LST1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

LST1

Ідентифікатори

Символи

LST1, B144, D6S49E, LST-1, leukocyte specific transcript 1

Зовнішні ІД

OMIM: 109170 MGI: 1096324 HomoloGene: 136814 GeneCards: LST1

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7940


16988

Ensembl

ENSG00000230791 ENSG00000226182 ENSG00000231048 ENSG00000204482 ENSG00000206433
ENSG00000223465 ENSG00000234514 ENSG00000235915


ENSMUSG00000073412

UniProt


O00453


O08843

RefSeq (мРНК)

NM_001166538 NM_007161 NM_205837 NM_205838 NM_205839
NM_205840


NM_010734

RefSeq (білок)

NP_001160010 NP_009092 NP_995309 NP_995310 NP_995311
NP_995312


NP_034864

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.59 – 31.59 Mb

Хр. 17: 35.4 – 35.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LST1 (англ. Leukocyte specific transcript 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 97 амінокислот, а молекулярна маса — 10 792^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSRNDDICI		YGGLGLGGLL		LLAVVLLSAC		LCWLHRRVKR		LERSWAQGSS
EQELHYASLQ		RLPVPSSEGP		DLRGRDKRGT		KEDPRADYAC		IAENKPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пдтримання форми клітини, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mulcahy H., O'rourke K.P., Adams C., Molloy M.G., O'gara F. (2006). LST1 and NCR3 expression in autoimmune inflammation and in response to IFN-gamma, LPS and microbial infection. Immunogenetics. 57: 893—903. PMID 16362817 DOI:10.1007/s00251-005-0057-2
Raghunathan A., Sivakamasundari R., Wolenski J., Poddar R., Weissman S.M. (2001). Functional analysis of B144/LST1: a gene in the tumor necrosis factor cluster that induces formation of long filopodia in eukaryotic cells. Exp. Cell Res. 268: 230—244. PMID 11478849 DOI:10.1006/excr.2001.5290

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14189 (англ.) . Архів оригіналу за 3 червня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O00453 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.