IQSEC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QWM, 4C0A

Ідентифікатори

Символи

IQSEC1, ARF-GEP100, ARFGEP100, BRAG2, GEP100, IQ motif and Sec7 domain 1, IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 1, IDDSSBA

Зовнішні ІД

OMIM: 610166 MGI: 1196356 HomoloGene: 82429 GeneCards: IQSEC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity • lipid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of ARF protein signal transduction • actin cytoskeleton organization • positive regulation of keratinocyte migration • positive regulation of adherens junction organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9922


232227

Ensembl


ENSG00000144711


ENSMUSG00000034312

UniProt


Q6DN90


Q8R0S2

RefSeq (мРНК)


NM_001134382 NM_014869 NM_001330619 NM_001376938


NM_001134383 NM_001134384 NM_182784 NM_001356440

RefSeq (білок)


NP_001127854 NP_001317548 NP_055684 NP_001363867


NP_001127855 NP_001127856 NP_001343369

Локус (UCSC)

Хр. 3: 12.9 – 13.28 Mb

Хр. 6: 90.63 – 90.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IQSEC1 (англ. IQ motif and Sec7 domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 108 314^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWCLHCNSER	TQSLLELELD	SGVEGEAPSS	ETGTSLDSPS	AYPQGPLVPG
SSLSPDHYEH	TSVGAYGLYS	GPPGQQQRTR	RPKLQHSTSI	LRKQAEEEAI
KRSRSLSESY	ELSSDLQDKQ	VEMLERKYGG	RLVTRHAART	IQTAFRQYQM
NKNFERLRSS	MSENRMSRRI	VLSNMRMQFS	FEGPEKVHSS	YFEGKQVSVT
NDGSQLGALV	SPECGDLSEP	TTLKSPAPSS	DFADAITELE	DAFSRQVKSL
AESIDDALNC	RSLHTEEAPA	LDAARARDTE	PQTALHGMDH	RKLDEMTASY
SDVTLYIDEE	ELSPPLPLSQ	AGDRPSSTES	DLRLRAGGAA	PDYWALAHKE
DKADTDTSCR	STPSLERQEQ	RLRVEHLPLL	TIEPPSDSSV	DLSDRSERGS
LKRQSAYERS	LGGQQGSPKH	GPHSGAPKSL	PREEPELRPR	PPRPLDSHLA
INGSANRQSK	SESDYSDGDN	DSINSTSNSN	DTINCSSESS	SRDSLREQTL
SKQTYHKEAR	NSWDSPAFSN	DVIRKRHYRI	GLNLFNKKPE	KGVQYLIERG
FVPDTPVGVA	HFLLQRKGLS	RQMIGEFLGN	RQKQFNRDVL	DCVVDEMDFS
TMELDEALRK	FQAHIRVQGE	AQKVERLIEA	FSQRYCICNP	GVVRQFRNPD
TIFILAFAII	LLNTDMYSPN	VKPERKMKLE	DFIKNLRGVD	DGEDIPREML
MGIYERIRKR	ELKTNEDHVS	QVQKVEKLIV	GKKPIGSLHP	GLGCVLSLPH
RRLVCYCRLF	EVPDPNKPQK	LGLHQREIFL	FNDLLVVTKI	FQKKKNSVTY
SFRQSFSLYG	MQVLLFENQY	YPNGIRLTSS	VPGADIKVLI	NFNAPNPQDR
KKFTDDLRES	IAEVQEMEKH	RIESELEKQK	GVVRPSMSQC	SSLKKESGNG
TLSRACLDDS	YASGEGLKRS	ALSSSLRDLS	EAGKRGRRSS	AGSLESNVEF
QPFEPLQPSV	LCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29112 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6DN90 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.