LARP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4ZC4, 5C0V

Ідентифікатори

Символи

LARP1, LARP, La ribonucleoprotein domain family member 1, La ribonucleoprotein 1, translational regulator, Lar1, Lhp1

Зовнішні ІД

OMIM: 612059 MGI: 1890165 HomoloGene: 9089 GeneCards: LARP1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA cap binding • translation activator activity • translation initiation factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • eukaryotic initiation factor 4E binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA 5'-UTR binding • RNA binding • cadherin binding • RNA 7-methylguanosine cap binding • ribosomal small subunit binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • TORC1 complex • мембрана • Полісома • cytoplasmic stress granule • polysomal ribosome
Біологічний процес	• translational initiation • positive regulation of macroautophagy • positive regulation of viral genome replication • проліферація • TOR signaling • Біосинтез білків • positive regulation of translation • negative regulation of translation • TORC1 signaling • mRNA stabilization • cellular response to rapamycin • response to amino acid starvation • regulation of translation • negative regulation of translational initiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23367


73158

Ensembl


ENSG00000155506


ENSMUSG00000037331

UniProt


Q6PKG0


Q6ZQ58

RefSeq (мРНК)

NM_015315 NM_033551 NM_001367713 NM_001367714 NM_001367715
NM_001367716 NM_001367717 NM_001367718 NM_001367719


NM_028451

RefSeq (білок)

NP_056130 NP_001354642 NP_001354643 NP_001354644 NP_001354645
NP_001354646 NP_001354647 NP_001354648 NP_291029


NP_082727

Локус (UCSC)

Хр. 5: 154.68 – 154.82 Mb

Хр. 11: 57.9 – 57.95 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LARP1 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 123 510^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATQVEPLLP	GGATLLQAEE	HGGLVRKKPP	PAPEGKGEPG	PNDVRGGEPD
GSARRPRPPC	AKPHKEGTGQ	QERESPRPLQ	LPGAEGPAIS	DGEEGGGEPG
AGGGAAGAAG	AGRRDFVEAP	PPKVNPWTKN	ALPPVLTTVN	GQSPPEHSAP
AKVVRAAVPK	QRKGSKVGDF	GDAINWPTPG	EIAHKSVQPQ	SHKPQPTRKL
PPKKDMKEQE	KGEGSDSKES	PKTKSDESGE	EKNGDEDCQR	GGQKKKGNKH
KWVPLQIDMK	PEVPREKLAS	RPTRPPEPRH	IPANRGEIKG	SESATYVPVA
PPTPAWQPEI	KPEPAWHDQD	ETSSVKSDGA	GGARASFRGR	GRGRGRGRGR
GRGGTRTHFD	YQFGYRKFDG	VEGPRTPKYM	NNITYYFDNV	SSTELYSVDQ
ELLKDYIKRQ	IEYYFSVDNL	ERDFFLRRKM	DADGFLPITL	IASFHRVQAL
TTDISLIFAA	LKDSKVVEIV	DEKVRRREEP	EKWPLPPIVD	YSQTDFSQLL
NCPEFVPRQH	YQKETESAPG	SPRAVTPVPT	KTEEVSNLKT	LPKGLSASLP
DLDSENWIEV	KKRPRPSPAR	PKKSEESRFS	HLTSLPQQLP	SQQLMSKDQD
EQEELDFLFD	EEMEQMDGRK	NTFTAWSDEE	SDYEIDDRDV	NKILIVTQTP
HYMRRHPGGD	RTGNHTSRAK	MSAELAKVIN	DGLFYYEQDL	WAEKFEPEYS
QIKQEVENFK	KVNMISREQF	DTLTPEPPVD	PNQEVPPGPP	RFQQVPTDAL
ANKLFGAPEP	STIARSLPTT	VPESPNYRNT	RTPRTPRTPQ	LKDSSQTSRF
YPVVKEGRTL	DAKMPRKRKT	RHSSNPPLES	HVGWVMDSRE	HRPRTASISS
SPSEGTPTVG	SYGCTPQSLP	KFQHPSHELL	KENGFTQHVY	HKYRRRCLNE
RKRLGIGQSQ	EMNTLFRFWS	FFLRDHFNKK	MYEEFKQLAL	EDAKEGYRYG
LECLFRYYSY	GLEKKFRLDI	FKDFQEETVK	DYEAGQLYGL	EKFWAFLKYS
KAKNLDIDPK	LQEYLGKFRR	LEDFRVDPPM	GEEGNHKRHS	VVAGGGGGEG
RKRCPSQSSS	RPAAMISQPP	TPPTGQPVRE	DAKWTSQHSN	TQTLGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з La ribonucleoprotein 1, translational regulator переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29531 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6PKG0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.