MATN1

Ідентифікатори

Символи

MATN1, CMP, CRTM, matrilin 1, cartilage matrix protein, matrilin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 115437 MGI: 106591 HomoloGene: 1783 GeneCards: MATN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding
Клітинна компонента	• extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • міжклітинний простір
Біологічний процес	• extracellular matrix organization • chondrocyte differentiation • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis • regulation of bone mineralization • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4146


17180

Ensembl


ENSG00000162510


ENSMUSG00000040533

UniProt


P21941


P51942

RefSeq (мРНК)


NM_002379


NM_010769

RefSeq (білок)


NP_002370


NP_034899

Локус (UCSC)

Хр. 1: 30.71 – 30.72 Mb

Хр. 4: 130.67 – 130.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MATN1 (англ. Matrilin 1, cartilage matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 496 амінокислот, а молекулярна маса — 53 701^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVLSGTSLM	LCSLLLLLQA	LCSPGLAPQS	RGHLCRTRPT	DLVFVVDSSR
SVRPVEFEKV	KVFLSQVIES	LDVGPNATRV	GMVNYASTVK	QEFSLRAHVS
KAALLQAVRR	IQPLSTGTMT	GLAIQFAITK	AFGDAEGGRS	RSPDISKVVI
VVTDGRPQDS	VQDVSARARA	SGVELFAIGV	GSVDKATLRQ	IASEPQDEHV
DYVESYSVIE	KLSRKFQEAF	CVVSDLCATG	DHDCEQVCIS	SPGSYTCACH
EGFTLNSDGK	TCNVCSGGGG	SSATDLVFLI	DGSKSVRPEN	FELVKKFISQ
IVDTLDVSDK	LAQVGLVQYS	SSVRQEFPLG	RFHTKKDIKA	AVRNMSYMEK
GTMTGAALKY	LIDNSFTVSS	GARPGAQKVG	IVFTDGRSQD	YINDAAKKAK
DLGFKMFAVG	VGNAVEDELR	EIASEPVAEH	YFYTADFKTI	NQIGKKLQKK
ICVEEDPCAC	ESLVKFQAKV	EGLLQALTRK	LEAVSKRLAI	LENTVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6907 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P21941 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.