LARP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4ZC4, 5C0V | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LARP1, LARP, La ribonucleoprotein domain family member 1, La ribonucleoprotein 1, translational regulator, Lar1, Lhp1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612059 MGI: 1890165 HomoloGene: 9089 GeneCards: LARP1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • RNA cap binding • translation activator activity • translation initiation factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • eukaryotic initiation factor 4E binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA 5'-UTR binding • RNA binding • cadherin binding • RNA 7-methylguanosine cap binding • ribosomal small subunit binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • TORC1 complex • мембрана • Полісома • cytoplasmic stress granule • polysomal ribosome |
---|
Біологічний процес | • translational initiation • positive regulation of macroautophagy • positive regulation of viral genome replication • проліферація • TOR signaling • Біосинтез білків • positive regulation of translation • negative regulation of translation • TORC1 signaling • mRNA stabilization • cellular response to rapamycin • response to amino acid starvation • regulation of translation • negative regulation of translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3d/PBB_GE_LARP1_212193_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LARP1_212193_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8b/PBB_GE_LARP1_212137_at_fs.png/250px-PBB_GE_LARP1_212137_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a6/PBB_GE_LARP1_210966_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_LARP1_210966_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_015315 NM_033551 NM_001367713 NM_001367714 NM_001367715
| NM_001367716 NM_001367717 NM_001367718 NM_001367719 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_056130 NP_001354642 NP_001354643 NP_001354644 NP_001354645
| NP_001354646 NP_001354647 NP_001354648 NP_291029 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 154.68 – 154.82 Mb | Хр. 11: 57.9 – 57.95 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LARP1 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 123 510[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATQVEPLLP | | GGATLLQAEE | | HGGLVRKKPP | | PAPEGKGEPG | | PNDVRGGEPD |
GSARRPRPPC | | AKPHKEGTGQ | | QERESPRPLQ | | LPGAEGPAIS | | DGEEGGGEPG |
AGGGAAGAAG | | AGRRDFVEAP | | PPKVNPWTKN | | ALPPVLTTVN | | GQSPPEHSAP |
AKVVRAAVPK | | QRKGSKVGDF | | GDAINWPTPG | | EIAHKSVQPQ | | SHKPQPTRKL |
PPKKDMKEQE | | KGEGSDSKES | | PKTKSDESGE | | EKNGDEDCQR | | GGQKKKGNKH |
KWVPLQIDMK | | PEVPREKLAS | | RPTRPPEPRH | | IPANRGEIKG | | SESATYVPVA |
PPTPAWQPEI | | KPEPAWHDQD | | ETSSVKSDGA | | GGARASFRGR | | GRGRGRGRGR |
GRGGTRTHFD | | YQFGYRKFDG | | VEGPRTPKYM | | NNITYYFDNV | | SSTELYSVDQ |
ELLKDYIKRQ | | IEYYFSVDNL | | ERDFFLRRKM | | DADGFLPITL | | IASFHRVQAL |
TTDISLIFAA | | LKDSKVVEIV | | DEKVRRREEP | | EKWPLPPIVD | | YSQTDFSQLL |
NCPEFVPRQH | | YQKETESAPG | | SPRAVTPVPT | | KTEEVSNLKT | | LPKGLSASLP |
DLDSENWIEV | | KKRPRPSPAR | | PKKSEESRFS | | HLTSLPQQLP | | SQQLMSKDQD |
EQEELDFLFD | | EEMEQMDGRK | | NTFTAWSDEE | | SDYEIDDRDV | | NKILIVTQTP |
HYMRRHPGGD | | RTGNHTSRAK | | MSAELAKVIN | | DGLFYYEQDL | | WAEKFEPEYS |
QIKQEVENFK | | KVNMISREQF | | DTLTPEPPVD | | PNQEVPPGPP | | RFQQVPTDAL |
ANKLFGAPEP | | STIARSLPTT | | VPESPNYRNT | | RTPRTPRTPQ | | LKDSSQTSRF |
YPVVKEGRTL | | DAKMPRKRKT | | RHSSNPPLES | | HVGWVMDSRE | | HRPRTASISS |
SPSEGTPTVG | | SYGCTPQSLP | | KFQHPSHELL | | KENGFTQHVY | | HKYRRRCLNE |
RKRLGIGQSQ | | EMNTLFRFWS | | FFLRDHFNKK | | MYEEFKQLAL | | EDAKEGYRYG |
LECLFRYYSY | | GLEKKFRLDI | | FKDFQEETVK | | DYEAGQLYGL | | EKFWAFLKYS |
KAKNLDIDPK | | LQEYLGKFRR | | LEDFRVDPPM | | GEEGNHKRHS | | VVAGGGGGEG |
RKRCPSQSSS | | RPAAMISQPP | | TPPTGQPVRE | | DAKWTSQHSN | | TQTLGK |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з La ribonucleoprotein 1, translational regulator переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29531 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6PKG0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |