LMO1

LMO1
Ідентифікатори
Символи LMO1, RBTN1, RHOM1, TTG1, LIM domain only 1
Зовнішні ІД OMIM: 186921 MGI: 102812 HomoloGene: 48101 GeneCards: LMO1
Пов'язані генетичні захворювання
alcohol abuse, нейробластома[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• зв'язування з іоном металу

Клітинна компонента

• клітинне ядро
• нуклеоплазма

Біологічний процес

• regulation of T cell homeostatic proliferation
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• regulation of hematopoietic stem cell differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4004
109594
Ensembl
ENSG00000166407
ENSMUSG00000036111
UniProt
P25800
Q924W9
RefSeq (мРНК)
NM_001270428
NM_002315
NM_001302205
NM_001302206
NM_057173
NM_001382564
RefSeq (білок)
NP_001257357
NP_002306
NP_001289134
NP_001289135
NP_476514
NP_001369493
Локус (UCSC) Хр. 11: 8.22 – 8.27 Mb Хр. 7: 108.74 – 108.77 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LMO1 (англ. LIM domain only 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 17 828[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMVLDKEDGVPMLSVQPKGKQKGCAGCNRKIKDRYLLKALDKYWHEDCLK
CACCDCRLGEVGSTLYTKANLILCRRDYLRLFGTTGNCAACSKLIPAFEM
VMRARDNVYHLDCFACQLCNQRFCVGDKFFLKNNMILCQMDYEEGQLNGT
FESQVQ

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • McGuire E.A., Davis A.R., Korsmeyer S.J. (1991). T-cell translocation gene 1 (Ttg-1) encodes a nuclear protein normally expressed in neural lineage cells. Blood. 77: 599—606. PMID 1703797
  • Boehm T., Spillantini M.G., Sofroniew M.V., Surani M.A., Rabbitts T.H. (1991). Developmentally regulated and tissue specific expression of mRNAs encoding the two alternative forms of the LIM domain oncogene rhombotin: evidence for thymus expression. Oncogene. 6: 695—703. PMID 2052354

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LMO1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6641 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P25800 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.