IFIT1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4HOU

Ідентифікатори

Символи

IFIT1, C56, G10P1, IFI-56, IFI-56K, IFI56, IFIT-1, IFNAI1, ISG56, P56, RNM561, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1

Зовнішні ІД

OMIM: 147690 MGI: 2148249 HomoloGene: 78213 GeneCards: IFIT1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • host cell • гіалоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of helicase activity • response to virus • positive regulation of viral genome replication • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of defense response to virus by host • cellular response to type I interferon • GO:0022415 viral process • intracellular transport of viral protein in host cell • negative regulation of protein binding • type I interferon signaling pathway • вроджений імунітет • regulation of defense response to virus • cellular response to exogenous dsRNA • процес імунної системи • defense response to virus • response to bacterium • cellular response to interferon-beta
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3434


112419

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000067297

UniProt


P09914


Q3U687

RefSeq (мРНК)


NM_001548 NM_001270927 NM_001270928 NM_001270929 NM_001270930


NM_053217 NM_001362130

RefSeq (білок)


NP_001257856 NP_001257857 NP_001257858 NP_001257859 NP_001539


NP_444447 NP_001349059

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 19: 34.59 – 34.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFIT1 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 55 360^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTNGDDHQV	KDSLEQLRCH	FTWELSIDDD	EMPDLENRVL	DQIEFLDTKY
SVGIHNLLAY	VKHLKGQNEE	ALKSLKEAEN	LMQEEHDNQA	NVRSLVTWGN
FAWMYYHMGR	LAEAQTYLDK	VENICKKLSN	PFRYRMECPE	IDCEEGWALL
KCGGKNYERA	KACFEKVLEV	DPENPESSAG	YAISAYRLDG	FKLATKNHKP
FSLLPLRQAV	RLNPDNGYIK	VLLALKLQDE	GQEAEGEKYI	EEALANMSSQ
TYVFRYAAKF	YRRKGSVDKA	LELLKKALQE	TPTSVLLHHQ	IGLCYKAQMI
QIKEATKGQP	RGQNREKLDK	MIRSAIFHFE	SAVEKKPTFE	VAHLDLARMY
IEAGNHRKAE	ENFQKLLCMK	PVVEETMQDI	HFHYGRFQEF	QKKSDVNAII
HYLKAIKIEQ	ASLTRDKSIN	SLKKLVLRKL	RRKALDLESL	SLLGFVYKLE
GNMNEALEYY	ERALRLAADF	ENSVRQGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chebath J., Merlin G., Metz R., Benech P., Revel M. (1983). Interferon-induced 56,000 Mr protein and its mRNA in human cells: molecular cloning and partial sequence of the cDNA. Nucleic Acids Res. 11: 1213—1226. PMID 6186990 DOI:10.1093/nar/11.5.1213
Wathelet M.G., Clauss I.M., Nols C.B., Content J., Huez G.A. (1987). New inducers revealed by the promoter sequence analysis of two interferon-activated human genes. Eur. J. Biochem. 169: 313—321. PMID 3121313 DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13614.x
Wathelet M.G., Clauss I.M., Content J., Huez G.A. (1988). The IFI-56K and IFI-54K interferon-inducible human genes belong to the same gene family. FEBS Lett. 231: 164—171. PMID 3360121 DOI:10.1016/0014-5793(88)80724-5
Zhao C., Denison C., Huibregtse J.M., Gygi S.P., Krug R.M. (2005). Human ISG15 conjugation targets both IFN-induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10200—10205. PMID 16009940 DOI:10.1073/pnas.0504754102
Terenzi F., Pal S., Sen G.C. (2005). Induction and mode of action of the viral stress-inducible murine proteins, P56 and P54. Virology. 340: 116—124. PMID 16023166 DOI:10.1016/j.virol.2005.06.011

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5407 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P09914 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.