LHX6

Ідентифікатори

Символи

LHX6, LHX6.1, LIM homeobox 6, hLHX6

Зовнішні ІД

OMIM: 608215 MGI: 1306803 HomoloGene: 7401 GeneCards: LHX6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • cerebral cortex GABAergic interneuron migration • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cerebral cortex radially oriented cell migration • cerebral cortex tangential migration • cell maturation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • forebrain neuron development • neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26468


16874

Ensembl


ENSG00000106852


ENSMUSG00000026890

UniProt


Q9UPM6


Q9R1R0

RefSeq (мРНК)

NM_001242333 NM_001242334 NM_001242335 NM_014368 NM_199160
NM_001348190


NM_001083125 NM_001083126 NM_001083127 NM_008500 NM_001355125

RefSeq (білок)

NP_001229262 NP_001229263 NP_001229264 NP_055183 NP_954629
NP_001335119 NP_001229263.1


NP_001076594 NP_001076595 NP_001076596 NP_032526 NP_001342054

Локус (UCSC)

Хр. 9: 122.2 – 122.23 Mb

Хр. 2: 35.97 – 36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LHX6 (англ. LIM homeobox 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 40 045^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQPGSGCKA	TTRCLEGTAP	PAMAQSDAEA	LAGALDKDEG	QASPCTPSTP
SVCSPPSAAS	SVPSAGKNIC	SSCGLEILDR	YLLKVNNLIW	HVRCLECSVC
RTSLRQQNSC	YIKNKEIFCK	MDYFSRFGTK	CARCGRQIYA	SDWVRRARGN
AYHLACFACF	SCKRQLSTGE	EFGLVEEKVL	CRIHYDTMIE	NLKRAAENGN
GLTLEGAVPS	EQDSQPKPAK	RARTSFTAEQ	LQVMQAQFAQ	DNNPDAQTLQ
KLADMTGLSR	RVIQVWFQNC	RARHKKHTPQ	HPVPPSGAPP	SRLPSALSDD
IHYTPFSSPE	RARMVTLHGY	IESQVQCGQV	HCRLPYTAPP	VHLKADMDGP
LSNRGEKVIL	FQY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kimura N., Ueno M., Nakashima K., Taga T. (1999). A brain region-specific gene product Lhx6.1 interacts with Ldb1 through tandem LIM-domains. J. Biochem. 126: 180—187. PMID 10393337 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022420
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21735 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UPM6 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.