HLA-DMA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1HDM, 2BC4, 4FQX, 4GBX

Ідентифікатори

Символи

HLA-DMA, D6S222E, DMA, HLADM, RING6, major histocompatibility complex, class II, DM alpha

Зовнішні ІД

OMIM: 142855 MGI: 95921 HomoloGene: 4464 GeneCards: HLA-DMA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC class II protein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell surface • ендосома • лізосома • екзосома • late endosome membrane • мембрана • lysosomal membrane • MHC class II protein complex • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • процес імунної системи • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3108


14998

Ensembl

ENSG00000243215 ENSG00000243719 ENSG00000239463 ENSG00000204257 ENSG00000242361
ENSG00000241394 ENSG00000243189 ENSG00000242685


ENSMUSG00000037649

UniProt


P28067


P28078 Q31621

RefSeq (мРНК)


NM_006120


NM_010386 NM_001360530

RefSeq (білок)


н/д


NP_034516 NP_001347459

Локус (UCSC)

Хр. 6: 32.95 – 32.97 Mb

Хр. 17: 34.34 – 34.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DMA (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 194^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGHEQNQGAA	LLQMLPLLWL	LPHSWAVPEA	PTPMWPDDLQ	NHTFLHTVYC
QDGSPSVGLS	EAYDEDQLFF	FDFSQNTRVP	RLPEFADWAQ	EQGDAPAILF
DKEFCEWMIQ	QIGPKLDGKI	PVSRGFPIAE	VFTLKPLEFG	KPNTLVCFVS
NLFPPMLTVN	WHDHSVPVEG	FGPTFVSAVD	GLSFQAFSYL	NFTPEPSDIF
SCIVTHEIDR	YTAIAYWVPR	NALPSDLLEN	VLCGVAFGLG	VLGIIVGIVL
IIYFRKPCSG	D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Kelly A.P., Monaco J.J., Cho S., Trowsdale J. (1991). A new human HLA class II-related locus, DM. Nature. 353: 571—573. PMID 1922365 DOI:10.1038/353571a0
Sanderson F., Powis S.H., Kelly A.P., Trowsdale J. (1994). Limited polymorphism in HLA-DM does not involve the peptide binding groove. Immunogenetics. 39: 56—58. PMID 8225438 DOI:10.1007/BF00171797
Carrington M., Harding A. (1994). Sequence analysis of two novel HLA-DMA alleles. Immunogenetics. 40: 165—165. PMID 8026867 DOI:10.1007/BF00188184
Weber D.A., Evavold B.D., Jensen P.E. (1996). Enhanced dissociation of HLA-DR-bound peptides in the presence of HLA-DM. Science. 274: 618—620. PMID 8849454 DOI:10.1126/science.274.5287.618
Mosyak L., Zaller D.M., Wiley D.C. (1998). The structure of HLA-DM, the peptide exchange catalyst that loads antigen onto class II MHC molecules during antigen presentation. Immunity. 9: 377—383. PMID 9768757 DOI:10.1016/S1074-7613(00)80620-2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4934 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P28067 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.