MAVS

MAVS
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2MS7, 2MS8, 3J6C, 3J6J, 3RC5, 4P4H, 4Z8M, 5JEK

Ідентифікатори
Символи MAVS, CARDIF, IPS-1, IPS1, VISA, mitochondrial antiviral signaling protein
Зовнішні ІД OMIM: 609676 MGI: 2444773 HomoloGene: 17004 GeneCards: MAVS
Онтологія гена
Молекулярна функція

signal transducer activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
CARD domain binding
protein kinase binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
мітохондріальна мембрана
мембрана
peroxisomal membrane
пероксисома
мітохондріальна зовнішня мембрана
мітохондрія

Біологічний процес

positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
positive regulation of protein phosphorylation
positive regulation of interferon-alpha production
процес імунної системи
regulation of peroxisome organization
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
positive regulation of IP-10 production
negative regulation of viral genome replication
defense response to bacterium
positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production
positive regulation of interleukin-8 production
cellular response to exogenous dsRNA
activation of innate immune response
positive regulation of tumor necrosis factor production
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
negative regulation of type I interferon production
вроджений імунітет
GO:0022415 viral process
positive regulation of type I interferon production
GO:0072468 сигнальна трансдукція
RIG-I signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of defense response to virus by host
positive regulation of interferon-beta production
protein deubiquitination
positive regulation of response to cytokine stimulus
defense response to virus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
57506
228607
Ensembl
ENSG00000088888
ENSMUSG00000037523
UniProt
Q7Z434
Q8VCF0
RefSeq (мРНК)
NM_001206491
NM_020746
NM_001385663
NM_001206382
NM_001206383
NM_001206385
NM_144888
RefSeq (білок)
NP_001193420
NP_065797
NP_001193311
NP_001193312
NP_001193314
NP_659137
Локус (UCSC) Хр. 20: 3.85 – 3.88 Mb Хр. 2: 131.08 – 131.09 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MAVS (англ. Mitochondrial antiviral signaling protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 56 528[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPFAEDKTYKYICRNFSNFCNVDVVEILPYLPCLTARDQDRLRATCTLSG
NRDTLWHLFNTLQRRPGWVEYFIAALRGCELVDLADEVASVYQSYQPRTS
DRPPDPLEPPSLPAERPGPPTPAAAHSIPYNSCREKEPSYPMPVQETQAP
ESPGENSEQALQTLSPRAIPRNPDGGPLESSSDLAALSPLTSSGHQEQDT
ELGSTHTAGATSSLTPSRGPVSPSVSFQPLARSTPRASRLPGPTGSVVST
GTSFSSSSPGLASAGAAEGKQGAESDQAEPIICSSGAEAPANSLPSKVPT
TLMPVNTVALKVPANPASVSTVPSKLPTSSKPPGAVPSNALTNPAPSKLP
INSTRAGMVPSKVPTSMVLTKVSASTVPTDGSSRNEETPAAPTPAGATGG
SSAWLDSSSENRGLGSELSKPGVLASQVDSPFSGCFEDLAISASTSLGMG
PCHGPEENEYKSEGTFGIHVAENPSIQLLEGNPGPPADPDGGPRPQADRK
FQEREVPCHRPSPGALWLQVAVTGVLVVTLLVVLYRRRLH

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій, пероксисомах.

Література

  • Seth R.B., Sun L., Ea C.-K., Chen Z.J. (2005). Identification and characterization of MAVS, a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF-kappaB and IRF 3. Cell. 122: 669—682. PMID 16125763 DOI:10.1016/j.cell.2005.08.012
  • Patel M.R., Loo Y.M., Horner S.M., Gale M. Jr., Malik H.S. (2012). Convergent evolution of escape from hepaciviral antagonism in primates. PLoS Biol. 10: E1001282—E1001282. PMID 22427742 DOI:10.1371/journal.pbio.1001282
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Li X.D., Sun L., Seth R.B., Pineda G., Chen Z.J. (2005). Hepatitis C virus protease NS3/4A cleaves mitochondrial antiviral signaling protein off the mitochondria to evade innate immunity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 17717—17722. PMID 16301520 DOI:10.1073/pnas.0508531102
  • Komuro A., Horvath C.M. (2006). RNA- and virus-independent inhibition of antiviral signaling by RNA helicase LGP2. J. Virol. 80: 12332—12342. PMID 17020950 DOI:10.1128/JVI.01325-06
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29233 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q7Z434 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.