LSM6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LSM6, YDR378C, LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607286 MGI: 1925901 HomoloGene: 38271 GeneCards: LSM6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • small nuclear ribonucleoprotein complex • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро • P-body • U6 snRNP • ядерце • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome • Lsm2-8 complex |
---|
Біологічний процес | • tRNA processing • mRNA processing • Сплайсинг РНК • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • rRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • maturation of SSU-rRNA |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5d/PBB_GE_LSM6_205036_at_fs.png/250px-PBB_GE_LSM6_205036_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 146.18 – 146.2 Mb | Хр. 8: 79.53 – 79.55 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LSM6 (англ. LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 80 амінокислот, а молекулярна маса — 9 128[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLRKQTPSD | | FLKQIIGRPV | | VVKLNSGVDY | | RGVLACLDGY | | MNIALEQTEE |
YVNGQLKNKY | | GDAFIRGNNV | | LYISTQKRRM |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, процесинг рРНК, процесинг тРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Salgado-Garrido J., Bragado-Nilsson E., Kandels-Lewis S., Seraphin B. (1999). Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin. EMBO J. 18: 3451—3462. PMID 10369684 DOI:10.1093/emboj/18.12.3451
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ingelfinger D., Arndt-Jovin D.J., Luehrmann R., Achsel T. (2002). The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci. RNA. 8: 1489—1501. PMID 12515382
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17017 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P62312 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |