LCOR

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2COB

Ідентифікатори

Символи

LCOR, MLR2, ligand dependent nuclear receptor corepressor, C10orf12

Зовнішні ІД

OMIM: 607698 HomoloGene: 22914 GeneCards: LCOR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84458


365462

Ensembl


ENSG00000196233


н/д

UniProt


Q96JN0


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001170765 NM_001170766 NM_001346516 NM_015652 NM_032440

XM_006223759 XM_006231418 XM_008760470 XM_008760471 XM_008760472
XM_008774844 XM_008774845

RefSeq (білок)


NP_001164236 NP_001164237 NP_001333445 NP_115816


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 96.83 – 97 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LCOR (англ. Ligand dependent nuclear receptor corepressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 47 007^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRMIQQFAA	EYTSKNSSTQ	DPSQPNSTKN	QSLPKASPVT	TSPTAATTQN
PVLSKLLMAD	QDSPLDLTVR	KSQSEPSEQD	GVLDLSTKKS	PCAGSTSLSH
SPGCSSTQGN	GRPGRPSQYR	PDGLRSGDGV	PPRSLQDGTR	EGFGHSTSLK
VPLARSLQIS	EELLSRNQLS	TAASLGPSGL	QNHGQHLILS	REASWAKPHY
EFNLSRMKFR	GNGALSNISD	LPFLAENSAF	PKMALQAKQD	GKKDVSHSSP
VDLKIPQVRG	MDLSWESRTG	DQYSYSSLVM	GSQTESALSK	KLRAILPKQS
RKSMLDAGPD	SWGSDAEQST	SGQPYPTSDQ	EGDPGSKQPR	KKRGRYRQYN
SEILEEAISV	VMSGKMSVSK	AQSIYGIPHS	TLEYKVKERL	GTLKNPPKKK
MKLMRSEGPD	VSVKIELDPQ	GEAAQSANES	KNE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29503 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96JN0 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.