HNRNPH3

Ідентифікатори

Символи

HNRNPH3, 2H9, HNRPH3, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3

Зовнішні ІД

OMIM: 602324 MGI: 1926462 HomoloGene: 11012 GeneCards: HNRNPH3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • epithelial cell differentiation • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3189


432467

Ensembl


ENSG00000096746


ENSMUSG00000020069

UniProt


P31942


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_012207 NM_021644 NM_001322434 NM_001322436 NM_001322437
NM_001322438 NM_001322439 NM_001322440 NM_001322441 NM_001322442 NM_001322443 NM_001322444 NM_001322445 NM_001322446 NM_001322447 NM_001322448 NM_001322449 NM_001322450 NM_001322451 NM_001322452 NM_001322453


NM_001079824 NM_001347457 NM_001359260 NM_001359261

RefSeq (білок)

NP_001309363 NP_001309365 NP_001309366 NP_001309367 NP_001309368
NP_001309369 NP_001309370 NP_001309371 NP_001309372 NP_001309373 NP_001309374 NP_001309375 NP_001309376 NP_001309377 NP_001309378 NP_001309379 NP_001309380 NP_001309381 NP_001309382 NP_036339 NP_067676


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 68.33 – 68.34 Mb

Хр. 10: 63.01 – 63.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPH3 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 36 926^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDWVMKHNGP	NDASDGTVRL	RGLPFGCSKE	EIVQFFQGLE	IVPNGITLTM
DYQGRSTGEA	FVQFASKEIA	ENALGKHKER	IGHRYIEIFR	SSRSEIKGFY
DPPRRLLGQR	PGPYDRPIGG	RGGYYGAGRG	SMYDRMRRGG	DGYDGGYGGF
DDYGGYNNYG	YGNDGFDDRM	RDGRGMGGHG	YGGAGDASSG	FHGGHFVHMR
GLPFRATEND	IANFFSPLNP	IRVHIDIGAD	GRATGEADVE	FVTHEDAVAA
MSKDKNNMQH	RYIELFLNST	PGGGSGMGGS	GMGGYGRDGM	DNQGGYGSVG
RMGMGNNYSG	GYGTPDGLGG	YGRGGGGSGG	YYGQGGMSGG	GWRGMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yague J., Vazquez J., Lopez de Castro J.A. (2000). A post-translational modification of nuclear proteins, N(G),N(G)-dimethyl-Arg, found in a natural HLA class I peptide ligand. Protein Sci. 9: 2210—2217. PMID 11152131 DOI:10.1110/ps.9.11.2210
Honore B. (2000). The hnRNP 2H9 gene, which is involved in the splicing reaction, is a multiply spliced gene. Biochim. Biophys. Acta. 1492: 108—119. PMID 10858537

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5043 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P31942 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.