MYO18B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MYO18B, KFS4, myosin XVIIIB |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607295 MGI: 1921626 HomoloGene: 53435 GeneCards: MYO18B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
шизофренія, депресія клінічна, біполярний афективний розлад, Klippel-Feil anomaly-myopathy-facial dysmorphism syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • actin binding • cytoskeletal motor activity • ATP binding • microtubule motor activity • microtubule binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • unconventional myosin complex • саркомера • клітинне ядро • myosin complex • Z discdkac • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • microtubule-based movement • васкулогенез • in utero embryonic development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b2/PBB_GE_MYO18B_gnf1h07674_at_fs.png/250px-PBB_GE_MYO18B_gnf1h07674_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 25.74 – 26.03 Mb | Хр. 5: 112.84 – 113.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MYO18B (англ. Myosin XVIIIB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 567 амінокислот, а молекулярна маса — 285 185[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAISSRLALW | | EQKIREEDKS | | PPPSSPPPLF | | SVIPGGFIKQ | | LVRGTEKEAK |
EARQRKQLAV | | ASPEREIPEI | | SISQPNSKSS | | SGTRSGSQQI | | SQDDQSSSPG |
SSDILGKESE | | GSRSPDPEQM | | TSINGEKAQE | | LGSSATPTKK | | TVPFKRGVRR |
GDVLLMVAKL | | DPDSAKPEKT | | HPHDAPPCKT | | SPPATDTGKE | | KKGETSRTPC |
GSQASTEILA | | PKAEKTRTGG | | LGDPGQGTVA | | LKKGEEGQSI | | VGKGLGTPKT |
TELKEAEPQG | | KDRQGTRPQA | | QGPGEGVRPG | | KAEKEGAEPT | | NTVEKGNVSK |
DVGSEGKHVR | | PQIPGRKWGG | | FLGRRSKWDG | | PQNKKDKEGV | | LLSKAEKTGE |
PQTQMEKTSQ | | VQGELGDDLR | | MGEKAGELRS | | TTGKAGESWD | | KKEKMGQPQG |
KSGNAGEARS | | QTEKGCEAPK | | EVSTMVESPA | | APGKGGWPGS | | RGQEAEEPCS |
RAGDGAGALE | | TELEGPSQPA | | LEKDAERPRI | | RKENQDGPAP | | QEEGKGGQSR |
DSDQAPEDRW | | YEAEKVWLAQ | | KDGFTLATVL | | KPDEGTADLP | | AGRVRLWIDA |
DKTITEVDEE | | HVHRANPPEL | | DQVEDLASLI | | SVNESSVLNT | | LLQRYKAQLL |
HTCTGPDLIV | | LQPRGPSVPS | | AGKVPKGRRD | | GLPAHIGSMA | | QRAYWALLNQ |
RRDQSIVALG | | RSGAGKTTCC | | EQVLEHLVGM | | AGSVDGRVSV | | EKIRATFTVL |
RAFGSVSMAH | | SRSATRFSMV | | MSLDFNATGR | | ITAAQLQTML | | LEKSRVARQP |
EGESNFLVFS | | QMLAGLDLDL | | RTELNLHQMA | | DSSSFGMGVW | | SKPEDKQKAA |
AAFAQLQGAM | | EMLGISESEQ | | RAVWRVLAAI | | YHLGAAGACK | | VGRKQFMRFE |
WANYAAEALG | | CEYEELNTAT | | FKHHLRQIIQ | | QMTFGPSRWG | | LEDEETSSGL |
KMTGVDCVEG | | MASGLYQELF | | AAVVSLINRS | | FSSHHLSMAS | | IMVVDSPGFQ |
NPRHQGKDRA | | ATFEELCHNY | | AHERLQLLFY | | QRTFVSTLQR | | YQEEGVPVQF |
DLPDPSPGTT | | VAVVDQNPSQ | | VRLPAGGGAQ | | DARGLFWVLD | | EEVHVEGSSD |
SVVLERLCAA | | FEKKGAGTEG | | SSALRTCEQP | | LQCEIFHQLG | | WDPVRYDLTG |
WLHRAKPNLS | | ALDAPQVLHQ | | SKREELRSLF | | QARAKLPPVC | | RAVAGLEGTS |
QQALQRSRMV | | RRTFASSLAA | | VRRKAPCSQI | | KLQMDALTSM | | IKRSRLHFIH |
CLVPNPVVES | | RSGQESPPPP | | QPGRDKPGAG | | GPLALDIPAL | | RVQLAGFHIL |
EALRLHRTGY | | ADHMGLTRFR | | RQFQVLDAPL | | LKKLMSTSEG | | IDERKAVEEL |
LETLDLEKKA | | VAVGHSQVFL | | KAGVISRLEK | | QREKLVSQSI | | VLFQAACKGF |
LSRQEFKKLK | | IRRLAAQCIQ | | KNVAVFLAVK | | DWPWWQLLGS | | LQPLLSATIG |
TEQLRAKEEE | | LTTLRRKLEK | | SEKLRNELRQ | | NTDLLESKIA | | DLTSDLADER |
FKGDVACQVL | | ESERAERLQA | | FREVQELKSK | | HEQVQKKLGD | | VNKQLEEAQQ |
KIQLNDLERN | | PTGGADEWQM | | RFDCAQMENE | | FLRKRLQQCE | | ERLDSELTAR |
KELEQKLGEL | | QSAYDGAKKM | | AHQLKRKCHH | | LTCDLEDTCV | | LLENQQSRNH |
ELEKKQKKFD | | LQLAQALGES | | VFEKGLREKV | | TQENTSVRWE | | LGQLQQQLKQ |
KEQEASQLKQ | | QVEMLQDHKR | | ELLGSPSLGE | | NCVAGLKERL | | WKLESSALEQ |
QKIQSQQENT | | IKQLEQLRQR | | FELEIERMKQ | | MHQKDREDQE | | EELEDVRQSC |
QKRLHQLEMQ | | LEQEYEEKQM | | VLHEKQDLEG | | LIGTLCDQIG | | HRDFDVEKRL |
RRDLRRTHAL | | LSDVQLLLGT | | MEDGKTSVSK | | EELEKVHSQL | | EQSEAKCEEA |
LKTQKVLTAD | | LESMHSELEN | | MTRNKSLVDE | | QLYRLQFEKA | | DLLKRIDEDQ |
DDLNELMQKH | | KDLIAQSAAD | | IGQIQELQLQ | | LEEAKKEKHK | | LQEQLQVAQM |
RIEYLEQSTV | | DRAIVSRQEA | | VICDLENKTE | | FQKVQIKRFE | | VLVIRLRDSL |
IKMGEELSQA | | ATSESQQRES | | SQYYQRRLEE | | LKADMEELVQ | | REAEASRRCM |
ELEKYVEELA | | AVRQTLQTDL | | ETSIRRIADL | | QAALEEVASS | | DSDTESVQTA |
VDCGSSGRKE | | MDNVSILSSQ | | PEGSLQSWLS | | CTLSLATDTM | | RTPSRQSATS |
SRILSPRINE | | EAGDTERTQS | | ALALSRARST | | NVHSKTSGDK | | PVSPHFVRRQ |
KYCHFGDGEV | | LAVQRKSTER | | LEPASSPLAS | | RSTNTSPLSR | | EKLPSPSAAL |
SEFVEGLRRK | | RAQRGQGSTL | | GLEDWPTLPI | | YQTTGASTLR | | RGRAGSDEGN |
LSLRVGAKSP | | LEIEGAAGGL | | LRSTSLKCIS | | SDGVGGTTLL | | PEKSKTQFSS |
CESLLESRPS | | MGRKLSSPTT | | PRDMLLSPTL | | RPRRRCLESS | | VDDAGCPDLG |
KEPLVFQNRQ | | FAHLMEEPLG | | SDPFSWKLPS | | LDYERKTKVD | | FDDFLPAIRK |
PQTPTSLAGS | | AKGGQDGSQR | | SSIHFETEEA | | NRSFLSGIKT | | ILKKSPEPKE |
DPAHLSDSSS | | SSGSIVSFKS | | ADSIKSRPGI | | PRLAGDGGER | | TSPERREPGT |
GRKDDDVASI | | MKKYLQK |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yokota J., Nishioka M., Tani M., Kohno T. (2003). Genetic alterations responsible for metastatic phenotypes of lung cancer cells. Clin. Exp. Metastasis. 20: 189—193. PMID 12741677 DOI:10.1023/A:1022978932215
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MYO18B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18150 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IUG5 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
| Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
| Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
| Незгруповані альфа | |
---|
| Не-альфа | |
---|
|
---|
| Тип 3 | |
---|
| Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
| Тип 5 | |
---|
|
---|
| Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
| Катеніни | |
---|
| Мембранні | |
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Нелюдські | |
---|
|