NELFE

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X5P, 2BZ2, 2JX2

Ідентифікатори

Символи

NELFE, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, negative elongation factor complex member E

Зовнішні ІД

OMIM: 154040 MGI: 102744 HomoloGene: 134736 GeneCards: NELFE

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • NELF complex • клітинна мембрана • ядерні тільця
Біологічний процес	• negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of viral transcription • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K4 methylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mRNA polyadenylation • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7936


27632

Ensembl

ENSG00000229363 ENSG00000206357 ENSG00000231044 ENSG00000204356 ENSG00000206268
ENSG00000233801


ENSMUSG00000024369

UniProt


P18615


P19426

RefSeq (мРНК)


NM_002904


NM_001045863 NM_001045864 NM_138580

RefSeq (білок)


NP_002895


NP_001039328 NP_001039329 NP_613046

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.95 – 31.96 Mb

Хр. 17: 35.07 – 35.08 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NELFE (англ. Negative elongation factor complex member E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 43 240^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVIPPGLSE	EEEALQKKFN	KLKKKKKALL	ALKKQSSSST	TSQGGVKRSL
SEQPVMDTAT	ATEQAKQLVK	SGAISAIKAE	TKNSGFKRSR	TLEGKLKDPE
KGPVPTFQPF	QRSISADDDL	QESSRRPQRK	SLYESFVSSS	DRLRELGPDG
EEAEGPGAGD	GPPRSFDWGY	EERSGAHSSA	SPPRSRSRDR	SHERNRDRDR
DRERDRDRDR	DRDRERDRDR	DRDRDRDRER	DRDRERDRDR	DREGPFRRSD
SFPERRAPRK	GNTLYVYGED	MTPTLLRGAF	SPFGNIIDLS	MDPPRNCAFV
TYEKMESADQ	AVAELNGTQV	ESVQLKVNIA	RKQPMLDAAT	GKSVWGSLAV
QNSPKGCHRD	KRTQIVYSDD	VYKENLVDGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Speiser P.W., White P.C. (1989). Structure of the human RD gene: a highly conserved gene in the class III region of the major histocompatibility complex. DNA. 8: 745—751. PMID 2612324 DOI:10.1089/dna.1989.8.745
Cheng J., Macon K.J., Volanakis J.E. (1993). cDNA cloning and characterization of the protein encoded by RD, a gene located in the class III region of the human major histocompatibility complex. Biochem. J. 294: 589—593. PMID 8373374 DOI:10.1042/bj2940589
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Surowy C.S., Hoganson G., Gosink J., Strunk K., Spritz R.A. (1990). The human RD protein is closely related to nuclear RNA-binding proteins and has been highly conserved. Gene. 90: 299—302. PMID 2119325 DOI:10.1016/0378-1119(90)90194-V
Yamaguchi Y., Inukai N., Narita T., Wada T., Handa H. (2002). Evidence that negative elongation factor represses transcription elongation through binding to a DRB sensitivity-inducing factor/RNA polymerase II complex and RNA. Mol. Cell. Biol. 22: 2918—2927. PMID 11940650 DOI:10.1128/MCB.22.9.2918-2927.2002
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13974 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P18615 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.