HNRNPK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1J5K, 1KHM, 1ZZI, 1ZZJ, 1ZZK

Ідентифікатори

Символи

HNRNPK, CSBP, HNRPK, TUNP, AUKS, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K

Зовнішні ІД

OMIM: 600712 MGI: 99894 HomoloGene: 81909 GeneCards: HNRNPK

Пов'язані генетичні захворювання

neurodevelopmental disorder-craniofacial dysmorphism-cardiac defect-hip dysplasia syndrome due to a point mutation, neurodevelopmental disorder-craniofacial dysmorphism-cardiac defect-hip dysplasia syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • DNA binding • single-stranded DNA binding • RNA binding • cadherin binding • protein domain specific binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • focal adhesion • клітинне ядро • catalytic step 2 spliceosome • cell projection • екзосома • podosome • spliceosomal complex • міжклітинні контакти • GO:0005578 Позаклітинна матриця • нуклеоплазма • cytoplasmic stress granule
Біологічний процес	• positive regulation of receptor-mediated endocytosis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • regulation of low-density lipoprotein particle clearance • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process • Сплайсинг РНК • transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3190


15387

Ensembl


ENSG00000165119


ENSMUSG00000021546

UniProt


P61978


P61979

RefSeq (мРНК)

NM_002140 NM_031262 NM_031263 NM_001318186 NM_001318187
NM_001318188

NM_001301340 NM_001301341 NM_001301343 NM_001301344 NM_001301345
NM_025279

RefSeq (білок)

NP_001305115 NP_001305116 NP_001305117 NP_002131 NP_112552
NP_112553

NP_001288269 NP_001288270 NP_001288272 NP_001288273 NP_001288274
NP_079555 NP_001347419 NP_001347420 NP_001347422 NP_001347423 NP_001347424

Локус (UCSC)

Хр. 9: 83.97 – 83.98 Mb

Хр. 13: 58.39 – 58.4 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPK (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 976^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METEQPEETF	PNTETNGEFG	KRPAEDMEEE	QAFKRSRNTD	EMVELRILLQ
SKNAGAVIGK	GGKNIKALRT	DYNASVSVPD	SSGPERILSI	SADIETIGEI
LKKIIPTLEE	GLQLPSPTAT	SQLPLESDAV	ECLNYQHYKG	SDFDCELRLL
IHQSLAGGII	GVKGAKIKEL	RENTQTTIKL	FQECCPHSTD	RVVLIGGKPD
RVVECIKIIL	DLISESPIKG	RAQPYDPNFY	DETYDYGGFT	MMFDDRRGRP
VGFPMRGRGG	FDRMPPGRGG	RPMPPSRRDY	DDMSPRRGPP	PPPPGRGGRG
GSRARNLPLP	PPPPPRGGDL	MAYDRRGRPG	DRYDGMVGFS	ADETWDSAID
TWSPSEWQMA	YEPQGGSGYD	YSYAGGRGSY	GDLGGPIITT	QVTIPKDLAG
SIIGKGGQRI	KQIRHESGAS	IKIDEPLEGS	EDRIITITGT	QDQIQNAQYL
LQNSVKQYSG	KFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Matunis M.J., Michael W.M., Dreyfuss G. (1992). Characterization and primary structure of the poly(C)-binding heterogeneous nuclear ribonucleoprotein complex K protein. Mol. Cell. Biol. 12: 164—171. PMID 1729596 DOI:10.1128/MCB.12.1.164
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen H.C., Lin W.C., Tsay Y.G., Lee S.C., Chang C.J. (2002). An RNA helicase, DDX1, interacting with poly(A) RNA and heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K. J. Biol. Chem. 277: 40403—40409. PMID 12183465 DOI:10.1074/jbc.M206981200
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Moumen A., Masterson P., O'Connor M.J., Jackson S.P. (2005). hnRNP K: an HDM2 target and transcriptional coactivator of p53 in response to DNA damage. Cell. 123: 1065—1078. PMID 16360036 DOI:10.1016/j.cell.2005.09.032
Kwiek N.C., Thacker D.F., Datto M.B., Megosh H.B., Haystead T.A.J. (2006). PITK, a PP1 targeting subunit that modulates the phosphorylation of the transcriptional regulator hnRNP K. Cell. Signal. 18: 1769—1778. PMID 16564677 DOI:10.1016/j.cellsig.2006.01.019

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HNRNPK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5044 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P61978 (англ.) . Архів оригіналу за 7 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.