NOD1

NOD1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2B1W, 2DBD, 2NSN, 2NZ7, 4E9M, 4JQW

Ідентифікатори
Символи NOD1, CARD4, CLR7.1, NLRC1, nucleotide binding oligomerization domain containing 1
Зовнішні ІД OMIM: 605980 MGI: 1341839 HomoloGene: 4440 GeneCards: NOD1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• protein homodimerization activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• peptidoglycan binding
• identical protein binding
• cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
• CARD domain binding
• ATP binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• мембрана
• клітинна мембрана
• basolateral plasma membrane
• apical plasma membrane

Біологічний процес

• regulation of apoptotic process
• defense response
• detection of biotic stimulus
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• positive regulation of cell death
• процес імунної системи
• positive regulation of JNK cascade
• positive regulation of xenophagy
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• cellular response to muramyl dipeptide
• JNK cascade
• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation
• positive regulation of nitric-oxide synthase activity
• defense response to bacterium
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• protein complex oligomerization
• detection of bacterium
• positive regulation of interleukin-1 beta production
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• positive regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of tumor necrosis factor production
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• inflammatory response
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• positive regulation of stress-activated MAPK cascade
• GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium
• GO:0097285 апоптоз
• вроджений імунітет
• interleukin-1-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10392
107607
Ensembl
ENSG00000106100
ENSMUSG00000038058
UniProt
Q9Y239
Q8BHB0
RefSeq (мРНК)
NM_006092
NM_001354849
NM_001171007
NM_172729
RefSeq (білок)
NP_006083
NP_001341778
NP_001164478
NP_766317
Локус (UCSC) Хр. 7: 30.42 – 30.48 Mb Хр. 6: 54.9 – 54.95 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NOD1 (англ. Nucleotide binding oligomerization domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 953 амінокислот, а молекулярна маса — 107 691[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEEQGHSEMEIIPSESHPHIQLLKSNRELLVTHIRNTQCLVDNLLKNDYF
SAEDAEIVCACPTQPDKVRKILDLVQSKGEEVSEFFLYLLQQLADAYVDL
RPWLLEIGFSPSLLTQSKVVVNTDPVSRYTQQLRHHLGRDSKFVLCYAQK
EELLLEEIYMDTIMELVGFSNESLGSLNSLACLLDHTTGILNEQGETIFI
LGDAGVGKSMLLQRLQSLWATGRLDAGVKFFFHFRCRMFSCFKESDRLCL
QDLLFKHYCYPERDPEEVFAFLLRFPHVALFTFDGLDELHSDLDLSRVPD
SSCPWEPAHPLVLLANLLSGKLLKGASKLLTARTGIEVPRQFLRKKVLLR
GFSPSHLRAYARRMFPERALQDRLLSQLEANPNLCSLCSVPLFCWIIFRC
FQHFRAAFEGSPQLPDCTMTLTDVFLLVTEVHLNRMQPSSLVQRNTRSPV
ETLHAGRDTLCSLGQVAHRGMEKSLFVFTQEEVQASGLQERDMQLGFLRA
LPELGPGGDQQSYEFFHLTLQAFFTAFFLVLDDRVGTQELLRFFQEWMPP
AGAATTSCYPPFLPFQCLQGSGPAREDLFKNKDHFQFTNLFLCGLLSKAK
QKLLRHLVPAAALRRKRKALWAHLFSSLRGYLKSLPRVQVESFNQVQAMP
TFIWMLRCIYETQSQKVGQLAARGICANYLKLTYCNACSADCSALSFVLH
HFPKRLALDLDNNNLNDYGVRELQPCFSRLTVLRLSVNQITDGGVKVLSE
ELTKYKIVTYLGLYNNQITDVGARYVTKILDECKGLTHLKLGKNKITSEG
GKYLALAVKNSKSISEVGMWGNQVGDEGAKAFAEALRNHPSLTTLSLASN
GISTEGGKSLARALQQNTSLEILWLTQNELNDEVAESLAEMLKVNQTLKH
LWLIQNQITAKGTAQLADALQSNTGITEICLNGNLIKPEEAKVYEDEKRI
ICF

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Inohara N., Ogura Y., Chen F.F., Muto A., Nunez G. (2001). Human Nod1 confers responsiveness to bacterial lipopolysaccharides. J. Biol. Chem. 276: 2551—2554. PMID 11058605 DOI:10.1074/jbc.M009728200
  • Kufer T.A., Kremmer E., Adam A.C., Philpott D.J., Sansonetti P.J. (2008). The pattern-recognition molecule Nod1 is localized at the plasma membrane at sites of bacterial interaction. Cell. Microbiol. 10: 477—486. PMID 17970764 DOI:10.1111/j.1462-5822.2007.01062.x
  • Coussens N.P., Mowers J.C., McDonald C., Nunez G., Ramaswamy S. (2007). Crystal structure of the Nod1 caspase activation and recruitment domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 353: 1—5. PMID 17173864 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.11.122
  • Manon F., Favier A., Nunez G., Simorre J.P., Cusack S. (2007). Solution structure of NOD1 CARD and mutational analysis of its interaction with the CARD of downstream kinase RICK. J. Mol. Biol. 365: 160—174. PMID 17054981 DOI:10.1016/j.jmb.2006.09.067

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16390 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑ UniProt, Q9Y239 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.