KDM7A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3KV5, 3KV6, 3KV9, 3KVA, 3KVB, 3U78

Ідентифікатори

Символи

KDM7A, JHDM1D, lysine demethylase 7A

Зовнішні ІД

MGI: 2443388 HomoloGene: 25281 GeneCards: KDM7A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • iron ion binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • histone H4-methyl-lysine-20 demethylase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • oxidoreductase activity • histone H3-tri/di-methyl-lysine-27 demethylase activity • histone demethylase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K27 demethylation • histone H3-K9 demethylation • histone H4-K20 demethylation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • midbrain development • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80853


338523

Ensembl


ENSG00000006459


ENSMUSG00000042599

UniProt


Q6ZMT4


Q3UWM4

RefSeq (мРНК)


NM_030647


NM_001033430

RefSeq (білок)


NP_085150


NP_001028602

Локус (UCSC)

Хр. 7: 140.08 – 140.18 Mb

Хр. 6: 39.11 – 39.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KDM7A (англ. Lysine demethylase 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 106 557^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGAAAAVAA	GAAAGAAAAA	VSVAAPGRAS	APPPPPPVYC	VCRQPYDVNR
FMIECDICKD	WFHGSCVGVE	EHHAVDIDLY	HCPNCAVLHG	SSLMKKRRNW
HRHDYTEIDD	GSKPVQAGTR	TFIKELRSRV	FPSADEIIIK	MHGSQLTQRY
LEKHGFDVPI	MVPKLDDLGL	RLPSPTFSVM	DVERYVGGDK	VIDVIDVARQ
ADSKMTLHNY	VKYFMNPNRP	KVLNVISLEF	SDTKMSELVE	VPDIAKKLSW
VENYWPDDSV	FPKPFVQKYC	LMGVQDSYTD	FHIDFGGTSV	WYHVLWGEKI
FYLIKPTDEN	LARYESWSSS	VTQSEVFFGD	KVDKCYKCVV	KQGHTLFVPT
GWIHAVLTSQ	DCMAFGGNFL	HNLNIGMQLR	CYEMEKRLKT	PDLFKFPFFE
AICWFVAKNL	LETLKELRED	GFQPQTYLVQ	GVKALHTALK	LWMKKELVSE
HAFEIPDNVR	PGHLIKELSK	VIRAIEEENG	KPVKSQGIPI	VCPVSRSSNE
ATSPYHSRRK	MRKLRDHNVR	TPSNLDILEL	HTREVLKRLE	MCPWEEDILS
SKLNGKFNKH	LQPSSTVPEW	RAKDNDLRLL	LTNGRIIKDE	RQPFADQSLY
TADSENEEDK	RRTKKAKMKI	EESSGVEGVE	HEESQKPLNG	FFTRVKSELR
SRSSGYSDIS	ESEDSGPECT	ALKSIFTTEE	SESSGDEKKQ	EITSNFKEES
NVMRNFLQKS	QKPSRSEIPI	KRECPTSTST	EEEAIQGMLS	MAGLHYSTCL
QRQIQSTDCS	GERNSLQDPS	SCHGSNHEVR	QLYRYDKPVE	CGYHVKTEDP
DLRTSSWIKQ	FDTSRFHPQD	LSRSQKCIRK	EGSSEISQRV	QSRNYVDSSG
SSLQNGKYMQ	NSNLTSGACQ	ISNGSLSPER	PVGETSFSVP	LHPTKRPASN
PPPISNQATK	GKRPKKGMAT	AKQRLGKILK	LNRNGHARFF	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

Tsukada Y., Ishitani T., Nakayama K.I. (2010). KDM7 is a dual demethylase for histone H3 Lys 9 and Lys 27 and functions in brain development. Genes Dev. 24: 432—437. PMID 20194436 DOI:10.1101/gad.1864410

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22224 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6ZMT4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.