MTSS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D1K

Ідентифікатори

Символи

MTSS1, MIM, MIMA, MIMB, metastasis suppressor 1, I-BAR domain containing, MTSS I-BAR domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608486 MGI: 2384818 HomoloGene: 8841 GeneCards: MTSS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin monomer binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • actin binding • signaling receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ruffle • endocytic vesicle • actin cytoskeleton • цитоскелет
Біологічний процес	• renal tubule morphogenesis • nephron tubule epithelial cell differentiation • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • cellular response to fluid shear stress • адгезія клітин • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis • microspike assembly • negative regulation of epithelial cell proliferation • plasma membrane organization • actin cytoskeleton organization • glomerulus morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9788


211401

Ensembl


ENSG00000170873


ENSMUSG00000022353

UniProt


O43312


Q8R1S4

RefSeq (мРНК)

NM_001282971 NM_001282974 NM_014751 NM_001363294 NM_001363295
NM_001363296 NM_001363297 NM_001363298 NM_001363299 NM_001363300 NM_001363301 NM_001363302


NM_001146180 NM_144800

RefSeq (білок)

NP_001269900 NP_001269903 NP_055566 NP_001350223 NP_001350224
NP_001350225 NP_001350226 NP_001350227 NP_001350228 NP_001350229 NP_001350230 NP_001350231

NP_001139652 NP_659049 NP_001390427 NP_001390428 NP_001390429
NP_001390430 NP_001390431 NP_001390432 NP_001390433 NP_001390434 NP_001390435 NP_001390436

Локус (UCSC)

Хр. 8: 124.55 – 124.73 Mb

Хр. 15: 58.81 – 58.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MTSS1 (англ. MTSS1, I-BAR domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 755 амінокислот, а молекулярна маса — 82 251^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAVIEKECS	ALGGLFQTII	SDMKGSYPVW	EDFINKAGKL	QSQLRTTVVA
AAAFLDAFQK	VADMATNTRG	GTREIGSALT	RMCMRHRSIE	AKLRQFSSAL
IDCLINPLQE	QMEEWKKVAN	QLDKDHAKEY	KKARQEIKKK	SSDTLKLQKK
AKKGRGDIQP	QLDSALQDVN	DKYLLLEETE	KQAVRKALIE	ERGRFCTFIS
MLRPVIEEEI	SMLGEITHLQ	TISEDLKSLT	MDPHKLPSSS	EQVILDLKGS
DYSWSYQTPP	SSPSTTMSRK	SSVCSSLNSV	NSSDSRSSGS	HSHSPSSHYR
YRSSNLAQQA	PVRLSSVSSH	DSGFISQDAF	QSKSPSPMPP	EAPNQLSNGF
SHYSLSSESH	VGPTGAGLFP	HCLPASRLLP	RVTSVHLPDY	AHYYTIGPGM
FPSSQIPSWK	DWAKPGPYDQ	PLVNTLQRRK	EKREPDPNGG	GPTTASGPPA
AAEEAQRPRS	MTVSAATRPG	EEMEACEELA	LALSRGLQLD	TQRSSRDSLQ
CSSGYSTQTT	TPCCSEDTIP	SQVSDYDYFS	VSGDQEADQQ	EFDKSSTIPR
NSDISQSYRR	MFQAKRPAST	AGLPTTLGPA	MVTPGVATIR	RTPSTKPSVR
RGTIGAGPIP	IKTPVIPVKT	PTVPDLPGVL	PAPPDGPEER	GEHSPESPSV
GEGPQGVTSM	PSSMWSGQAS	VNPPLPGPKP	SIPEEHRQAI	PESEAEDQER
EPPSATVSPG	QIPESDPADL	SPRDTPQGED	MLNAIRRGVK	LKKTTTNDRS
APRFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee Y.-G., Macoska J.A., Korenchuk S., Pienta K.J. (2002). MIM, a potential metastasis suppressor gene in bladder cancer. Neoplasia. 4: 291—294. PMID 12082544 DOI:10.1038/sj.neo.7900231
Woodings J.A., Sharp S.J., Machesky L.M. (2003). MIM-B, a putative metastasis suppressor protein, binds to actin and to protein tyrosine phosphatase delta. Biochem. J. 371: 463—471. PMID 12570871 DOI:10.1042/BJ20021962

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20443 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O43312 (англ.) . Архів оригіналу за 22 лютого 2018. Процитовано 7 вересня 2017.