IL16

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1I16, 1X6D, 5FB8

Ідентифікатори

Символи

IL16, LCF, NPRprIL-16, IL-16, interleukin 16

Зовнішні ІД

OMIM: 603035 MGI: 1270855 HomoloGene: 18157 GeneCards: IL16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • CD4 receptor binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • extracellular region • міжклітинний простір • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• induction of positive chemotaxis • хемотаксис • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • leukocyte chemotaxis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • transcription, DNA-templated • regulation of calcium ion transport • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3603


16170

Ensembl


ENSG00000172349


ENSMUSG00000001741

UniProt


Q14005


O54824

RefSeq (мРНК)

NM_001172128 NM_004513 NM_172217 NM_001352684 NM_001352685
NM_001352686


NM_010551 NM_001360087 NM_001360088 NM_001360089

RefSeq (білок)

NP_001165599 NP_004504 NP_757366 NP_001339613 NP_001339614
NP_001339615


NP_034681 NP_001347016 NP_001347017 NP_001347018

Локус (UCSC)

Хр. 15: 81.16 – 81.31 Mb

Хр. 7: 83.29 – 83.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IL16 (англ. Interleukin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 332 амінокислот, а молекулярна маса — 141 752^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESHSRAGKS	RKSAKFRSIS	RSLMLCNAKT	SDDGSSPDEK	YPDPFEISLA
QGKEGIFHSS	VQLADTSEAG	PSSVPDLALA	SEAAQLQAAG	NDRGKTCRRI
FFMKESSTAS	SREKPGKLEA	QSSNFLFPKA	CHQRARSNST	SVNPYCTREI
DFPMTKKSAA	PTDRQPYSLC	SNRKSLSQQL	DCPAGKAAGT	SRPTRSLSTA
QLVQPSGGLQ	ASVISNIVLM	KGQAKGLGFS	IVGGKDSIYG	PIGIYVKTIF
AGGAAAADGR	LQEGDEILEL	NGESMAGLTH	QDALQKFKQA	KKGLLTLTVR
TRLTAPPSLC	SHLSPPLCRS	LSSSTCITKD	SSSFALESPS	APISTAKPNY
RIMVEVSLQK	EAGVGLGIGL	CSVPYFQCIS	GIFVHTLSPG	SVAHLDGRLR
CGDEIVEISD	SPVHCLTLNE	VYTILSHCDP	GPVPIIVSRH	PDPQVSEQQL
KEAVAQAVEN	TKFGKERHQW	SLEGVKRLES	SWHGRPTLEK	EREKNSAPPH
RRAQKVMIRS	SSDSSYMSGS	PGGSPGSGSA	EKPSSDVDIS	THSPSLPLAR
EPVVLSIASS	RLPQESPPLP	ESRDSHPPLR	LKKSFEILVR	KPMSSKPKPP
PRKYFKSDSD	PQKSLEEREN	SSCSSGHTPP	TCGQEARELL	PLLLPQEDTA
GRSPSASAGC	PGPGIGPQTK	SSTEGEPGWR	RASPVTQTSP	IKHPLLKRQA
RMDYSFDTTA	EDPWVRISDC	IKNLFSPIMS	ENHGHMPLQP	NASLNEEEGT
QGHPDGTPPK	LDTANGTPKV	YKSADSSTVK	KGPPVAPKPA	WFRQSLKGLR
NRASDPRGLP	DPALSTQPAP	ASREHLGSHI	RASSSSSSIR	QRISSFETFG
SSQLPDKGAQ	RLSLQPSSGE	AAKPLGKHEE	GRFSGLLGRG	AAPTLVPQQP
EQVLSSGSPA	ASEARDPGVS	ESPPPGRQPN	QKTLPPGPDP	LLRLLSTQAE
ESQGPVLKMP	SQRARSFPLT	RSQSCETKLL	DEKTSKLYSI	SSQVSSAVMK
SLLCLPSSIS	CAQTPCIPKE	GASPTSSSNE	DSAANGSAET	SALDTGFSLN
LSELREYTEG	LTEAKEDDDG	DHSSLQSGQS	VISLLSSEEL	KKLIEEVKVL
DEATLKQLDG	IHVTILHKEE	GAGLGFSLAG	GADLENKVIT	VHRVFPNGLA
SQEGTIQKGN	EVLSINGKSL	KGTTHHDALA	ILRQAREPRQ	AVIVTRKLTP
EAMPDLNSST	DSAASASAAS	DVSVESTAEA	TVCTVTLEKM	SAGLGFSLEG
GKGSLHGDKP	LTINRIFKGA	ASEQSETVQP	GDEILQLGGT	AMQGLTRFEA
WNIIKALPDG	PVTIVIRRKS	LQSKETTAAG	DS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, хемотаксис, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bannert N., Avots A., Baier M., Serfling E., Kurth R. (1999). GA-binding protein factors, in concert with the coactivator CREB binding protein/p300, control the induction of the interleukin 16 promoter in T lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 1541—1546. PMID 9990060 DOI:10.1073/pnas.96.4.1541
Bannert N., Baier M., Werner A., Kurth R. (1996). Interleukin-16 or not?. Nature. 381: 30—30. PMID 8609984 DOI:10.1038/381030a0
Feske S., Giltnane J., Dolmetsch R., Staudt L.M., Rao A. (2001). Gene regulation mediated by calcium signals in T lymphocytes. Nat. Immunol. 2: 316—324. PMID 11276202 DOI:10.1038/86318
Wilson K.C., Cruikshank W.W., Center D.M., Zhang Y. (2002). Prointerleukin-16 contains a functional CcN motif that regulates nuclear localization. Biochemistry. 41: 14306—14312. PMID 12450396 DOI:10.1021/bi020163v

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5980 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14005 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.