LIMD1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LIMD1, LIM domains containing 1, LIM domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604543 MGI: 1352502 HomoloGene: 8478 GeneCards: LIMD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • RISC • focal adhesion • Адгезивні контакти • P-body • міжклітинні контакти • клітинне ядро • transcription regulator complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell-cell junction |
---|
Біологічний процес | • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • фосфорилювання • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • multicellular organism development • negative regulation of hippo signaling • gene silencing by miRNA • cytoskeleton organization • P-body assembly • regulation of cell shape • osteoblast development • Сайленсинг генів • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cell migration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e5/PBB_GE_LIMD1_218850_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LIMD1_218850_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 45.56 – 45.69 Mb | Хр. 9: 123.31 – 123.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LIMD1 (англ. LIM domains containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 676 амінокислот, а молекулярна маса — 72 190[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDKYDDLGLE | | ASKFIEDLNM | | YEASKDGLFR | | VDKGAGNNPE | | FEETRRVFAT |
KMAKIHLQQQ | | QQQLLQEETL | | PRGSRGPVNG | | GGRLGPQARW | | EVVGSKLTVD |
GAAKPPLAAS | | TGAPGAVTTL | | AAGQPPYPPQ | | EQRSRPYLHG | | TRHGSQDCGS |
RESLATSEMS | | AFHQPGPCED | | PSCLTHGDYY | | DNLSLASPKW | | GDKPGVSPSI |
GLSVGSGWPS | | SPGSDPPLPK | | PCGDHPLNHR | | QLSLSSSRSS | | EGSLGGQNSG |
IGGRSSEKPT | | GLWSTASSQR | | VSPGLPSPNL | | ENGAPAVGPV | | QPRTPSVSAP |
LALSCPRQGG | | LPRSNSGLGG | | EVSGVMSKPN | | VDPQPWFQDG | | PKSYLSSSAP |
SSSPAGLDGS | | QQGAVPGLGP | | KPGCTDLGTG | | PKLSPTSLVH | | PVMSTLPELS |
CKEGPLGWSS | | DGSLGSVLLD | | SPSSPRVRLP | | CQPLVPGPEL | | RPSAAELKLE |
ALTQRLEREM | | DAHPKADYFG | | ACVKCSKGVF | | GAGQACQAMG | | NLYHDTCFTC |
AACSRKLRGK | | AFYFVNGKVF | | CEEDFLYSGF | | QQSADRCFLC | | GHLIMDMILQ |
ALGKSYHPGC | | FRCVICNECL | | DGVPFTVDSE | | NKIYCVRDYH | | KVLAPKCAAC |
GLPILPPEGS | | DETIRVVSMD | | RDYHVECYHC | | EDCGLELNDE | | DGHRCYPLED |
HLFCHSCHVK | | RLEKRPSSTA | | LHQHHF |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Feng Y., Longmore G.D. (2005). The LIM protein Ajuba influences interleukin-1-induced NF-kappaB activation by affecting the assembly and activity of the protein kinase Czeta/p62/TRAF6 signaling complex. Mol. Cell. Biol. 25: 4010—4022. PMID 15870274 DOI:10.1128/MCB.25.10.4010-4022.2005
- Huggins C.J., Andrulis I.L. (2008). Cell cycle regulated phosphorylation of LIMD1 in cell lines and expression in human breast cancers. Cancer Lett. 267: 55—66. PMID 18439753 DOI:10.1016/j.canlet.2008.03.015
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6612 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UGP4 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |