LHX3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JTN, 2RGT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LHX3, CPHD3, LIM3, M2-LIM homeobox 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600577 MGI: 102673 HomoloGene: 7814 GeneCards: LHX3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • ventral spinal cord interneuron specification • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord association neuron differentiation • spinal cord motor neuron cell fate specification • placenta development • lung development • negative regulation of apoptotic process • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • animal organ morphogenesis • inner ear development • medial motor column neuron differentiation • motor neuron axon guidance • dorsal/ventral pattern formation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3d/PBB_GE_LHX3_221670_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LHX3_221670_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_014564 NM_178138 NM_001363746 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_055379 NP_835258 NP_001350675 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 136.2 – 136.21 Mb | Хр. 2: 26.09 – 26.1 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LHX3 (англ. LIM homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 43 358[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLLETGLERD | | RARPGAAAVC | | TLGGTREIPL | | CAGCDQHILD | | RFILKALDRH |
WHSKCLKCSD | | CHTPLAERCF | | SRGESVYCKD | | DFFKRFGTKC | | AACQLGIPPT |
QVVRRAQDFV | | YHLHCFACVV | | CKRQLATGDE | | FYLMEDSRLV | | CKADYETAKQ |
REAEATAKRP | | RTTITAKQLE | | TLKSAYNTSP | | KPARHVREQL | | SSETGLDMRV |
VQVWFQNRRA | | KEKRLKKDAG | | RQRWGQYFRN | | MKRSRGGSKS | | DKDSVQEGQD |
SDAEVSFPDE | | PSLAEMGPAN | | GLYGSLGEPT | | QALGRPSGAL | | GNFSLEHGGL |
AGPEQYRELR | | PGSPYGVPPS | | PAAPQSLPGP | | QPLLSSLVYP | | DTSLGLVPSG |
APGGPPPMRV | | LAGNGPSSDL | | STGSSGGYPD | | FPASPASWLD | | EVDHAQF |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Parker G.E., West B.E., Witzmann F.A., Rhodes S.J. (2005). Serine/threonine/tyrosine phosphorylation of the LHX3 LIM-homeodomain transcription factor. J. Cell. Biochem. 94: 67—80. PMID 15517599 DOI:10.1002/jcb.20287
- Colvin S.C., Malik R.E., Showalter A.D., Sloop K.W., Rhodes S.J. (2011). Model of pediatric pituitary hormone deficiency separates the endocrine and neural functions of the LHX3 transcription factor in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 173—178. PMID 21149718 DOI:10.1073/pnas.1009501108
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6595 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBR4 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |