KDM7A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3KV5, 3KV6, 3KV9, 3KVA, 3KVB, 3U78 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KDM7A, JHDM1D, lysine demethylase 7A |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2443388 HomoloGene: 25281 GeneCards: KDM7A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • iron ion binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • histone H4-methyl-lysine-20 demethylase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • oxidoreductase activity • histone H3-tri/di-methyl-lysine-27 demethylase activity • histone demethylase activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K27 demethylation • histone H3-K9 demethylation • histone H4-K20 demethylation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • midbrain development • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 140.08 – 140.18 Mb | Хр. 6: 39.11 – 39.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KDM7A (англ. Lysine demethylase 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 106 557[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGAAAAVAA | | GAAAGAAAAA | | VSVAAPGRAS | | APPPPPPVYC | | VCRQPYDVNR |
FMIECDICKD | | WFHGSCVGVE | | EHHAVDIDLY | | HCPNCAVLHG | | SSLMKKRRNW |
HRHDYTEIDD | | GSKPVQAGTR | | TFIKELRSRV | | FPSADEIIIK | | MHGSQLTQRY |
LEKHGFDVPI | | MVPKLDDLGL | | RLPSPTFSVM | | DVERYVGGDK | | VIDVIDVARQ |
ADSKMTLHNY | | VKYFMNPNRP | | KVLNVISLEF | | SDTKMSELVE | | VPDIAKKLSW |
VENYWPDDSV | | FPKPFVQKYC | | LMGVQDSYTD | | FHIDFGGTSV | | WYHVLWGEKI |
FYLIKPTDEN | | LARYESWSSS | | VTQSEVFFGD | | KVDKCYKCVV | | KQGHTLFVPT |
GWIHAVLTSQ | | DCMAFGGNFL | | HNLNIGMQLR | | CYEMEKRLKT | | PDLFKFPFFE |
AICWFVAKNL | | LETLKELRED | | GFQPQTYLVQ | | GVKALHTALK | | LWMKKELVSE |
HAFEIPDNVR | | PGHLIKELSK | | VIRAIEEENG | | KPVKSQGIPI | | VCPVSRSSNE |
ATSPYHSRRK | | MRKLRDHNVR | | TPSNLDILEL | | HTREVLKRLE | | MCPWEEDILS |
SKLNGKFNKH | | LQPSSTVPEW | | RAKDNDLRLL | | LTNGRIIKDE | | RQPFADQSLY |
TADSENEEDK | | RRTKKAKMKI | | EESSGVEGVE | | HEESQKPLNG | | FFTRVKSELR |
SRSSGYSDIS | | ESEDSGPECT | | ALKSIFTTEE | | SESSGDEKKQ | | EITSNFKEES |
NVMRNFLQKS | | QKPSRSEIPI | | KRECPTSTST | | EEEAIQGMLS | | MAGLHYSTCL |
QRQIQSTDCS | | GERNSLQDPS | | SCHGSNHEVR | | QLYRYDKPVE | | CGYHVKTEDP |
DLRTSSWIKQ | | FDTSRFHPQD | | LSRSQKCIRK | | EGSSEISQRV | | QSRNYVDSSG |
SSLQNGKYMQ | | NSNLTSGACQ | | ISNGSLSPER | | PVGETSFSVP | | LHPTKRPASN |
PPPISNQATK | | GKRPKKGMAT | | AKQRLGKILK | | LNRNGHARFF | | V |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література
- Tsukada Y., Ishitani T., Nakayama K.I. (2010). KDM7 is a dual demethylase for histone H3 Lys 9 and Lys 27 and functions in brain development. Genes Dev. 24: 432—437. PMID 20194436 DOI:10.1101/gad.1864410
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22224 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6ZMT4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |