LRRC8A |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRRC8A, AGM5, LRRC8, SWELL1, leucine-rich repeat containing 8 family member A, leucine rich repeat containing 8 family member A, leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit A, HsLRRC8A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608360 MGI: 2652847 HomoloGene: 18617 GeneCards: LRRC8A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • anion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell surface • іонні канали • мембрана • цитоплазма • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • pre-B cell differentiation • response to osmotic stress • cell volume homeostasis • диференціація клітин • ion transport • anion transport • regulation of anion transport • anion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт • inorganic anion transport • taurine transport • aspartate transmembrane transport • protein hexamerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001127244 NM_001127245 NM_019594 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001120716 NP_001120717 NP_062540 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 128.88 – 128.92 Mb | Хр. 2: 30.13 – 30.15 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRRC8A (англ. Leucine rich repeat containing 8 family member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 810 амінокислот, а молекулярна маса — 94 199[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MIPVTELRYF | | ADTQPAYRIL | | KPWWDVFTDY | | ISIVMLMIAV | | FGGTLQVTQD |
KMICLPCKWV | | TKDSCNDSFR | | GWAAPGPEPT | | YPNSTILPTP | | DTGPTGIKYD |
LDRHQYNYVD | | AVCYENRLHW | | FAKYFPYLVL | | LHTLIFLACS | | NFWFKFPRTS |
SKLEHFVSIL | | LKCFDSPWTT | | RALSETVVEE | | SDPKPAFSKM | | NGSMDKKSST |
VSEDVEATVP | | MLQRTKSRIE | | QGIVDRSETG | | VLDKKEGEQA | | KALFEKVKKF |
RTHVEEGDIV | | YRLYMRQTII | | KVIKFILIIC | | YTVYYVHNIK | | FDVDCTVDIE |
SLTGYRTYRC | | AHPLATLFKI | | LASFYISLVI | | FYGLICMYTL | | WWMLRRSLKK |
YSFESIREES | | SYSDIPDVKN | | DFAFMLHLID | | QYDPLYSKRF | | AVFLSEVSEN |
KLRQLNLNNE | | WTLDKLRQRL | | TKNAQDKLEL | | HLFMLSGIPD | | TVFDLVELEV |
LKLELIPDVT | | IPPSIAQLTG | | LKELWLYHTA | | AKIEAPALAF | | LRENLRALHI |
KFTDIKEIPL | | WIYSLKTLEE | | LHLTGNLSAE | | NNRYIVIDGL | | RELKRLKVLR |
LKSNLSKLPQ | | VVTDVGVHLQ | | KLSINNEGTK | | LIVLNSLKKM | | ANLTELELIR |
CDLERIPHSI | | FSLHNLQEID | | LKDNNLKTIE | | EIISFQHLHR | | LTCLKLWYNH |
IAYIPIQIGN | | LTNLERLYLN | | RNKIEKIPTQ | | LFYCRKLRYL | | DLSHNNLTFL |
PADIGLLQNL | | QNLAITANRI | | ETLPPELFQC | | RKLRALHLGN | | NVLQSLPSRV |
GELTNLTQIE | | LRGNRLECLP | | VELGECPLLK | | RSGLVVEEDL | | FNTLPPEVKE |
RLWRADKEQA |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, диференціація клітин, ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Smits G., Kajava A.V. (2004). LRRC8 extracellular domain is composed of 17 leucine-rich repeats. Mol. Immunol. 41: 561—562. PMID 15183935 DOI:10.1016/j.molimm.2004.04.001
- Abascal F., Zardoya R. (2012). LRRC8 proteins share a common ancestor with pannexins, and may form hexameric channels involved in cell-cell communication. Bioessays. 34: 551—560. PMID 22532330 DOI:10.1002/bies.201100173
- Lee C.C., Freinkman E., Sabatini D.M., Ploegh H.L. (2014). The protein synthesis inhibitor blasticidin S enters mammalian cells via leucine-rich repeat-containing protein 8D. J. Biol. Chem. 289: 17124—17131. PMID 24782309 DOI:10.1074/jbc.M114.571257
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19027 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IWT6 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |