HLA-DOA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HLA-DOA, HLA-DNA, HLA-DZA, HLADZ, major histocompatibility complex, class II, DO alpha |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142930 MGI: 95924 HomoloGene: 1601 GeneCards: HLA-DOA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
періодонтит[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • MHC class II receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class II protein complex binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • lysosomal membrane • ендосома • клітинна мембрана • лізосома • MHC class II protein complex • endosome membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II • regulation of T cell differentiation • процес імунної системи • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адаптивна імунна відповідь |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000204252 ENSG00000230141 ENSG00000232962 ENSG00000235744 ENSG00000231558
| ENSG00000206292 ENSG00000232957 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 33 – 33.01 Mb | Хр. 17: 34.31 – 34.31 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HLA-DOA (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 27 599[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALRAGLVLG | | FHTLMTLLSP | | QEAGATKADH | | MGSYGPAFYQ | | SYGASGQFTH |
EFDEEQLFSV | | DLKKSEAVWR | | LPEFGDFARF | | DPQGGLAGIA | | AIKAHLDILV |
ERSNRSRAIN | | VPPRVTVLPK | | SRVELGQPNI | | LICIVDNIFP | | PVINITWLRN |
GQTVTEGVAQ | | TSFYSQPDHL | | FRKFHYLPFV | | PSAEDVYDCQ | | VEHWGLDAPL |
LRHWELQVPI | | PPPDAMETLV | | CALGLAIGLV | | GFLVGTVLII | | MGTYVSSVPR |
|
Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.
Література
- Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413. PMID 2499532 DOI:10.1007/BF00375872
- Young J.A., Trowsdale J. (1990). The HLA-DNA (DZA) gene is correctly expressed as a 1.1 kb mature mRNA transcript. Immunogenetics. 31: 386—388. PMID 2370084 DOI:10.1007/BF02115015
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142. PMID 10837054 DOI:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
- Trowsdale J., Kelly A. (1985). The human HLA class II alpha chain gene DZ alpha is distinct from genes in the DP, DQ and DR subregions. EMBO J. 4: 2231—2237. PMID 3000765
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DOA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4936 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P06340 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |