HIF1AN

HIF1AN
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1H2K, 1H2L, 1H2M, 1H2N, 1IZ3, 1MZE, 1MZF, 1YCI, 2CGN, 2CGO, 2ILM, 2W0X, 2WA3, 2WA4, 2XUM, 2Y0I, 2YC0, 2YDE, 3D8C, 3KCX, 3KCY, 3OD4, 3P3N, 3P3P, 4AI8, 4B7E, 4B7K, 4BIO, 4JAA, 4NR1, 4Z2W, 4Z1V

Ідентифікатори
Символи HIF1AN, FIH1, hypoxia inducible factor 1 alpha subunit inhibitor, hypoxia inducible factor 1 subunit alpha inhibitor, HIFAN
Зовнішні ІД OMIM: 606615 MGI: 2442345 HomoloGene: 9906 GeneCards: HIF1AN
Онтологія гена
Молекулярна функція

iron ion binding
peptidyl-asparagine 3-dioxygenase activity
protein homodimerization activity
ankyrin repeat binding
zinc ion binding
dioxygenase activity
зв'язування з іоном металу
NF-kappaB binding
Notch binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
carboxylic acid binding
oxidoreductase activity
peptidyl-histidine dioxygenase activity
oxygen gasoreceptor activity
2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity
hypoxia-inducible factor-asparagine oxygenase activity

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
perinuclear region of cytoplasm
клітинне ядро
гіалоплазма

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
peptidyl-histidine hydroxylation
transcription, DNA-templated
peptidyl-aspartic acid hydroxylation
peptidyl-asparagine hydroxylation
positive regulation of myoblast differentiation
positive regulation of vasculogenesis
regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
negative regulation of Notch signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55662
319594
Ensembl
ENSG00000166135
ENSMUSG00000036450
UniProt
Q9NWT6
Q8BLR9
RefSeq (мРНК)
NM_017902
NM_176958
RefSeq (білок)
NP_060372
NP_795932
Локус (UCSC) Хр. 10: 100.53 – 100.56 Mb Хр. 19: 44.55 – 44.56 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HIF1AN (англ. Hypoxia inducible factor 1 alpha subunit inhibitor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 40 285[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAATAAEAVASGSGEPREEAGALGPAWDESQLRSYSFPTRPIPRLSQSDP
RAEELIENEEPVVLTDTNLVYPALKWDLEYLQENIGNGDFSVYSASTHKF
LYYDEKKMANFQNFKPRSNREEMKFHEFVEKLQDIQQRGGEERLYLQQTL
NDTVGRKIVMDFLGFNWNWINKQQGKRGWGQLTSNLLLIGMEGNVTPAHY
DEQQNFFAQIKGYKRCILFPPDQFECLYPYPVHHPCDRQSQVDFDNPDYE
RFPNFQNVVGYETVVGPGDVLYIPMYWWHHIESLLNGGITITVNFWYKGA
PTPKRIEYPLKAHQKVAIMRNIEKMLGEALGNPQEVGPLLNTMIKGRYN

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Mahon P.C., Hirota K., Semenza G.L. (2001). FIH-1: a novel protein that interacts with HIF-1alpha and VHL to mediate repression of HIF-1 transcriptional activity. Genes Dev. 15: 2675—2686. PMID 11641274 DOI:10.1101/gad.924501
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Koivunen P., Hirsila M., Gunzler V., Kivirikko K.I., Myllyharju J. (2004). Catalytic properties of the asparaginyl hydroxylase (FIH) in the oxygen sensing pathway are distinct from those of its prolyl 4-hydroxylases. J. Biol. Chem. 279: 9899—9904. PMID 14701857 DOI:10.1074/jbc.M312254200
  • Webb J.D., Muranyi A., Pugh C.W., Ratcliffe P.J., Coleman M.L. (2009). MYPT1, the targeting subunit of smooth-muscle myosin phosphatase, is a substrate for the asparaginyl hydroxylase factor inhibiting hypoxia-inducible factor (FIH). Biochem. J. 420: 327—333. PMID 19245366 DOI:10.1042/BJ20081905
  • Sakamoto T., Seiki M. (2009). Mint3 enhances the activity of hypoxia-inducible factor-1 (HIF-1) in macrophages by suppressing the activity of factor inhibiting HIF-1. J. Biol. Chem. 284: 30350—30359. PMID 19726677 DOI:10.1074/jbc.M109.019216
  • Dann C.E. III, Bruick R.K., Deisenhofer J. (2002). Structure of factor-inhibiting hypoxia-inducible factor 1: an asparaginyl hydroxylase involved in the hypoxic response pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 15351—15356. PMID 12432100 DOI:10.1073/pnas.202614999

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17113 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NWT6 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.