IFIT2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4G1T

Ідентифікатори

Символи

IFIT2, G10P2, GARG-39, IFI-54, IFI-54K, IFI54, IFIT-2, ISG-54 K, ISG-54K, ISG54, P54, cig42, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2, ISG-54

Зовнішні ІД

OMIM: 147040 MGI: 99449 HomoloGene: 1187 GeneCards: IFIT2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз • positive regulation of apoptotic process • response to virus • вроджений імунітет • defense response to virus • negative regulation of protein binding • apoptotic mitochondrial changes • type I interferon signaling pathway • cellular response to interferon-alpha • процес імунної системи
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3433


15958

Ensembl


ENSG00000119922


ENSMUSG00000045932

UniProt


P09913


Q64112

RefSeq (мРНК)


NM_001547


NM_008332 NM_001355262

RefSeq (білок)


NP_001538


NP_032358 NP_001342191

Локус (UCSC)

Хр. 10: 89.28 – 89.31 Mb

Хр. 19: 34.53 – 34.55 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFIT2 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 54 632^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSENNKNSLE	SSLRQLKCHF	TWNLMEGENS	LDDFEDKVFY	RTEFQNREFK
ATMCNLLAYL	KHLKGQNEAA	LECLRKAEEL	IQQEHADQAE	IRSLVTWGNY
AWVYYHMGRL	SDVQIYVDKV	KHVCEKFSSP	YRIESPELDC	EEGWTRLKCG
GNQNERAKVC	FEKALEKKPK	NPEFTSGLAI	ASYRLDNWPP	SQNAIDPLRQ
AIRLNPDNQY	LKVLLALKLH	KMREEGEEEG	EGEKLVEEAL	EKAPGVTDVL
RSAAKFYRRK	DEPDKAIELL	KKALEYIPNN	AYLHCQIGCC	YRAKVFQVMN
LRENGMYGKR	KLLELIGHAV	AHLKKADEAN	DNLFRVCSIL	ASLHALADQY
EDAEYYFQKE	FSKELTPVAK	QLLHLRYGNF	QLYQMKCEDK	AIHHFIEGVK
INQKSREKEK	MKDKLQKIAK	MRLSKNGADS	EALHVLAFLQ	ELNEKMQQAD
EDSERGLESG	SLIPSASSWN	GE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Levy D., Larner A., Chaudhuri A., Babiss L.E., Darnell J.E. Jr. (1986). Interferon-stimulated transcription: isolation of an inducible gene and identification of its regulatory region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 8929—8933. PMID 3466167 DOI:10.1073/pnas.83.23.8929
Wathelet M.G., Clauss I.M., Content J., Huez G.A. (1988). Regulation of two interferon-inducible human genes by interferon, poly(rI).poly(rC) and viruses. Eur. J. Biochem. 174: 323—329. PMID 2454816 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14101.x
Wathelet M.G., Clauss I.M., Content J., Huez G.A. (1988). The IFI-56K and IFI-54K interferon-inducible human genes belong to the same gene family. FEBS Lett. 231: 164—171. PMID 3360121 DOI:10.1016/0014-5793(88)80724-5
Terenzi F., Hui D.J., Merrick W.C., Sen G.C. (2006). Distinct induction patterns and functions of two closely related interferon-inducible human genes, ISG54 and ISG56. J. Biol. Chem. 281: 34064—34071. PMID 16973618 DOI:10.1074/jbc.M605771200
Stawowczyk M., Van Scoy S., Kumar K.P., Reich N.C. (2011). The interferon stimulated gene 54 promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 7257—7266. PMID 21190939 DOI:10.1074/jbc.M110.207068
Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 DOI:10.1089/jir.2010.0101

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5409 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P09913 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.