MMP28 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MMP28, EPILYSIN, MM28, MMP-25, MMP-28, MMP25, matrix metallopeptidase 28 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608417 MGI: 2153062 HomoloGene: 41559 GeneCards: MMP28 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • протеоліз • negative regulation of macrophage chemotaxis • extracellular matrix organization • collagen catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000278843 ENSG00000271447 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001032278 NM_024302 NM_032950 |
| | NM_080453 NM_172797 NM_001320300 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001027449 NP_077278 NP_116568 NP_116568.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 35.76 – 35.8 Mb | Хр. 11: 83.33 – 83.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MMP28 (англ. Matrix metallopeptidase 28) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 58 939[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVARVGLLLR | | ALQLLLWGHL | | DAQPAERGGQ | | ELRKEAEAFL | | EKYGYLNEQV |
PKAPTSTRFS | | DAIRAFQWVS | | QLPVSGVLDR | | ATLRQMTRPR | | CGVTDTNSYA |
AWAERISDLF | | ARHRTKMRRK | | KRFAKQGNKW | | YKQHLSYRLV | | NWPEHLPEPA |
VRGAVRAAFQ | | LWSNVSALEF | | WEAPATGPAD | | IRLTFFQGDH | | NDGLGNAFDG |
PGGALAHAFL | | PRRGEAHFDQ | | DERWSLSRRR | | GRNLFVVLAH | | EIGHTLGLTH |
SPAPRALMAP | | YYKRLGRDAL | | LSWDDVLAVQ | | SLYGKPLGGS | | VAVQLPGKLF |
TDFETWDSYS | | PQGRRPETQG | | PKYCHSSFDA | | ITVDRQQQLY | | IFKGSHFWEV |
AADGNVSEPR | | PLQERWVGLP | | PNIEAAAVSL | | NDGDFYFFKG | | GRCWRFRGPK |
PVWGLPQLCR | | AGGLPRHPDA | | ALFFPPLRRL | | ILFKGARYYV | | LARGGLQVEP |
YYPRSLQDWG | | GIPEEVSGAL | | PRPDGSIIFF | | RDDRYWRLDQ | | AKLQATTSGR |
WATELPWMGC | | WHANSGSALF |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Marchenko G.N., Strongin A.Y. (2001). MMP-28, a new human matrix metalloproteinase with an unusual cysteine-switch sequence is widely expressed in tumors. Gene. 265: 87—93. PMID 11255011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00360-2
- Lohi J., Wilson C.L., Roby J.D., Parks W.C. (2001). Epilysin, a novel human matrix metalloproteinase (MMP-28) expressed in testis and keratinocytes and in response to injury. J. Biol. Chem. 276: 10134—10144. PMID 11121398 DOI:10.1074/jbc.M001599200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14366 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H239 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |