LRBA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1T77

Ідентифікатори

Символи

LRBA, BGL, CDC4L, CVID8, LAB300, LBA, LPS responsive beige-like anchor protein

Зовнішні ІД

OMIM: 606453 MGI: 1933162 HomoloGene: 36205 GeneCards: LRBA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • лізосома • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


987


80877

Ensembl


ENSG00000198589


ENSMUSG00000028080

UniProt


P50851


Q9ESE1

RefSeq (мРНК)


NM_001199282 NM_006726 NM_001364905 NM_001367550


NM_001077687 NM_001077688 NM_030695

RefSeq (білок)


NP_001186211 NP_006717 NP_001351834 NP_001354479


NP_001071155 NP_001071156 NP_109620

Локус (UCSC)

Хр. 4: 150.26 – 151.02 Mb

Хр. 3: 86.13 – 86.69 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LRBA (англ. LPS responsive beige-like anchor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 863 амінокислот, а молекулярна маса — 319 108^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASEDNRVPS	PPPTGDDGGG	GGREETPTEG	GALSLKPGLP	IRGIRMKFAV
LTGLVEVGEV	SNRDIVETVF	NLLVGGQFDL	EMNFIIQEGE	SINCMVDLLE
KCDITCQAEV	WSMFTAILKK	SIRNLQVCTE	VGLVEKVLGK	IEKVDNMIAD
LLVDMLGVLA	SYNLTVRELK	LFFSKLQGDK	GRWPPHAGKL	LSVLKHMPQK
YGPDAFFNFP	GKSAAAIALP	PIAKWPYQNG	FTFHTWLRMD	PVNNINVDKD
KPYLYCFRTS	KGLGYSAHFV	GGCLIVTSIK	SKGKGFQHCV	KFDFKPQKWY
MVTIVHIYNR	WKNSELRCYV	NGELASYGEI	TWFVNTSDTF	DKCFLGSSET
ADANRVFCGQ	MTAVYLFSEA	LNAAQIFAIY	QLGLGYKGTF	KFKAESDLFL
AEHHKLLLYD	GKLSSAIAFT	YNPRATDAQL	CLESSPKDNP	SIFVHSPHAL
MLQDVKAVLT	HSIQSAMHSI	GGVQVLFPLF	AQLDYRQYLS	DEIDLTICST
LLAFIMELLK	NSIAMQEQML	ACKGFLVIGY	SLEKSSKSHV	SRAVLELCLA
FSKYLSNLQN	GMPLLKQLCD	HVLLNPAIWI	HTPAKVQLML	YTYLSTEFIG
TVNIYNTIRR	VGTVLLIMHT	LKYYYWAVNP	QDRSGITPKG	LDGPRPNQKE
MLSLRAFLLM	FIKQLVMKDS	GVKEDELQAI	LNYLLTMHED	DNLMDVLQLL
VALMSEHPNS	MIPAFDQRNG	LRVIYKLLAS	KSEGIRVQAL	KAMGYFLKHL
APKRKAEVML	GHGLFSLLAE	RLMLQTNLIT	MTTYNVLFEI	LIEQIGTQVI
HKQHPDPDSS	VKIQNPQILK	VIATLLRNSP	QCPESMEVRR	AFLSDMIKLF
NNSRENRRSL	LQCSVWQEWM	LSLCYFNPKN	SDEQKITEMV	YAIFRILLYH
AVKYEWGGWR	VWVDTLSITH	SKVTFEIHKE	NLANIFREQQ	GKVDEEIGLC
SSTSVQAASG	IRRDINVSVG	SQQPDTKDSP	VCPHFTTNGN	ENSSIEKTSS
LESASNIELQ	TTNTSYEEMK	AEQENQELPD	EGTLEETLTN	ETRNADDLEV
SSDIIEAVAI	SSNSFITTGK	DSMTVSEVTA	SISSPSEEDA	SEMPEFLDKS
IVEEEEDDDY	VELKVEGSPT	EEANLPTELQ	DNSLSPAASE	AGEKLDMFGN
DDKLIFQEGK	PVTEKQTDTE	TQDSKDSGIQ	TMTASGSSAM	SPETTVSQIA
VESDLGQMLE	EGKKATNLTR	ETKLINDCHG	SVSEASSEQK	IAKLDVSNVA
TDTERLELKA	SPNVEAPQPH	RHVLEISRQH	EQPGQGIAPD	AVNGQRRDSR
STVFRIPEFN	WSQMHQRLLT	DLLFSIETDI	QMWRSHSTKT	VMDFVNSSDN
VIFVHNTIHL	ISQVMDNMVM	ACGGILPLLS	AATSATHELE	NIEPTQGLSI
EASVTFLQRL	ISLVDVLIFA	SSLGFTEIEA	EKSMSSGGIL	RQCLRLVCAV
AVRNCLECQQ	HSQLKTRGDK	ALKPMHSLIP	LGKSAAKSPV	DIVTGGISPV
RDLDRLLQDM	DINRLRAVVF	RDIEDSKQAQ	FLALAVVYFI	SVLMVSKYRD
ILEPQNERHS	QSCTETGSEN	ENVSLSEITP	AAFSTLTTAS	VEESESTSSA
RRRDSGIGEE	TATGLGSHVE	VTPHTAPPGV	SAGPDAISEV	LSTLSLEVNK
SPETKNDRGN	DLDTKATPSV	SVSKNVNVKD	ILRSLVNIPA	DGVTVDPALL
PPACLGALGD	LSVEQPVQFR	SFDRSVIVAA	KKSAVSPSTF	NTSIPTNAVS
VVSSVDSAQA	SDMGGESPGS	RSSNAKLPSV	PTVDSVSQDP	VSNMSITERL
EHALEKAAPL	LREIFVDFAP	FLSRTLLGSH	GQELLIEGTS	LVCMKSSSSV
VELVMLLCSQ	EWQNSIQKNA	GLAFIELVNE	GRLLSQTMKD	HLVRVANEAE
FILSRQRAED	IHRHAEFESL	CAQYSADKRE	DEKMCDHLIR	AAKYRDHVTA
TQLIQKIINI	LTDKHGAWGN	SAVSRPLEFW	RLDYWEDDLR	RRRRFVRNPL
GSTHPEATLK	TAVEHVCIFK	LRENSKATDE	DILAKGKQSI	RSQALGNQNS
ENEILLEGDD	DTLSSVDEKD	LENLAGPVSL	STPAQLVAPS	VVVKGTLSVT
SSELYFEVDE	EDPNFKKIDP	KILAYTEGLH	GKWLFTEIRS	IFSRRYLLQN
TALEIFMANR	VAVMFNFPDP	ATVKKVVNYL	PRVGVGTSFG	LPQTRRISLA
SPRQLFKASN	MTQRWQHREI	SNFEYLMFLN	TIAGRSYNDL	NQYPVFPWVI
TNYESEELDL	TLPTNFRDLS	KPIGALNPKR	AAFFAERYES	WEDDQVPKFH
YGTHYSTASF	VLAWLLRIEP	FTTYFLNLQG	GKFDHADRTF	SSISRAWRNS
QRDTSDIKEL	IPEFYYLPEM	FVNFNNYNLG	VMDDGTVVSD	VELPPWAKTS
EEFVHINRLA	LESEFVSCQL	HQWIDLIFGY	KQQGPEAVRA	LNVFYYLTYE
GAVNLNSITD	PVLREAVEAQ	IRSFGQTPSQ	LLIEPHPPRG	SAMQVSPLMF
TDKAQQDVIM	VLKFPSNSPV	THVAANTQPG	LATPAVITVT	ANRLFAVNKW
HNLPAHQGAV	QDQPYQLPVE	IDPLIASNTG	MHRRQITDLL	DQSIQVHSQC
FVITSDNRYI	LVCGFWDKSF	RVYSTDTGRL	IQVVFGHWDV	VTCLARSESY
IGGNCYILSG	SRDATLLLWY	WNGKCSGIGD	NPGSETAAPR	AILTGHDYEV
TCAAVCAELG	LVLSGSQEGP	CLIHSMNGDL	LRTLEGPENC	LKPKLIQASR
EGHCVIFYEN	GLFCTFSVNG	KLQATMETDD	NIRAIQLSRD	GQYLLTGGDR
GVVVVRQVSD	LKQLFAYPGC	DAGIRAMALS	YDQRCIISGM	ASGSIVLFYN
DFNRWHHEYQ	TRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі.

Література

Wang J.-W., Howson J., Haller E., Kerr W.G. (2001). Identification of a novel lipopolysaccharide-inducible gene with key features of both A kinase anchor proteins and chs1/beige proteins. J. Immunol. 166: 4586—4595. PMID 11254716 DOI:10.4049/jimmunol.166.7.4586
Feuchter A.E., Freeman J.D., Mager D.L. (1992). Strategy for detecting cellular transcripts promoted by human endogenous long terminal repeats: identification of a novel gene (CDC4L) with homology to yeast CDC4. Genomics. 13: 1237—1246. PMID 1505956 DOI:10.1016/0888-7543(92)90041-P

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1742 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P50851 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.