IFNA5 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

IFNA5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3OQ3

Ідентифікатори

Символи

IFNA5, IFN-alpha-5, IFN-alphaG, INA5, INFA5, leIF G, interferon alpha 5

Зовнішні ІД

OMIM: 147565 MGI: 2667155 HomoloGene: 117697 GeneCards: IFNA5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • type I interferon receptor binding • GO:0005145 cytokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• natural killer cell activation involved in immune response • B cell differentiation • defense response • B cell proliferation • зсідання крові • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • humoral immune response • адаптивна імунна відповідь • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • response to exogenous dsRNA • T cell activation involved in immune response • вроджений імунітет • cytokine-mediated signaling pathway • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3442


230396

Ensembl


ENSG00000147873


ENSMUSG00000063376

UniProt


P01569


Q80SU4

RefSeq (мРНК)


NM_002169


NM_177347

RefSeq (білок)


NP_002160


NP_796321

Локус (UCSC)

Хр. 9: 21.3 – 21.31 Mb

Хр. 4: 88.56 – 88.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFNA5 (англ. Interferon alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 189 амінокислот, а молекулярна маса — 21 942^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALPFVLLMA	LVVLNCKSIC	SLGCDLPQTH	SLSNRRTLMI	MAQMGRISPF
SCLKDRHDFG	FPQEEFDGNQ	FQKAQAISVL	HEMIQQTFNL	FSTKDSSATW
DETLLDKFYT	ELYQQLNDLE	ACMMQEVGVE	DTPLMNVDSI	LTVRKYFQRI
TLYLTEKKYS	PCAWEVVRAE	IMRSFSLSAN	LQERLRRKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5426 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P01569 (англ.) . Архів оригіналу за 5 серпня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.