NPTX2

Ідентифікатори

Символи

NPTX2, NARP, NP-II, NP2, neuronal pentraxin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600750 MGI: 1858209 HomoloGene: 1892 GeneCards: NPTX2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• extracellular region • компонент клітини • клітинна мембрана • cytoplasmic side of plasma membrane • Філоподія • дендрит (нейробіологія) • growth cone • neuronal cell body • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• associative learning • chemical synaptic transmission • neuron projection development • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4885


53324

Ensembl


ENSG00000106236


ENSMUSG00000059991

UniProt


P47972


O70340

RefSeq (мРНК)


NM_002523


NM_016789

RefSeq (білок)


NP_002514


NP_058069

Локус (UCSC)

Хр. 7: 98.62 – 98.63 Mb

Хр. 5: 144.48 – 144.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NPTX2 (англ. Neuronal pentraxin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 47 042^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLALLAASVA	LAVAAGAQDS	PAPGSRFVCT	ALPPEAVHAG	CPLPAMPMQG
GAQSPEEELR	AAVLQLRETV	VQQKETLGAQ	REAIRELTGK	LARCEGLAGG
KARGAGATGK	DTMGDLPRDP	GHVVEQLSRS	LQTLKDRLES	LEHQLRANVS
NAGLPGDFRE	VLQQRLGELE	RQLLRKVAEL	EDEKSLLHNE	TSAHRQKTES
TLNALLQRVT	ELERGNSAFK	SPDAFKVSLP	LRTNYLYGKI	KKTLPELYAF
TICLWLRSSA	SPGIGTPFSY	AVPGQANEIV	LIEWGNNPIE	LLINDKVAQL
PLFVSDGKWH	HICVTWTTRD	GMWEAFQDGE	KLGTGENLAP	WHPIKPGGVL
ILGQEQDTVG	GRFDATQAFV	GELSQFNIWD	RVLRAQEIVN	IANCSTNMPG
NIIPWVDNNV	DVFGGASKWP	VETCEERLLD	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

Hsu Y.-C., Perin M.S. (1995). Human neuronal pentraxin II (NPTX2): conservation, genomic structure, and chromosomal localization. Genomics. 28: 220—227. PMID 8530029 DOI:10.1006/geno.1995.1134
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kirkpatrick L.L., Matzuk M.M., Dodds D.C., Perin M.S. (2000). Biochemical interactions of the neuronal pentraxins. Neuronal pentraxin (NP) receptor binds to taipoxin and taipoxin-associated calcium-binding protein 49 via NP1 and NP2. J. Biol. Chem. 275: 17786—17792. PMID 10748068 DOI:10.1074/jbc.M002254200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7953 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P47972 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.