IFIT1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IFIT1, C56, G10P1, IFI-56, IFI-56K, IFI56, IFIT-1, IFNAI1, ISG56, P56, RNM561, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 147690 MGI: 2148249 HomoloGene: 78213 GeneCards: IFIT1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • host cell • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of helicase activity • response to virus • positive regulation of viral genome replication • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of defense response to virus by host • cellular response to type I interferon • GO:0022415 viral process • intracellular transport of viral protein in host cell • negative regulation of protein binding • type I interferon signaling pathway • вроджений імунітет • regulation of defense response to virus • cellular response to exogenous dsRNA • процес імунної системи • defense response to virus • response to bacterium • cellular response to interferon-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d7/PBB_GE_IFIT1_203153_at_fs.png/250px-PBB_GE_IFIT1_203153_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001548 NM_001270927 NM_001270928 NM_001270929 NM_001270930 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001257856 NP_001257857 NP_001257858 NP_001257859 NP_001539 |
| |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 19: 34.59 – 34.62 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IFIT1 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 55 360[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTNGDDHQV | | KDSLEQLRCH | | FTWELSIDDD | | EMPDLENRVL | | DQIEFLDTKY |
SVGIHNLLAY | | VKHLKGQNEE | | ALKSLKEAEN | | LMQEEHDNQA | | NVRSLVTWGN |
FAWMYYHMGR | | LAEAQTYLDK | | VENICKKLSN | | PFRYRMECPE | | IDCEEGWALL |
KCGGKNYERA | | KACFEKVLEV | | DPENPESSAG | | YAISAYRLDG | | FKLATKNHKP |
FSLLPLRQAV | | RLNPDNGYIK | | VLLALKLQDE | | GQEAEGEKYI | | EEALANMSSQ |
TYVFRYAAKF | | YRRKGSVDKA | | LELLKKALQE | | TPTSVLLHHQ | | IGLCYKAQMI |
QIKEATKGQP | | RGQNREKLDK | | MIRSAIFHFE | | SAVEKKPTFE | | VAHLDLARMY |
IEAGNHRKAE | | ENFQKLLCMK | | PVVEETMQDI | | HFHYGRFQEF | | QKKSDVNAII |
HYLKAIKIEQ | | ASLTRDKSIN | | SLKKLVLRKL | | RRKALDLESL | | SLLGFVYKLE |
GNMNEALEYY | | ERALRLAADF | | ENSVRQGP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chebath J., Merlin G., Metz R., Benech P., Revel M. (1983). Interferon-induced 56,000 Mr protein and its mRNA in human cells: molecular cloning and partial sequence of the cDNA. Nucleic Acids Res. 11: 1213—1226. PMID 6186990 DOI:10.1093/nar/11.5.1213
- Wathelet M.G., Clauss I.M., Nols C.B., Content J., Huez G.A. (1987). New inducers revealed by the promoter sequence analysis of two interferon-activated human genes. Eur. J. Biochem. 169: 313—321. PMID 3121313 DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13614.x
- Wathelet M.G., Clauss I.M., Content J., Huez G.A. (1988). The IFI-56K and IFI-54K interferon-inducible human genes belong to the same gene family. FEBS Lett. 231: 164—171. PMID 3360121 DOI:10.1016/0014-5793(88)80724-5
- Zhao C., Denison C., Huibregtse J.M., Gygi S.P., Krug R.M. (2005). Human ISG15 conjugation targets both IFN-induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10200—10205. PMID 16009940 DOI:10.1073/pnas.0504754102
- Terenzi F., Pal S., Sen G.C. (2005). Induction and mode of action of the viral stress-inducible murine proteins, P56 and P54. Virology. 340: 116—124. PMID 16023166 DOI:10.1016/j.virol.2005.06.011
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5407 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P09914 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |