HLTF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MZN, 4HRE, 4HRH, 4S0N, 4XZF, 4XZG, 5BNH, 5K5F

Ідентифікатори

Символи

HLTF, HIP116, HIP116A, HLTF1, RNF80, SMARCA3, SNF2L3, ZBU1, helicase-like transcription factor, helicase like transcription factor

Зовнішні ІД

OMIM: 603257 MGI: 1196437 HomoloGene: 30136 GeneCards: HLTF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • RNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • обмін речовин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6596


20585

Ensembl


ENSG00000071794


ENSMUSG00000002428

UniProt


Q14527


Q6PCN7

RefSeq (мРНК)


NM_003071 NM_139048 NM_001318934 NM_001318935


NM_009210 NM_144959 NM_001355097

RefSeq (білок)


NP_001305863 NP_001305864 NP_003062 NP_620636


NP_033236 NP_001342026

Локус (UCSC)

Хр. 3: 149.03 – 149.09 Mb

Хр. 3: 20.11 – 20.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLTF (англ. Helicase like transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 009 амінокислот, а молекулярна маса — 113 929^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSWMFKRDPV	WKYLQTVQYG	VHGNFPRLSY	PTFFPRFEFQ	DVIPPDDFLT
SDEEVDSVLF	GSLRGHVVGL	RYYTGVVNNN	EMVALQRDPN	NPYDKNAIKV
NNVNGNQVGH	LKKELAGALA	YIMDNKLAQI	EGVVPFGANN	AFTMPLHMTF
WGKEENRKAV	SDQLKKHGFK	LGPAPKTLGF	NLESGWGSGR	AGPSYSMPVH
AAVQMTTEQL	KTEFDKLFED	LKEDDKTHEM	EPAEAIETPL	LPHQKQALAW
MVSRENSKEL	PPFWEQRNDL	YYNTITNFSE	KDRPENVHGG	ILADDMGLGK
TLTAIAVILT	NFHDGRPLPI	ERVKKNLLKK	EYNVNDDSMK	LGGNNTSEKA
DGLSKDASRC	SEQPSISDIK	EKSKFRMSEL	SSSRPKRRKT	AVQYIESSDS
EEIETSELPQ	KMKGKLKNVQ	SETKGRAKAG	SSKVIEDVAF	ACALTSSVPT
TKKKMLKKGA	CAVEGSKKTD	VEERPRTTLI	ICPLSVLSNW	IDQFGQHIKS
DVHLNFYVYY	GPDRIREPAL	LSKQDIVLTT	YNILTHDYGT	KGDSPLHSIR
WLRVILDEGH	AIRNPNAQQT	KAVLDLESER	RWVLTGTPIQ	NSLKDLWSLL
SFLKLKPFID	REWWHRTIQR	PVTMGDEGGL	RRLQSLIKNI	TLRRTKTSKI
KGKPVLELPE	RKVFIQHITL	SDEERKIYQS	VKNEGRATIG	RYFNEGTVLA
HYADVLGLLL	RLRQICCHTY	LLTNAVSSNG	PSGNDTPEEL	RKKLIRKMKL
ILSSGSDEEC	AICLDSLTVP	VITHCAHVFC	KPCICQVIQN	EQPHAKCPLC
RNDIHEDNLL	ECPPEELARD	SEKKSDMEWT	SSSKINALMH	ALTDLRKKNP
NIKSLVVSQF	TTFLSLIEIP	LKASGFVFTR	LDGSMAQKKR	VESIQCFQNT
EAGSPTIMLL	SLKAGGVGLN	LSAASRVFLM	DPAWNPAAED	QCFDRCHRLG
QKQEVIITKF	IVKDSVEENM	LKIQNKKREL	AAGAFGTKKP	NADEMKQAKI
NEIRTLIDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, убіквітинування білків, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Sheridan P.L., Schorpp M., Voz M.L., Jones K.A. (1995). Cloning of an SNF2/SWI2-related protein that binds specifically to the SPH motifs of the SV40 enhancer and to the HIV-1 promoter. J. Biol. Chem. 270: 4575—4587. PMID 7876228 DOI:10.1074/jbc.270.9.4575
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ding H., Benotmane A.M., Suske G., Collen D., Belayew A. (1999). Functional interactions between Sp1 or Sp3 and the helicase-like transcription factor mediate basal expression from the human plasminogen activator inhibitor-1 gene. J. Biol. Chem. 274: 19573—19580. PMID 10391891 DOI:10.1074/jbc.274.28.19573
Helmer R.A., Dertien J.S., Chilton B.S. (2011). Prolactin induces Jak2 phosphorylation of RUSHY195. Mol. Cell. Endocrinol. 338: 79—83. PMID 21457752 DOI:10.1016/j.mce.2011.03.009
Descheemaeker K. (1993). On the regulation of the plasminogen activator inhibitor-1 gene expression. Verh. K. Acad. Geneeskd. Belg. 55: 225—264. PMID 8342330

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11099 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q14527 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.