MAP6

Ідентифікатори

Символи

MAP6, MTAP6, N-STOP, STOP, MAP6-N, microtubule associated protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 601783 MGI: 1201690 HomoloGene: 7850 GeneCards: MAP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • microtubule binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • комплекс Ґольджі • мікротрубочка • цитоскелет • мембрана • аксон • дендрит (нейробіологія) • transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cell projection • Golgi-associated vesicle • cis-Golgi network
Біологічний процес	• lysosome localization • microtubule cytoskeleton organization • dendrite morphogenesis • cytoskeleton-dependent intracellular transport • positive regulation of axonogenesis • regulation of microtubule cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4135


17760

Ensembl


ENSG00000171533


ENSMUSG00000055407

UniProt


Q96JE9


Q7TSJ2

RefSeq (мРНК)


NM_033063 NM_207577


NM_001043355 NM_001048167 NM_010837

RefSeq (білок)


NP_149052 NP_997460


NP_001036820 NP_001041632 NP_034967

Локус (UCSC)

Хр. 11: 75.59 – 75.67 Mb

Хр. 7: 98.92 – 98.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MAP6 (англ. Microtubule associated protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 813 амінокислот, а молекулярна маса — 86 505^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWPCITRAC	CIARFWNQLD	KADIAVPLVF	TKYSEATEHP	GAPPQPPPPQ
QQAQPALAPP	SARAVAIETQ	PAQGELDAVA	RATGPAPGPT	GEREPAAGPG
RSGPGPGLGS	GSTSGPADSV	MRQDYRAWKV	QRPEPSCRPR	SEYQPSDAPF
ERETQYQKDF	RAWPLPRRGD	HPWIPKPVQI	SAASQASAPI	LGAPKRRPQS
QERWPVQAAA	EAREQEAAPG	GAGGLAAGKA	SGADERDTRR	KAGPAWIVRR
AEGLGHEQTP	LPAAQAQVQA	TGPEAGRGRA	AADALNRQIR	EEVASAVSSS
YRNEFRAWTD	IKPVKPIKAK	PQYKPPDDKM	VHETSYSAQF	KGEASKPTTA
DNKVIDRRRI	RSLYSEPFKE	PPKVEKPSVQ	SSKPKKTSAS	HKPTRKAKDK
QAVSGQAAKK	KSAEGPSTTK	PDDKEQSKEM	NNKLAEAKES	LAQPVSDSSK
TQGPVATEPD	KDQGSVVPGL	LKGQGPMVQE	PLKKQGSVVP	GPPKDLGPMI
PLPVKDQDHT	VPEPLKNESP	VISAPVKDQG	PSVPVPPKNQ	SPMVPAKVKD
QGSVVPESLK	DQGPRIPEPV	KNQAPMVPAP	VKDEGPMVSA	SVKDQGPMVS
APVKDQGPIV	PAPVKGEGPI	VPAPVKDEGP	MVSAPIKDQD	PMVPEHPKDE
SAMATAPIKN	QGSMVSEPVK	NQGLVVSGPV	KDQDVVVPEH	AKVHDSAVVA
PVKNQGPVVP	ESVKNQDPIL	PVLVKDQGPT	VLQPPKNQGR	IVPEPLKNQV
PIVPVPLKDQ	DPLVPVPAKD	QGPAVPEPLK	TQGPRDPQLP	TVSPLPRVMI
PTAPHTEYIE	SSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
Letournel F., Bocquet A., Dubas F., Barthelaix A., Eyer J. (2003). Stable tubule only polypeptides (STOP) proteins co-aggregate with spheroid neurofilaments in amyotrophic lateral sclerosis. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 62: 1211—1219. PMID 14692697 DOI:10.1093/jnen/62.12.1211
Lemonidis K., Sanchez-Perez M.C., Chamberlain L.H. (2015). Identification of a novel sequence motif recognized by the ankyrin repeat domain of zDHHC17/13 S-acyltransferases. J. Biol. Chem. 290: 21939—21950. PMID 26198635 DOI:10.1074/jbc.M115.657668

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6868 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96JE9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 квітня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.