NELFE |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d3/Protein_RDBP_PDB_1x5p.png/250px-Protein_RDBP_PDB_1x5p.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1X5P, 2BZ2, 2JX2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NELFE, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, negative elongation factor complex member E |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 154040 MGI: 102744 HomoloGene: 134736 GeneCards: NELFE |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • NELF complex • клітинна мембрана • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of viral transcription • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K4 methylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mRNA polyadenylation • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/47/PBB_GE_RDBP_209219_at_fs.png/250px-PBB_GE_RDBP_209219_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000229363 ENSG00000206357 ENSG00000231044 ENSG00000204356 ENSG00000206268
| ENSG00000233801 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001045863 NM_001045864 NM_138580 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001039328 NP_001039329 NP_613046 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 31.95 – 31.96 Mb | Хр. 17: 35.07 – 35.08 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NELFE (англ. Negative elongation factor complex member E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 43 240[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLVIPPGLSE | | EEEALQKKFN | | KLKKKKKALL | | ALKKQSSSST | | TSQGGVKRSL |
SEQPVMDTAT | | ATEQAKQLVK | | SGAISAIKAE | | TKNSGFKRSR | | TLEGKLKDPE |
KGPVPTFQPF | | QRSISADDDL | | QESSRRPQRK | | SLYESFVSSS | | DRLRELGPDG |
EEAEGPGAGD | | GPPRSFDWGY | | EERSGAHSSA | | SPPRSRSRDR | | SHERNRDRDR |
DRERDRDRDR | | DRDRERDRDR | | DRDRDRDRER | | DRDRERDRDR | | DREGPFRRSD |
SFPERRAPRK | | GNTLYVYGED | | MTPTLLRGAF | | SPFGNIIDLS | | MDPPRNCAFV |
TYEKMESADQ | | AVAELNGTQV | | ESVQLKVNIA | | RKQPMLDAAT | | GKSVWGSLAV |
QNSPKGCHRD | | KRTQIVYSDD | | VYKENLVDGF |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Speiser P.W., White P.C. (1989). Structure of the human RD gene: a highly conserved gene in the class III region of the major histocompatibility complex. DNA. 8: 745—751. PMID 2612324 DOI:10.1089/dna.1989.8.745
- Cheng J., Macon K.J., Volanakis J.E. (1993). cDNA cloning and characterization of the protein encoded by RD, a gene located in the class III region of the human major histocompatibility complex. Biochem. J. 294: 589—593. PMID 8373374 DOI:10.1042/bj2940589
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Surowy C.S., Hoganson G., Gosink J., Strunk K., Spritz R.A. (1990). The human RD protein is closely related to nuclear RNA-binding proteins and has been highly conserved. Gene. 90: 299—302. PMID 2119325 DOI:10.1016/0378-1119(90)90194-V
- Yamaguchi Y., Inukai N., Narita T., Wada T., Handa H. (2002). Evidence that negative elongation factor represses transcription elongation through binding to a DRB sensitivity-inducing factor/RNA polymerase II complex and RNA. Mol. Cell. Biol. 22: 2918—2927. PMID 11940650 DOI:10.1128/MCB.22.9.2918-2927.2002
- Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13974 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P18615 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |