HFM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HFM1, MER3, POF9, SEC63D1, Si-11, Si-11-6, helicase, ATP-dependent DNA helicase homolog, ATP dependent DNA helicase homolog, helicase for meiosis 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615684 MGI: 3036246 HomoloGene: 87103 GeneCards: HFM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • resolution of meiotic recombination intermediates • GO:0007126 мейоз • RNA secondary structure unwinding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 91.26 – 91.4 Mb | Хр. 5: 106.84 – 106.93 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HFM1 (англ. HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 435 амінокислот, а молекулярна маса — 162 610[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLKSNDCLFS | | LENLFFEKPD | | EVENHPDNEK | | SLDWFLPPAP | | LISEIPDTQE |
LEEELESHKL | | LGQEKRPKML | | TSNLKITNED | | TNYISLTQKF | | QFAFPSDKYE |
QDDLNLEGVG | | NNDLSHIAGK | | LTYASQKYKN | | HIGTEIAPEK | | SVPDDTKLVN |
FAEDKGESTS | | VFRKRLFKIS | | DNIHGSAYSN | | DNELDSHIGS | | VKIVQTEMNK |
GKSRNYSNSK | | QKFQYSANVF | | TANNAFSASE | | IGEGMFKAPS | | FSVAFQPHDI |
QEVTENGLGS | | LKAVTEIPAK | | FRSIFKEFPY | | FNYIQSKAFD | | DLLYTDRNFV |
ICAPTGSGKT | | VVFELAITRL | | LMEVPLPWLN | | IKIVYMAPIK | | ALCSQRFDDW |
KEKFGPIGLN | | CKELTGDTVM | | DDLFEIQHAH | | IIMTTPEKWD | | SMTRKWRDNS |
LVQLVRLFLI | | DEVHIVKDEN | | RGPTLEVVVS | | RMKTVQSVSQ | | TLKNTSTAIP |
MRFVAVSATI | | PNAEDIAEWL | | SDGERPAVCL | | KMDESHRPVK | | LQKVVLGFPC |
SSNQTEFKFD | | LTLNYKIASV | | IQMYSDQKPT | | LVFCATRKGV | | QQAASVLVKD |
AKFIMTVEQK | | QRLQKYAYSV | | RDSKLRDILK | | DGAAYHHAGM | | ELSDRKVVEG |
AFTVGDLPVL | | FTTSTLAMGV | | NLPAHLVVIK | | STMHYAGGLF | | EEYSETDILQ |
MIGRAGRPQF | | DTTATAVIMT | | RLSTRDKYIQ | | MLACRDTVES | | SLHRHLIEHL |
NAEIVLHTIT | | DVNIAVEWIR | | STLLYIRALK | | NPSHYGFASG | | LNKDGIEAKL |
QELCLKNLND | | LSSLDLIKMD | | EGVNFKPTEA | | GRLMAWYYIT | | FETVKKFYTI |
SGKETLSDLV | | TLIAGCKEFL | | DIQLRINEKK | | TLNTLNKDPN | | RITIRFPMEG |
RIKTREMKVN | | CLIQAQLGCI | | PIQDFALTQD | | TAKIFRHGSR | | ITRWLSDFVA |
AQEKKFAVLL | | NSLILAKCFR | | CKLWENSLHV | | SKQLEKIGIT | | LSNAIVNAGL |
TSFKKIEETD | | ARELELILNR | | HPPFGTQIKE | | TVMYLPKYEL | | KVEQITRYSD |
TTAEILVTVI | | LRNFEQLQTK | | RTASDSHYVT | | LIIGDADNQV | | VYLHKITDSV |
LLKAGSWAKK | | IAVKRALKSE | | DLSINLISSE | | FVGLDIQQKL | | TVFYLEPKRF |
GNQITMQRKS | | ETQISHSKHS | | DISTIAGPNK | | GTTASKKPGN | | RECNHLCKSK |
HTCGHDCCKI | | GVAQKSEIKE | | STISSYLSDL | | RNRNAVSSVP | | PVKRLKIQMN |
KSQSVDLKEF | | GFTPKPSLPS | | ISRSEYLNIS | | ELPIMEQWDQ | | PEIYGKVRQE |
PSEYQDKEVL | | NVNFELGNEV | | WDDFDDENLE | | VTSFSTDTEK | | TKISGFGNTL |
SSSTRGSKLP | | LQESKSKFQR | | EMSNSFVSSH | | EMSDISLSNS | | AMPKFSASSM |
TKLPQQAGNA | | VIVHFQERKP | | QNLSPEIEKQ | | CFTFSEKNPN | | SSNYKKVDFF |
IRNSECKKEV | | DFSMYHPDDE | | ADEMKSLLGI | | FDGIF |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.
Література
- Tanaka K., Miyamoto N., Shouguchi-Miyata J., Ikeda J.E. (2006). HFM1, the human homologue of yeast Mer3, encodes a putative DNA helicase expressed specifically in germ-line cells. DNA Seq. 17: 242—246. PMID 17286053 DOI:10.1080/10425170600805433
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20193 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, A2PYH4 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |