LSM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LSM1, CASM, YJL124C, LSM1 homolog, mRNA degradation associated |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607281 MGI: 1914457 HomoloGene: 40945 GeneCards: LSM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA cap binding • pre-mRNA binding • mRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • P-body • messenger ribonucleoprotein complex • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • клітинне ядро • цитоплазма • mRNA cap binding complex • Lsm1-7-Pat1 complex |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of neuron differentiation • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA processing • stem cell population maintenance • Сплайсинг РНК • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • histone mRNA catabolic process • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • RNA metabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/PBB_GE_LSM1_203534_at_fs.png/250px-PBB_GE_LSM1_203534_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 8: 26.28 – 26.29 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LSM1 (англ. LSM1 homolog, mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 133 амінокислот, а молекулярна маса — 15 179[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNYMPGTASL | | IEDIDKKHLV | | LLRDGRTLIG | | FLRSIDQFAN | | LVLHQTVERI |
HVGKKYGDIP | | RGIFVVRGEN | | VVLLGEIDLE | | KESDTPLQQV | | SIEEILEEQR |
VEQQTKLEAE | | KLKVQALKDR | | GLSIPRADTL | | DEY |
Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Salgado-Garrido J., Bragado-Nilsson E., Kandels-Lewis S., Seraphin B. (1999). Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin. EMBO J. 18: 3451—3462. PMID 10369684 DOI:10.1093/emboj/18.12.3451
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20472 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15116 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |