LIMCH1

Ідентифікатори

Символи

LIMCH1, LIMCH1A, LMO7B, LIM and calponin homology domains 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617750 MGI: 1924819 HomoloGene: 18953 GeneCards: LIMCH1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • зв'язування з іоном металу • myosin II head/neck binding
Клітинна компонента	• stress fiber • myosin II complex • цитоплазма • цитоскелет
Біологічний процес	• actomyosin structure organization • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of cell migration • positive regulation of stress fiber assembly • regulation of focal adhesion assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22998


77569

Ensembl


ENSG00000064042


ENSMUSG00000037736

UniProt


Q9UPQ0


Q3UH68

RefSeq (мРНК)

NM_001112717 NM_001112718 NM_001112719 NM_001112720 NM_001289122
NM_001289124 NM_014988 NM_001330672 NM_001330674 NM_001330784 NM_001330786 NM_001330787 NM_001330788 NM_001330789 NM_001330790 NM_001330791 NM_001330792 NM_001330793 NM_001330982 NM_001330983


NM_001001980 NM_001256122 NM_001368863

RefSeq (білок)

NP_001106188 NP_001106189 NP_001106190 NP_001106191 NP_001276051
NP_001276053 NP_001317601 NP_001317603 NP_001317713 NP_001317715 NP_001317716 NP_001317717 NP_001317718 NP_001317719 NP_001317720 NP_001317721 NP_001317722 NP_001317911 NP_001317912 NP_055803

NP_001001980 NP_001243051 NP_001355792 NP_001388339 NP_001388340
NP_001388341 NP_001388342 NP_001388343 NP_001388344 NP_001388345 NP_001388346 NP_001388347 NP_001388348 NP_001388349 NP_001388350 NP_001388351 NP_001388352 NP_001388353 NP_001388354 NP_001388355 NP_001388356 NP_001390437 NP_001390438

Локус (UCSC)

Хр. 4: 41.36 – 41.7 Mb

Хр. 5: 66.75 – 67.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIMCH1 (англ. LIM and calponin homology domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 083 амінокислот, а молекулярна маса — 121 867^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MACPALGLEA	LQPLQPEPPP	EPAFSEAQKW	IEQVTGRSFG	DKDFRTGLEN
GILLCELLNA	IKPGLVKKIN	RLPTPIAGLD	NIILFLRGCK	ELGLKESQLF
DPSDLQDTSN	RVTVKSLDYS	RKLKNVLVTI	YWLGKAANSC	TSYSGTTLNL
KEFEGLLAQM	RKDTDDIESP	KRSIRDSGYI	DCWDSERSDS	LSPPRHGRDD
SFDSLDSFGS	RSRQTPSPDV	VLRGSSDGRG	SDSESDLPHR	KLPDVKKDDM
SARRTSHGEP	KSAVPFNQYL	PNKSNQTAYV	PAPLRKKKAE	REEYRKSWST
ATSPLGGERP	FRYGPRTPVS	DDAESTSMFD	MRCEEEAAVQ	PHSRARQEQL
QLINNQLREE	DDKWQDDLAR	WKSRRRSVSQ	DLIKKEEERK	KMEKLLAGED
GTSERRKSIK	TYREIVQEKE	RRERELHEAY	KNARSQEEAE	GILQQYIERF
TISEAVLERL	EMPKILERSH	STEPNLSSFL	NDPNPMKYLR	QQSLPPPKFT
ATVETTIARA	SVLDTSMSAG	SGSPSKTVTP	KAVPMLTPKP	YSQPKNSQDV
LKTFKVDGKV	SVNGETVHRE	EEKERECPTV	APAHSLTKSQ	MFEGVARVHG
SPLELKQDNG	SIEINIKKPN	SVPQELAATT	EKTEPNSQED	KNDGGKSRKG
NIELASSEPQ	HFTTTVTRCS	PTVAFVEFPS	SPQLKNDVSE	EKDQKKPENE
MSGKVELVLS	QKVVKPKSPE	PEATLTFPFL	DKMPEANQLH	LPNLNSQVDS
PSSEKSPVMT	PQFKFWAWDP	EEERRRQEKW	QQEQERLLQE	RYQKEQDKLK
EEWEKAQKEV	EEEERRYYEE	ERKIIEDTVV	PFTVSSSSAD	QLSTSSSMTE
GSGTMNKIDL	GNCQDEKQDR	RWKKSFQGDD	SDLLLKTRES	DRLEEKGSLT
EGALAHSGNP	VSKGVHEDHQ	LDTEAGAPHC	GTNPQLAQDP	SQNQQTSNPT
HSSEDVKPKT	LPLDKSINHQ	IESPSERRKK	SPREHFQAGP	FSPCSPTPPG
QSPNRSISGK	KLCSSCGLPL	GKGAAMIIET	LNLYFHIQCF	RCGICKGQLG
DAVSGTDVRI	RNGLLNCNDC	YMRSRSAGQP	TTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29191 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UPQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.