HIST1H4J

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB

4H9O, 3WKJ, 3AYW, 3WA9, 5B0Z, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3AV2, 3WTP, 3AV1, 3AZK, 3X1V, 5AV8, 1F66, 4QUU, 3CFS, 4YYK, 4QUT, 3NQJ, 3A6N, 3W99, 5AVC, 2RS9, 3F9Z, 3QZT, 3QBY, 3W97, 4M38, 4YM6, 3CFV, 4HGA, 1EQZ, 2RJE, 3QZV, 1HQ3, 4H9P, 3AZL, 3AFA, 1TZY, 3UVY, 5CPK, 3JPX, 4U9W, 4N3W, 4YYJ, 4YYD, 4H9N, 4H9R, 3AZI, 4LD9, 3UVX, 3AZH, 5BNX, 4N4F, 1U35, 4YYG, 3O36, 2ARO, 5AV9, 4H9S, 3AZF, 3W98, 4GQB, 4H9Q, 5BNV, 3WAA, 3AZG, 3AZE, 2RNY, 1ZKK, 2QQS, 2LVM, 3X1T, 3AN2, 2KWO, 3QZS, 3F9W, 5FFW, 5CPJ, 3F9X, 3IJ1, 4YM5, 3AZJ, 4YY6, 3AZN, 2IG0, 4YYH, 4YYI, 5CPI, 3W96, 3R45, 2KWN, 3F9Y, 5AV6, 3AZM, 5BO0, 3X1S, 4QYD, 4KGC, 3UVW, 4YYN, 3X1U, 3UW9, 2F8N, 3NQU, 5B0Y, 4YYM, 5C3I, 4Z5T, 5B24, 5FA5, 4Z2M, 5E5A, 5FWE, 5B2I, 5B40, 5B2J, 5JA4, 5AY8, 4ZUX

Ідентифікатори

Символи

H4C11, H4/e, H4F2iv, H4FE, dJ160A22.2, histone cluster 1, H4j, histone cluster 1 H4 family member j, H4 clustered histone 11, HIST1H4J, H4C5, H4C4, H4C9, H4C12, H4-16, H4C3, H4C13, H4C1, H4C14, H4C15, H4C8, H4C6, H4C2, TEVANED2

Зовнішні ІД

OMIM: 602826 MGI: 2448425 HomoloGene: 134492 GeneCards: H4C11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0031493 histone binding • RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • хромосома • нуклеоплазма • extracellular region • nuclear chromosome • Нуклеосома • екзосома • клітинне ядро • GO:0005578 Позаклітинна матриця • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• telomere organization • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • protein heterotetramerization • negative regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • rDNA heterochromatin assembly • negative regulation of gene expression, epigenetic • DNA-templated transcription, initiation • double-strand break repair via nonhomologous end joining • beta-catenin-TCF complex assembly • telomere capping • nucleosome assembly • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8363


319157

Ensembl


ENSG00000197238


ENSMUSG00000069274

UniProt


P62805


P62806

RefSeq (мРНК)


NM_021968


NM_175655

RefSeq (білок)

NP_003537 NP_003486 NP_003535 NP_003539 NP_003531
NP_003536

NP_291074 NP_783587 NP_783588 NP_835499 NP_835500
NP_001182350 NP_835515 NP_783585 NP_783586 NP_835582 NP_835583 NP_783583 NP_694813

Локус (UCSC)

Хр. 6: 27.82 – 27.82 Mb

Хр. 13: 23.74 – 23.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIST1H4J (англ. Histone cluster 1 H4 family member k) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 103 амінокислот, а молекулярна маса — 11 367^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGRGKGGKG	LGKGGAKRHR	KVLRDNIQGI	TKPAIRRLAR	RGGVKRISGL
IYEETRGVLK	VFLENVIRDA	VTYTEHAKRK	TVTAMDVVYA	LKRQGRTLYG
FGG

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Sierra F., Stein G., Stein J. (1983). Structure and in vitro transcription of a human H4 histone gene. Nucleic Acids Res. 11: 7069—7086. PMID 6314274 DOI:10.1093/nar/11.20.7069
Pauli U., Chrysogelos S., Stein G., Stein J., Nick H. (1987). Protein-DNA interactions in vivo upstream of a cell cycle-regulated human H4 histone gene. Science. 236: 1308—1311. PMID 3035717 DOI:10.1126/science.3035717
Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Drabent B., Kardalinou E., Bode C., Doenecke D. (1995). Association of histone H4 genes with the mammalian testis-specific H1t histone gene. DNA Cell Biol. 14: 591—597. PMID 7626218 DOI:10.1089/dna.1995.14.591
Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes. Gene. 184: 141—148. PMID 9031620 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
Albig W., Doenecke D. (1997). The human histone gene cluster at the D6S105 locus. Hum. Genet. 101: 284—294. PMID 9439656 DOI:10.1007/s004390050630

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4781 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P62805 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.