LTBP3

Ідентифікатори

Символи

LTBP3, LTBP-3, LTBP2, STHAG6, pp6425, DASS, latent transforming growth factor beta binding protein 3, GPHYSD3

Зовнішні ІД

OMIM: 602090 MGI: 1101355 HomoloGene: 7405 GeneCards: LTBP3

Пов'язані генетичні захворювання

brachyolmia-amelogenesis imperfecta syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • transforming growth factor beta binding • growth factor binding
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• transforming growth factor beta activation • positive regulation of mesenchymal stem cell proliferation • positive regulation of mesenchymal stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4054


16998

Ensembl


ENSG00000168056


ENSMUSG00000024940

UniProt


Q9NS15


Q61810

RefSeq (мРНК)


NM_001130144 NM_001164266 NM_021070


NM_008520

RefSeq (білок)


NP_001123616 NP_001157738 NP_066548


NP_032546

Локус (UCSC)

Хр. 11: 65.54 – 65.56 Mb

Хр. 19: 5.79 – 5.81 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LTBP3 (англ. Latent transforming growth factor beta binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 303 амінокислот, а молекулярна маса — 139 359^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGPRGAAGG	LAPEMRGAGA	AGLLALLLLL	LLLLLGLGGR	VEGGPAGERG
AGGGGALARE	RFKVVFAPVI	CKRTCLKGQC	RDSCQQGSNM	TLIGENGHST
DTLTGSGFRV	VVCPLPCMNG	GQCSSRNQCL	CPPDFTGRFC	QVPAGGAGGG
TGGSGPGLSR	TGALSTGALP	PLAPEGDSVA	SKHAIYAVQV	IADPPGPGEG
PPAQHAAFLV	PLGPGQISAE	VQAPPPVVNV	RVHHPPEASV	QVHRIESSNA
ESAAPSQHLL	PHPKPSHPRP	PTQKPLGRCF	QDTLPKQPCG	SNPLPGLTKQ
EDCCGSIGTA	WGQSKCHKCP	QLQYTGVQKP	GPVRGEVGAD	CPQGYKRLNS
THCQDINECA	MPGVCRHGDC	LNNPGSYRCV	CPPGHSLGPS	RTQCIADKPE
EKSLCFRLVS	PEHQCQHPLT	TRLTRQLCCC	SVGKAWGARC	QRCPTDGTAA
FKEICPAGKG	YHILTSHQTL	TIQGESDFSL	FLHPDGPPKP	QQLPESPSQA
PPPEDTEEER	GVTTDSPVSE	ERSVQQSHPT	ATTTPARPYP	ELISRPSPPT
MRWFLPDLPP	SRSAVEIAPT	QVTETDECRL	NQNICGHGEC	VPGPPDYSCH
CNPGYRSHPQ	HRYCVDVNEC	EAEPCGPGRG	ICMNTGGSYN	CHCNRGYRLH
VGAGGRSCVD	LNECAKPHLC	GDGGFCINFP	GHYKCNCYPG	YRLKASRPPV
CEDIDECRDP	SSCPDGKCEN	KPGSFKCIAC	QPGYRSQGGG	ACRDVNECAE
GSPCSPGWCE	NLPGSFRCTC	AQGYAPAPDG	RSCLDVDECE	AGDVCDNGIC
SNTPGSFQCQ	CLSGYHLSRD	RSHCEDIDEC	DFPAACIGGD	CINTNGSYRC
LCPQGHRLVG	GRKCQDIDEC	SQDPSLCLPH	GACKNLQGSY	VCVCDEGFTP
TQDQHGCEEV	EQPHHKKECY	LNFDDTVFCD	SVLATNVTQQ	ECCCSLGAGW
GDHCEIYPCP	VYSSAEFHSL	CPDGKGYTQD	NNIVNYGIPA	HRDIDECMLF
GSEICKEGKC	VNTQPGYECY	CKQGFYYDGN	LLECVDVDEC	LDESNCRNGV
CENTRGGYRC	ACTPPAEYSP	AQRQCLSPEE	MDVDECQDPA	ACRPGRCVNL
PGSYRCECRP	PWVPGPSGRD	CQLPESPAER	APERRDVCWS	QRGEDGMCAG
PLAGPALTFD	DCCCRQGRGW	GAQCRPCPPR	GAGSHCPTSQ	SESNSFWDTS
PLLLGKPPRD	EDSSEEDSDE	CRCVSGRCVP	RPGGAVCECP	GGFQLDASRA
RCVDIDECRE	LNQRGLLCKS	ERCVNTSGSF	RCVCKAGFAR	SRPHGACVPQ
RRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Saharinen J., Keski-Oja J. (2000). Specific sequence motif of 8-Cys repeats of TGF-beta binding proteins, LTBPs, creates a hydrophobic interaction surface for binding of small latent TGF-beta. Mol. Biol. Cell. 11: 2691—2704. PMID 10930463 DOI:10.1091/mbc.11.8.2691
Saharinen J., Hyytiainen M., Taipale J., Keski-Oja J. (1999). Latent transforming growth factor-beta binding proteins (LTBPs) --structural extracellular matrix proteins for targeting TGF-beta action. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 99—117. PMID 10743502 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00010-6
Oklu R., Hesketh R. (2000). The latent transforming growth factor beta binding protein (LTBP) family. Biochem. J. 352: 601—610. PMID 11104663 DOI:10.1042/bj3520601
Penttinen C., Saharinen J., Weikkolainen K., Hyytiainen M., Keski-Oja J. (2002). Secretion of human latent TGF-beta-binding protein-3 (LTBP-3) is dependent on co-expression of TGF-beta. J. Cell Sci. 115: 3457—3468. PMID 12154076

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LTBP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6716 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NS15 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.