IVNS1ABP

Ідентифікатори

Символи

IVNS1ABP, FLARA3, HSPC068, KLHL39, ND1, NS-1, NS1-BP, NS1BP, influenza virus NS1A binding protein, ARA3, IMD70

Зовнішні ІД

OMIM: 609209 MGI: 2152389 HomoloGene: 31384 GeneCards: IVNS1ABP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• actin cytoskeleton • spliceosomal complex • цитоскелет • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0022415 viral process • transcription by RNA polymerase III • Сплайсинг РНК • response to virus • negative regulation of protein ubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10625


117198

Ensembl


ENSG00000116679


ENSMUSG00000023150

UniProt


Q9Y6Y0


Q920Q8

RefSeq (мРНК)


NM_006469 NM_016389

NM_001039511 NM_001039512 NM_028582 NM_054102 NM_001359262
NM_001359263

RefSeq (білок)


NP_006460


NP_001034600 NP_001034601 NP_473443 NP_001346191 NP_001346192

Локус (UCSC)

Хр. 1: 185.3 – 185.32 Mb

Хр. 1: 151.22 – 151.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IVNS1ABP (англ. Influenza virus NS1A binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 642 амінокислот, а молекулярна маса — 71 729^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIPNGYLMFE	DENFIESSVA	KLNALRKSGQ	FCDVRLQVCG	HEMLAHRAVL
ACCSPYLFEI	FNSDSDPHGI	SHVKFDDLNP	EAVEVLLNYA	YTAQLKADKE
LVKDVYSAAK	KLKMDRVKQV	CGDYLLSRMD	VTSCISYRNF	ASCMGDSRLL
NKVDAYIQEH	LLQISEEEEF	LKLPRLKLEV	MLEDNVCLPS	NGKLYTKVIN
WVQRSIWENG	DSLEELMEEV	QTLYYSADHK	LLDGNLLDGQ	AEVFGSDDDH
IQFVQKKPPR	ENGHKQISSS	STGCLSSPNA	TVQSPKHEWK	IVASEKTSNN
TYLCLAVLDG	IFCVIFLHGR	NSPQSSPTST	PKLSKSLSFE	MQQDELIEKP
MSPMQYARSG	LGTAEMNGKL	IAAGGYNREE	CLRTVECYNP	HTDHWSFLAP
MRTPRARFQM	AVLMGQLYVV	GGSNGHSDDL	SCGEMYDSNI	DDWIPVPELR
TNRCNAGVCA	LNGKLYIVGG	SDPYGQKGLK	NCDVFDPVTK	LWTSCAPLNI
RRHQSAVCEL	GGYLYIIGGA	ESWNCLNTVE	RYNPENNTWT	LIAPMNVARR
GAGVAVLNGK	LFVCGGFDGS	HAISCVEMYD	PTRNEWKMMG	NMTSPRSNAG
IATVGNTIYA	VGGFDGNEFL	NTVEVYNLES	NEWSPYTKIF	QF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Dunham E.E., Stevens E.A., Glover E., Bradfield C.A. (2006). The aryl hydrocarbon receptor signaling pathway is modified through interactions with a Kelch protein. Mol. Pharmacol. 70: 8—15. PMID 16582008 DOI:10.1124/mol.106.024380
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Wolff T., O'Neill R.E., Palese P. (1998). NS1-Binding protein (NS1-BP): a novel human protein that interacts with the influenza A virus nonstructural NS1 protein is relocalized in the nuclei of infected cells. J. Virol. 72: 7170—7180. PMID 9696811

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16951 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6Y0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.