LIMD1

Ідентифікатори

Символи

LIMD1, LIM domains containing 1, LIM domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604543 MGI: 1352502 HomoloGene: 8478 GeneCards: LIMD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • RISC • focal adhesion • Адгезивні контакти • P-body • міжклітинні контакти • клітинне ядро • transcription regulator complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell-cell junction
Біологічний процес	• response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • фосфорилювання • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • multicellular organism development • negative regulation of hippo signaling • gene silencing by miRNA • cytoskeleton organization • P-body assembly • regulation of cell shape • osteoblast development • Сайленсинг генів • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cell migration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8994


29806

Ensembl


ENSG00000144791


ENSMUSG00000025239

UniProt


Q9UGP4


Q9QXD8

RefSeq (мРНК)


NM_014240


NM_013860

RefSeq (білок)


NP_055055


NP_038888

Локус (UCSC)

Хр. 3: 45.56 – 45.69 Mb

Хр. 9: 123.31 – 123.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIMD1 (англ. LIM domains containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 676 амінокислот, а молекулярна маса — 72 190^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDKYDDLGLE	ASKFIEDLNM	YEASKDGLFR	VDKGAGNNPE	FEETRRVFAT
KMAKIHLQQQ	QQQLLQEETL	PRGSRGPVNG	GGRLGPQARW	EVVGSKLTVD
GAAKPPLAAS	TGAPGAVTTL	AAGQPPYPPQ	EQRSRPYLHG	TRHGSQDCGS
RESLATSEMS	AFHQPGPCED	PSCLTHGDYY	DNLSLASPKW	GDKPGVSPSI
GLSVGSGWPS	SPGSDPPLPK	PCGDHPLNHR	QLSLSSSRSS	EGSLGGQNSG
IGGRSSEKPT	GLWSTASSQR	VSPGLPSPNL	ENGAPAVGPV	QPRTPSVSAP
LALSCPRQGG	LPRSNSGLGG	EVSGVMSKPN	VDPQPWFQDG	PKSYLSSSAP
SSSPAGLDGS	QQGAVPGLGP	KPGCTDLGTG	PKLSPTSLVH	PVMSTLPELS
CKEGPLGWSS	DGSLGSVLLD	SPSSPRVRLP	CQPLVPGPEL	RPSAAELKLE
ALTQRLEREM	DAHPKADYFG	ACVKCSKGVF	GAGQACQAMG	NLYHDTCFTC
AACSRKLRGK	AFYFVNGKVF	CEEDFLYSGF	QQSADRCFLC	GHLIMDMILQ
ALGKSYHPGC	FRCVICNECL	DGVPFTVDSE	NKIYCVRDYH	KVLAPKCAAC
GLPILPPEGS	DETIRVVSMD	RDYHVECYHC	EDCGLELNDE	DGHRCYPLED
HLFCHSCHVK	RLEKRPSSTA	LHQHHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Feng Y., Longmore G.D. (2005). The LIM protein Ajuba influences interleukin-1-induced NF-kappaB activation by affecting the assembly and activity of the protein kinase Czeta/p62/TRAF6 signaling complex. Mol. Cell. Biol. 25: 4010—4022. PMID 15870274 DOI:10.1128/MCB.25.10.4010-4022.2005
Huggins C.J., Andrulis I.L. (2008). Cell cycle regulated phosphorylation of LIMD1 in cell lines and expression in human breast cancers. Cancer Lett. 267: 55—66. PMID 18439753 DOI:10.1016/j.canlet.2008.03.015

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6612 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UGP4 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.