NFRKB |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3U21, 4UF6, 4WLP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NFRKB, INO80G, nuclear factor related to kappaB binding protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 164013 MGI: 2442410 HomoloGene: 4492 GeneCards: NFRKB |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protease binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • Ino80 complex • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • DNA recombination • inflammatory response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/24/PBB_GE_NFRKB_206968_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_NFRKB_206968_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e3/PBB_GE_NFRKB_213028_at_fs.png/250px-PBB_GE_NFRKB_213028_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001137307 NP_006156 NP_001137307.1 |
| NP_766354 NP_001346583 NP_001392026 NP_001392027 NP_001392028
| NP_001392030 NP_001392031 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 129.86 – 129.9 Mb | Хр. 9: 31.3 – 31.33 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NFRKB (англ. Nuclear factor related to kappaB binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 299 амінокислот, а молекулярна маса — 139 001[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSLDHMLTD | | PLELGPCGDG | | HGTRIMEDCL | | LGGTRVSLPE | | DLLEDPEIFF |
DVVSLSTWQE | | VLSDSQREHL | | QQFLPQFPED | | SAEQQNELIL | | ALFSGENFRF |
GNPLHIAQKL | | FRDGHFNPEV | | VKYRQLCFKS | | QYKRYLNSQQ | | QYFHRLLKQI |
LASRSDLLEM | | ARRSGPALPF | | RQKRPSPSRT | | PEEREWRTQQ | | RYLKVLREVK |
EECGDTALSS | | DEEDLSSWLP | | SSPARSPSPA | | VPLRVVPTLS | | TTDMKTADKV |
ELGDSDLKIM | | LKKHHEKRKH | | QPDHPDLLTG | | DLTLNDIMTR | | VNAGRKGSLA |
ALYDLAVLKK | | KVKEKEEKKK | | KKIKTIKSEA | | EDLAEPLSST | | EGVAPLSQAP |
SPLAIPAIKE | | EPLEDLKPCL | | GINEISSSFF | | SLLLEILLLE | | SQASLPMLEE |
RVLDWQSSPA | | SSLNSWFSAA | | PNWAELVLPA | | LQYLAGESRA | | VPSSFSPFVE |
FKEKTQQWKL | | LGQSQDNEKE | | LAALFQLWLE | | TKDQAFCKQE | | NEDSSDATTP |
VPRVRTDYVV | | RPSTGEEKRV | | FQEQERYRYS | | QPHKAFTFRM | | HGFESVVGPV |
KGVFDKETSL | | NKAREHSLLR | | SDRPAYVTIL | | SLVRDAAARL | | PNGEGTRAEI |
CELLKDSQFL | | APDVTSTQVN | | TVVSGALDRL | | HYEKDPCVKY | | DIGRKLWIYL |
HRDRSEEEFE | | RIHQAQAAAA | | KARKALQQKP | | KPPSKVKSSS | | KESSIKVLSS |
GPSEQSQMSL | | SDSSMPPTPV | | TPVTPTTPAL | | PAIPISPPPV | | SAVNKSGPST |
VSEPAKSSSG | | VLLVSSPTMP | | HLGTMLSPAS | | SQTAPSSQAA | | ARVVSHSGSA |
GLSQVRVVAQ | | PSLPAVPQQS | | GGPAQTLPQM | | PAGPQIRVPA | | TATQTKVVPQ |
TVMATVPVKA | | QTTAATVQRP | | GPGQTGLTVT | | SLPATASPVS | | KPATSSPGTS |
APSASTAAVI | | QNVTGQNIIK | | QVAITGQLGV | | KPQTGNSIPL | | TATNFRIQGK |
DVLRLPPSSI | | TTDAKGQTVL | | RITPDMMATL | | AKSQVTTVKL | | TQDLFGTGGN |
TTGKGISATL | | HVTSNPVHAA | | DSPAKASSAS | | APSSTPTGTT | | VVKVTPDLKP |
TEASSSAFRL | | MPALGVSVAD | | QKGKSTVASS | | EAKPAATIRI | | VQGLGVMPPK |
AGQTITVATH | | AKQGASVASG | | SGTVHTSAVS | | LPSMNAAVSK | | TVAVASGAAS |
TPISISTGAP | | TVRQVPVSTT | | VVSTSQAGKL | | PTRITVPLSV | | ISQPMKGKSV |
VTAPIIKGNL | | GANLSGLGRN | | IILTTMPAGT | | KLIAGNKPVS | | FLTAQQLQQL |
QQQGQATQVR | | IQTVPASHLQ | | QGTASGSSKA | | VSTVVVTTAP | | SPKQAPEQQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Adams B.S., Leung K.Y., Hanley E.W., Nabel G.J. (1991). Cloning of R kappa B, a novel DNA-binding protein that recognizes the interleukin-2 receptor alpha chain kappa B site. New Biol. 3: 1063—1073. PMID 1777480
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7802 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6P4R8 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |