NFRKB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3U21, 4UF6, 4WLP

Ідентифікатори

Символи

NFRKB, INO80G, nuclear factor related to kappaB binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 164013 MGI: 2442410 HomoloGene: 4492 GeneCards: NFRKB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protease binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • Ino80 complex • нуклеоплазма
Біологічний процес	• DNA recombination • inflammatory response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4798


235134

Ensembl


ENSG00000170322


ENSMUSG00000042185

UniProt


Q6P4R8


Q6PIJ4

RefSeq (мРНК)


NM_001143835 NM_006165


NM_172766 NM_001359654

RefSeq (білок)


NP_001137307 NP_006156 NP_001137307.1

NP_766354 NP_001346583 NP_001392026 NP_001392027 NP_001392028
NP_001392030 NP_001392031

Локус (UCSC)

Хр. 11: 129.86 – 129.9 Mb

Хр. 9: 31.3 – 31.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFRKB (англ. Nuclear factor related to kappaB binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 299 амінокислот, а молекулярна маса — 139 001^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSLDHMLTD	PLELGPCGDG	HGTRIMEDCL	LGGTRVSLPE	DLLEDPEIFF
DVVSLSTWQE	VLSDSQREHL	QQFLPQFPED	SAEQQNELIL	ALFSGENFRF
GNPLHIAQKL	FRDGHFNPEV	VKYRQLCFKS	QYKRYLNSQQ	QYFHRLLKQI
LASRSDLLEM	ARRSGPALPF	RQKRPSPSRT	PEEREWRTQQ	RYLKVLREVK
EECGDTALSS	DEEDLSSWLP	SSPARSPSPA	VPLRVVPTLS	TTDMKTADKV
ELGDSDLKIM	LKKHHEKRKH	QPDHPDLLTG	DLTLNDIMTR	VNAGRKGSLA
ALYDLAVLKK	KVKEKEEKKK	KKIKTIKSEA	EDLAEPLSST	EGVAPLSQAP
SPLAIPAIKE	EPLEDLKPCL	GINEISSSFF	SLLLEILLLE	SQASLPMLEE
RVLDWQSSPA	SSLNSWFSAA	PNWAELVLPA	LQYLAGESRA	VPSSFSPFVE
FKEKTQQWKL	LGQSQDNEKE	LAALFQLWLE	TKDQAFCKQE	NEDSSDATTP
VPRVRTDYVV	RPSTGEEKRV	FQEQERYRYS	QPHKAFTFRM	HGFESVVGPV
KGVFDKETSL	NKAREHSLLR	SDRPAYVTIL	SLVRDAAARL	PNGEGTRAEI
CELLKDSQFL	APDVTSTQVN	TVVSGALDRL	HYEKDPCVKY	DIGRKLWIYL
HRDRSEEEFE	RIHQAQAAAA	KARKALQQKP	KPPSKVKSSS	KESSIKVLSS
GPSEQSQMSL	SDSSMPPTPV	TPVTPTTPAL	PAIPISPPPV	SAVNKSGPST
VSEPAKSSSG	VLLVSSPTMP	HLGTMLSPAS	SQTAPSSQAA	ARVVSHSGSA
GLSQVRVVAQ	PSLPAVPQQS	GGPAQTLPQM	PAGPQIRVPA	TATQTKVVPQ
TVMATVPVKA	QTTAATVQRP	GPGQTGLTVT	SLPATASPVS	KPATSSPGTS
APSASTAAVI	QNVTGQNIIK	QVAITGQLGV	KPQTGNSIPL	TATNFRIQGK
DVLRLPPSSI	TTDAKGQTVL	RITPDMMATL	AKSQVTTVKL	TQDLFGTGGN
TTGKGISATL	HVTSNPVHAA	DSPAKASSAS	APSSTPTGTT	VVKVTPDLKP
TEASSSAFRL	MPALGVSVAD	QKGKSTVASS	EAKPAATIRI	VQGLGVMPPK
AGQTITVATH	AKQGASVASG	SGTVHTSAVS	LPSMNAAVSK	TVAVASGAAS
TPISISTGAP	TVRQVPVSTT	VVSTSQAGKL	PTRITVPLSV	ISQPMKGKSV
VTAPIIKGNL	GANLSGLGRN	IILTTMPAGT	KLIAGNKPVS	FLTAQQLQQL
QQQGQATQVR	IQTVPASHLQ	QGTASGSSKA	VSTVVVTTAP	SPKQAPEQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Adams B.S., Leung K.Y., Hanley E.W., Nabel G.J. (1991). Cloning of R kappa B, a novel DNA-binding protein that recognizes the interleukin-2 receptor alpha chain kappa B site. New Biol. 3: 1063—1073. PMID 1777480

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7802 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6P4R8 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.