LGALS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1GZW, 1W6M, 1W6N, 1W6O, 1W6P, 1W6Q, 2KM2, 2ZKN, 3OY8, 3OYW, 3T2T, 3W58, 3W59, 4XBL, 4Q27, 4Q1R, 4Q1P, 4Q2F, 4Q26, 4Y24, 4Y1Z, 4Y22, 4Y20, 4Y1U, 4Y1X, 4Y1Y, 4Y1V

Ідентифікатори

Символи

LGALS1, GAL1, GBP, galectin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 150570 MGI: 96777 HomoloGene: 7399 GeneCards: LGALS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • lactose binding • signal transducer activity • laminin binding • carbohydrate binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • внутрішньоклітинний • cell surface • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region
Біологічний процес	• negative regulation of cell-substrate adhesion • regulation of apoptotic process • negative regulation of neuron projection development • T cell costimulation • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of viral entry into host cell • plasma cell differentiation • positive regulation of erythrocyte aggregation • response to axon injury • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of dendritic cell differentiation • myoblast differentiation • cellular response to glucose stimulus • GO:0097285 апоптоз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to isolation stress • посттрансляційна модифікація
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3956


16852

Ensembl


ENSG00000100097


ENSMUSG00000068220

UniProt


P09382


P16045

RefSeq (мРНК)


NM_002305


NM_008495

RefSeq (білок)


NP_002296


NP_032521

Локус (UCSC)

Хр. 22: 37.68 – 37.68 Mb

Хр. 15: 78.81 – 78.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LGALS1 (англ. Galectin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 135 амінокислот, а молекулярна маса — 14 716^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MACGLVASNL	NLKPGECLRV	RGEVAPDAKS	FVLNLGKDSN	NLCLHFNPRF
NAHGDANTIV	CNSKDGGAWG	TEQREAVFPF	QPGSVAEVCI	TFDQANLTVK
LPDGYEFKFP	NRLNLEAINY	MAADGDFKIK	CVAFD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як апоптоз. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Hirabayashi J., Ayaki K., Soma G., Kasai K. (1989). Cloning and nucleotide sequence of a full-length cDNA for human 14 kDa beta-galactoside-binding lectin. Biochim. Biophys. Acta. 1008: 85—91. PMID 2719964 DOI:10.1016/0167-4781(89)90173-5
Abbott W.M., Feizi T. (1989). Evidence that the 14 kDa soluble beta-galactoside-binding lectin in man is encoded by a single gene. Biochem. J. 259: 291—294. PMID 2719646 DOI:10.1042/bj2590291
Gitt M.A., Barondes S.H. (1991). Genomic sequence and organization of two members of a human lectin gene family. Biochemistry. 30: 82—89. PMID 1988031 DOI:10.1021/bi00215a013
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Castronovo V., Luyten F., van den Brule F., Sobel M.E. (1992). Identification of a 14-kDa laminin binding protein (HLBP14) in human melanoma cells that is identical to the 14-kDa galactoside binding lectin. Arch. Biochem. Biophys. 297: 132—138. PMID 1386213 DOI:10.1016/0003-9861(92)90650-L
Sharma A., Chemelli R., Allen H.J. (1990). Human splenic galaptin: physicochemical characterization. Biochemistry. 29: 5309—5314. PMID 2383549 DOI:10.1021/bi00474a014

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6561 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P09382 (англ.) . Архів оригіналу за 26 січня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.