EPAALPGLDT	KHIVGIACGP	AQSFAWSSCS	EWSIGLRVPF	VVDICSMTFE
QLDLLLRQVS	EGMDGSADWP	PPQEKECVAV	ATLNLLRLQL	HAAISHQVDP
EFLGLGLGSI	LLNSLKQTVV	TLASSAGVLS	TVQSAAQAVL	QSGWSVLLPT
AEERARALSA	LLPCAVSGNE	VNISPGRRFM	IDLLVGSLMA	DGGLESALHA
AITAEIQDIE	AKKEAQKEKE	IDEQEANAST	FHRSRTPLDK	DLINTGICES
SGKQCLPLVQ	LIQQLLRNIA	SQTVARLKDV	ARRISSCLDF	EQHSRERSAS
LDLLLRFQRL	LISKLYPGES	IGQTSDISSP	ELMGVGSLLK	KYTALLCTHI
GDILPVAASI	ASTSWRHFAE	VAYIVEGDFT	GVLLPELVVS	IVLLLSKNAG
LMQEAGAVPL	LGGLLEHLDR	FNHLAPGKER	DDHEELAWPG	IMESFFTGQN
CRNNEEVTLI	RKADLENHNK	DGGFWTVIDG	KVYDIKDFQT	QSLTGNSILA
QFAGEDPVVA	LEAALQFEDT	RESMHAFCVG	QYLEPDQEIV	TIPDLGSLSS
PLIDTERNLG	LLLGLHASYL	AMSTPLSPVE	IECAKWLQSS	IFSGGLQTSQ
IHYSYNEEKD	EDHCSSPGGT	PASKSRLCSH	RRALGDHSQA	FLQAIADNNI
QDHNVKDFLC	QIERYCRQCH	LTTPIMFPPE	HPVEEVGRLL	LCCLLKHEDL
GHVALSLVHA	GALGIEQVKH	RTLPKSVVDV	CRVVYQAKCS	LIKTHQEQGR
SYKEVCAPVI	ERLRFLFNEL	RPAVCNDLSI	MSKFKLLSSL	PRWRRIAQKI
IRERRKKRVP	KKPESTDDEE	KIGNEESDLE	EACILPHSPI	NVDKRPIAIK
SPKDKWQPLL	STVTGVHKYK	WLKQNVQGLY	PQSPLLSTIA	EFALKEEPVD
VEKMRKCLLK	QLERAEVRLE	GIDTILKLAS	KNFLLPSVQY	AMFCGWQRLI
PEGIDIGEPL	TDCLKDVDLI	PPFNRMLLEV	TFGKLYAWAV	QNIRNVLMDA
SAKFKELGIQ	PVPLQTITNE	NPSGPSLGTI	PQARFLLVML	SMLTLQHGAN
NLDLLLNSGM	LALTQTALRL	IGPSCDNVEE	DMNASAQGAS	ATVLEETRKE
TAPVQLPVSG	PELAAMMKIG	TRVMRGVDWK	WGDQDGPPPG	LGRVIGELGE
DGWIRVQWDT	GSTNSYRMGK	EGKYDLKLAE	LPAAAQPSAE	DSDTEDDSEA
EQTERNIHPT	AMMFTSTINL	LQTLCLSAGV	HAEIMQSEAT	KTLCGLLRML
VESGTTDKTS	SPNRLVYREQ	HRSWCTLGFV	RSIALTPQVC	GALSSPQWIT
LLMKVVEGHA	PFTATSLQRQ	ILAVHLLQAV	LPSWDKTERA	RDMKCLVEKL
FDFLGSLLTT	CSSDVPLLRE	STLRRRRVRP	QASLTATHSS	TLAEEVVALL
RTLHSLTQWN	GLINKYINSQ	LRSITHSFVG	RPSEGAQLED	YFPDSENPEV
GGLMAVLAVI	GGIDGRLRLG	GQVMHDEFGE	GTVTRITPKG	KITVQFSDMR
TCRVCPLNQL	KPLPAVAFNV	NNLPFTEPML	SVWAQLVNLA	GSKLEKHKIK
KSTKQAFAGQ	VDLDLLRCQQ	LKLYILKAGR	ALLSHQDKLR	QILSQPAVQE
TGTVHTDDGA	VVSPDLGDMS	PEGPQPPMIL	LQQLLASATQ	PSPVKAIFDK
QELEAAALAV	CQCLAVESTH	PSSPGFEDCS	SSEATTPVAV	QHIRPARVKR
RKQSPVPALP	IVVQLMEMGF	SRRNIEFALK	SLTGASGNAS	SLPGVEALVG
WLLDHSDIQV	TELSDADTVS	DEYSDEEVVE	DVDDAAYSMS	TGAVVTESQT
YKKRADFLSN	DDYAVYVREN	IQVGMMVRCC	RAYEEVCEGD	VGKVIKLDRD
GLHDLNVQCD	WQQKGGTYWV	RYIHVELIGY	PPPSSSSHIK	IGDKVRVKAS
VTTPKYKWGS	VTHQSVGVVK	AFSANGKDII	VDFPQQSHWT	GLLSEMELVP
SIHPGVTCDG	CQMFPINGSR	FKCRNCDDFD	FCETCFKTKK	HNTRHTFGRI
NEPGQSAVFC	GRSGKQLKRC	HSSQPGMLLD	SWSRMVKSLN	VSSSVNQASR
LIDGSEPCWQ	SSGSQGKHWI	RLEIFPDVLV	HRLKMIVDPA	DSSYMPSLVV
VSGGNSLNNL	IELKTININP	SDTTVPLLND	CTEYHRYIEI	AIKQCRSSGI
DCKIHGLILL	GRIRAEEEDL	AAVPFLASDN	EEEEDEKGNS	GSLIRKKAAG
LESAATIRTK	VFVWGLNDKD	QLGGLKGSKI	KVPSFSETLS	ALNVVQVAGG
SKSLFAVTVE	GKVYACGEAT	NGRLGLGISS	GTVPIPRQIT	ALSSYVVKKV
AVHSGGRHAT	ALTVDGKVFS	WGEGDDGKLG	HFSRMNCDKP	RLIEALKTKR
IRDIACGSSH	SAALTSSGEL	YTWGLGEYGR	LGHGDNTTQL	KPKMVKVLLG
HRVIQVACGS	RDAQTLALTD	EGLVFSWGDG	DFGKLGRGGS	EGCNIPQNIE
RLNGQGVCQI	ECGAQFSLAL	TKSGVVWTWG	KGDYFRLGHG	SDVHVRKPQV
VEGLRGKKIV	HVAVGALHCL	AVTDSGQVYA	WGDNDHGQQG	NGTTTVNRKP
TLVQGLEGQK	ITRVACGSSH	SVAWTTVDVA	TPSVHEPVLF	QTARDPLGAS
YLGVPSDADS	SAASNKISGA	SNSKPNRPSL	AKILLSLDGN	LAKQQALSHI
LTALQIMYAR	DAVVGALMPA	AMIAPVECPS	FSSAAPSDAS	AMASPMNGEE
CMLAVDIEDR	LSPNPWQEKR	EIVSSEDAVT	PSAVTPSAPS	ASARPFIPVT
DDLGAASIIA	ETMTKTKEDV	ESQNKAAGPE	PQALDEFTSL	LIADDTRVVV
DLLKLSVCSR	AGDRGRDVLS	AVLSGMGTAY	PQVADMLLEL	CVTELEDVAT
DSQSGRLSSQ	PVVVESSHPY	TDDTSTSGTV	KIPGAEGLRV	EFDRQCSTER
RHDPLTVMDG	VNRIVSVRSG	REWSDWSSEL	RIPGDELKWK	FISDGSVNGW
GWRFTVYPIM	PAAGPKELLS	DRCVLSCPSM	DLVTCLLDFR	LNLASNRSIV
PRLAASLAAC	AQLSALAASH	RMWALQRLRK	LLTTEFGQSI	NINRLLGEND
GETRALSFTG	SALAALVKGL	PEALQRQFEY	EDPIVRGGKQ	LLHSPFFKVL
VALACDLELD	TLPCCAETHK	WAWFRRYCMA	SRVAVALDKR	TPLPRLFLDE
VAKKIRELMA	DSENMDVLHE	SHDIFKREQD	EQLVQWMNRR	PDDWTLSAGG
SGTIYGWGHN	HRGQLGGIEG	AKVKVPTPCE	ALATLRPVQL	IGGEQTLFAV
TADGKLYATG	YGAGGRLGIG	GTESVSTPTL	LESIQHVFIK	KVAVNSGGKH
CLALSSEGEV	YSWGEAEDGK	LGHGNRSPCD	RPRVIESLRG	IEVVDVAAGG
AHSACVTAAG	DLYTWGKGRY	GRLGHSDSED	QLKPKLVEAL	QGHRVVDIAC
GSGDAQTLCL	TDDDTVWSWG	DGDYGKLGRG	GSDGCKVPMK	IDSLTGLGVV
KVECGSQFSV	ALTKSGAVYT	WGKGDYHRLG	HGSDDHVRRP	RQVQGLQGKK
VIAIATGSLH	CVCCTEDGEV	YTWGDNDEGQ	LGDGTTNAIQ	RPRLVAALQG
KKVNRVACGS	AHTLAWSTSK	PASAGKLPAQ	VPMEYNHLQE	IPIIALRNRL
LLLHHLSELF	CPCIPMFDLE	GSLDETGLGP	SVGFDTLRGI	LISQGKEAAF
RKVVQATMVR	DRQHGPVVEL	NRIQVKRSRS	KGGLAGPDGT	KSVFGQMCAK
MSSFGPDSLL	LPHRVWKVKF	VGESVDDCGG	GYSESIAEIC	EELQNGLTPL
LIVTPNGRDE	SGANRDCYLL	SPAARAPVHS	SMFRFLGVLL	GIAIRTGSPL
SLNLAEPVWK	QLAGMSLTIA	DLSEVDKDFI	PGLMYIRDNE	ATSEEFEAMS
LPFTVPSASG	QDIQLSSKHT	HITLDNRAEY	VRLAINYRLH	EFDEQVAAVR
EGMARVVPVP	LLSLFTGYEL	ETMVCGSPDI	PLHLLKSVAT	YKGIEPSASL
IQWFWEVMES	FSNTERSLFL	RFVWGRTRLP	RTIADFRGRD	FVIQVLDKYN
PPDHFLPESY	TCFFLLKLPR	YSCKQVLEEK	LKYAIHFCKS	IDTDDYARIA
LTGEPAADDS	SDDSDNEDVD	SFASDSTQDY	LTGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Mengel-From J., Borsting C., Sanchez J.J., Eiberg H., Morling N. (2010). Human eye colour and HERC2, OCA2 and MATP. Forensic Sci. Int. Genet. 4: 323—328. PMID 20457063 DOI:10.1016/j.fsigen.2009.12.004
Kang T.H., Lindsey-Boltz L.A., Reardon J.T., Sancar A. (2010). Circadian control of XPA and excision repair of cisplatin-DNA damage by cryptochrome and HERC2 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 4890—4895. PMID 20304803 DOI:10.1073/pnas.0915085107
Al-Hakim A.K., Bashkurov M., Gingras A.C., Durocher D., Pelletier L. (2012). Interaction proteomics identify NEURL4 and the HECT E3 ligase HERC2 as novel modulators of centrosome architecture. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.014233.01 — M111.014233.14. PMID 22261722 DOI:10.1074/mcp.M111.014233

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4868 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, O95714 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.